Electronic Resource
Interaction of vitamin D, homocystein and dental diseases
| العنوان: | Interaction of vitamin D, homocystein and dental diseases |
|---|---|
| Additional Titles: | Молекулярный докинг и биодоступность S-алкил производных 5-(3-флуорофенил)-, 5(5-бромофуран-2-ил)- и 5-(((3-(пиридин-4-ил)-1H-1,2,4-триазол-5-ил)тио)метил)-4-метил-4H-1,2,4-триазолов in silico методами Молекулярний докінг і біодоступність S-алкіл похідних 5-(3-флуорофеніл)-, 5-(5-бромофуран-2-іл)- та 5-(((3-(піридин-4-іл)-1H-1,2,4-тріазол-5-іл)тіо)метил)-4-метил-4H-1,2,4-тріазолів in silico методами |
| المؤلفون: | Zaporizhzhia State Medical University№ держреєстрації 0118U007143, Karpun, Ye. O.; Zaporizhzhia State Medical University, Ukraine, Karpenko, Yu. V.; Zaporizhzhia State Medical University, Ukraine, Parchenko, M. V.; Zaporizhzhia State Medical University, Ukraine, Bihdan, O. A.; Zaporizhzhia State Medical University, Ukraine |
| المصدر: | Актуальні питання фармацевтичної та медичної науки та практики; № 1 (2020); Current issues in pharmacy and medicine: science and practice; Актуальные вопросы фармацевтической и медицинской науки и практики; 2409-2932; 2306-8094 |
| بيانات النشر: | Запорізький державний медичний університет 2020-03-10 |
| نوع الوثيقة: | Electronic Resource |
| مستخلص: | The 1,2,4-triazole nucleus is resistant to metabolism and is an important pharmacophore; it can increase solubility and improve the pharmacokinetic and pharmacodynamic profile of drugs. Domestic scientists pay much attention to the heterocyclic 1,2,4-triazole system. A two-component system comprising “EC 2.7.13.3 Histidine kinase” and a variable response protein may be crucial for the virulence of some fungal strains, which are often the cause of candidiasis in immunocompromised individuals. Because of the fact, that humans lack this two-component system, it may be a good target for antimicrobials to treat candidiasis.The purpose of the study was to carry out a molecular docking and evaluate the bioavailability of S-alkyl derivatives of 5-(3-fluorophenyl)-, 5-(5-bromofuran-2-yl)- and 5‑((((3-(pyridin-4-yl)-1H-1,2,4-triazole-5-yl)thio)methyl)-4-methyl-4H-1,2,4-triazole nucleus in silico by methods promising as objects of biological properties for inhibitors «EC 2.7.13.3 Histidine kinase».Materials and methods. The synthesis of compounds is carried out according to the well-known method. A virtual screening of compounds was performed using a computer software program PASS. Molecular docking was performed using Autodock 4.2.6. The screening was performed on the crystallographic structure of the enzyme “EC 2.7.13.3 Histidine kinase” (1A0B).Results. Analysis of the results of a computer prediction demonstrates the prospect of finding inhibitors of histidine kinase, cytidine deaminase, STAT transcription factor, alkaline phosphatase, CYP2C9, insulin, nootropic and diuretic action, antituberculous activity in a number of these compounds. Molecular docking has shown a high affinity of the selected compounds to the enzyme “EC 2.7.13.3 Histidine kinase” with the corresponding values. The interaction of the ligand with the active center of the enzyme is quite complex and is mainly provided by van der Waals and π-bonds with water molecules and amino acid residues of the enzyme Ядро 1,2,4-триазола устойчиво к метаболизму и важный фармакофор, может повышать растворимость и улучшать фармакокинетический и фармакодинамический профиль лекарственных препаратов. Отечественные ученые уделяют много внимания гетероциклической системе 1,2,4-триазола. Двухкомпонентная система, включающая «EC 2.7.13.3 Histidine kinase» и белок регулятора переменной реакции, может иметь решающее значение для вирулентности некоторых грибковых штаммов, которые часто являются причиной возникновения кандидоза у людей с ослабленным иммунитетом. Поскольку человеку не хватает этой двухкомпонентной системы, это может быть хорошей мишенью для противомикробных препаратов при лечении кандидоза.Цель работы – провести молекулярный докинг и оценить биодоступность S-алкил производных 5-(3-флуорофенил)-, 5-(5-бромофуран-2-ил)- и 5-(((3-(пиридин-4-ил)-1H-1,2,4-триазол-5-ил)тио)метил)-4-метил-4H-1,2,4-триазольных ядер in silico методами, перспективных в качестве объектов исследований биологических свойств по отношению к ингибитору «EC 2.7.13.3 Histidine kinase».Материалы и методы. Синтез соединений осуществлен по общеизвестной методике. Виртуальный скрининг соединений проведен с помощью компьютерной программы РАSS. Молекулярный докинг выполнили с помощью программы Autodock 4.2.6. Скрининг проведен на кристаллографической структуре фермента «EC 2.7.13.3 Histidine kinase» (1A0B).Результаты. Анализ результатов компьютерного прогноза демонстрирует перспективность поиска ингибиторов гистидин киназы, цитидин дезаминазы, STAT фактора транскрипции, щелочной фосфатазы, CYP2C9, инсулина, ноотропного действия и диуретического, антитуберкулезной активности в ряду данных соединений. Молекулярный докинг показал высокую аффинность избранных соединений к ферменту «EC 2.7.13.3 Histidine kinase» с соответствующими значениями. Взаимодействие лиганда с активным центром фермента достаточно сложное и обеспечено Ван-дер-Ваальсовыми и π-связями с молекулами воды и аминокислотными остатками фермента. Важным мом Ядро 1,2,4-тріазолу – стійке до метаболізму та важливий фармакофор, може підвищувати розчинність і поліпшувати фармакокінетичний і фармакодинамічний профіль лікарських препаратів. Вітчизняні науковці приділяють багато уваги гетероциклічній системі 1,2,4-тріазолу. Двокомпонентна система, що включає «EC 2.7.13.3 Histidine kinase» та білок регулятора змінної реакції, може мати вирішальне значення для вірулентності деяких грибкових штамів, які часто є причиною виникнення кандидозу в людей з ослабленим імунітетом. Оскільки людині бракує цієї двокомпонентної системи, це може бути хорошою мішенню для протимікробних препаратів під час лікування кандидозу.Мета роботи – здійснити молекулярний докінг та оцінити біодоступність S-алкіл похідних 5-(3-флуорофеніл)-, 5-(5-бромофуран-2-іл)- та 5-(((3-(піридин-4-іл)-1H-1,2,4-тріазол-5-іл)тіо)метил)-4-метил-4H-1,2,4-тріазолів in silico методами, що перспективні як об’єкти досліджень біологічних властивостей щодо інгібіторів «EC 2.7.13.3 Histidine kinase».Матеріали та методи. Синтез сполук здійснили за загальновідомою методикою. Віртуальний скринінг сполук виконали за допомогою комп’ютерної програми РАSS. Молекулярний докінг здійснили за допомогою програми Autodock 4.2.6. Скринінг – на кристалографічній структурі ферменту «EC 2.7.13.3 Histidine kinase» (1A0B).Результати. Аналіз результатів комп’ютерного прогнозу показує перспективність пошуку інгібіторів гістидин кінази, цитидиндезамінази, STAT фактора транскрипції, лужної фосфатази, CYP2C9, інсуліну, ноотропної дії та діуретичної, антитуберкульозної активності у ряду цих сполук. Молекулярний докінг показав високу афінність обраних сполук до ферменту «EC 2.7.13.3 Histidine kinase» з відповідними значеннями. Взаємодія ліганду з активним центром ферменту досить складна та забезпечена в основному Ван-дер-Ваальсовими і π-зв’язками з молекулами води та амінокислотними залишками ферменту. Важливим для зв’язку з ферментом є наявність атома Сульфуру в молекулах сполук, які досліджували. Отже |
| مصطلحات الفهرس: | 1,2,4-triazole; molecular docking simulation; virtual screening; bioavailability, 1,2,4-триазол; молекулярный докинг; виртуальный скрининг; биодоступность, 1,2,4-тріазол; молекулярний докінг; віртуальний скринінг; біодоступність, info:eu-repo/semantics/article, info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| URL: | |
| الاتاحة: | Open access content. Open access content Copyright (c) 2021 Current issues in pharmacy and medicine: science and practice Copyright (c) 2021 Актуальные вопросы фармацевтической и медицинской науки и практики Copyright (c) 2021 Актуальні питання фармацевтичної та медичної науки та практики |
| ملاحظة: | application/pdf Актуальні питання фармацевтичної та медичної науки та практики Ukrainian |
| Other Numbers: | UANTU oai:ojs.journals.uran.ua:article/198122 1151003370 |
| المصدر المساهم: | NATIONAL TECH UNIV OF UKRAINE From OAIster®, provided by the OCLC Cooperative. |
| رقم الانضمام: | edsoai.on1151003370 |
| قاعدة البيانات: | OAIster |
| الوصف غير متاح. |