Academic Journal
ارزیابی پنج روش استخراج DNA ژنومی برای کاربردهای مولکولی پایین دست در برگ‌های تازه و هرباریومی Astragalus fridae
| العنوان: | ارزیابی پنج روش استخراج DNA ژنومی برای کاربردهای مولکولی پایین دست در برگ‌های تازه و هرباریومی Astragalus fridae |
|---|---|
| المؤلفون: | زهرا علیدوستی شهرکی, عاطفه امیراحمدی, پریسا فرخ, آرزو رضایی, جواد قاسمیان |
| المصدر: | رستنی‌ها, Vol 24, Iss 2, Pp 89-98 (2023) |
| بيانات النشر: | Agricultural Research, Education and Extension Organization, 2023. |
| سنة النشر: | 2023 |
| المجموعة: | LCC:Botany |
| مصطلحات موضوعية: | بومی, تغییرات آب و هوایی, تهدید, در معرض خطر انقراض, ctab, Botany, QK1-989 |
| الوصف: | حفاظت از ذخایر ژنتیکی جزو حیاتی حفاظت از سرمایه ملی است. از آنجایی که منابع طبیعی توسط عوامل مختلفی از جمله تغییرات آب و هوایی و تغییر کاربری اراضی تهدید می‌شود، بنابراین ایجاد بانک ژن برای حفاظت از گونه‌های در خطر انقراض ضروری به نظر می‌رسد. Astragalus fridae Rech.f. (باقلاییان) گونه بومی خاک‌های گچی استان سمنان است که به دلیل پراکنش محدود و تخریب زیستگاه در حال انقراض می‌باشد. برای اطمینان از بقای این گونه، باید تلاش‌هایی برای استخراج DNA با کیفیت و کمیت بالا انجام شود. به این منظور، پنج روش استخراج ژنوم شامل پروتکل A (CTAB اصلی)، پروتکل B (CTAB بدون بتامرکاپتواتانول)، پروتکل C (CTAB بدون استات آمونیوم)، پروتکل D (روش اصلاح شده موری و تامسون) و پروتکل E (کیت گیاهی GeneAll)، از نظر توانایی آن‌ها در استخراج DNA از برگ‌های تازه و هرباریومی مورد ارزیابی قرار گرفتند. کیفیت و کمیت DNA توسط ژل الکتروفورز و اسپکتروفتومتری بررسی شد و قابلیت استفاده DNA خالص شده توسط PCR ناحیه ITS DNA ریبوزومی هسته‌ای مورد آزمایش قرار گرفت. بالاترین کیفیت ژنوم استخراج شده به پروتکل D با برگ‌های تازه اختصاص یافت. بیشترین غلظت DNA از برگ‌های تازه (پروتکل A) به دست آمد. اگرچه مقدار معقولی از ژنوم با کیفیت قابل قبول توسط پروتکل‌های B و C با برگ‌های خشک استخراج شد ولی منطقه ITS در این نمونه‌ها تکثیر نشد، بنابراین پروتکل‌های B و C برای استخراج ژنوم A. fridae مناسب نبودند. |
| نوع الوثيقة: | article |
| وصف الملف: | electronic resource |
| اللغة: | English Persian |
| تدمد: | 1608-4306 2423-6608 |
| Relation: | https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_128616_aab1127021cc08d04d6aebbfd7e24f5f.pdf; https://doaj.org/toc/1608-4306; https://doaj.org/toc/2423-6608 |
| DOI: | 10.22092/bot.j.iran.2023.360969.1343 |
| URL الوصول: | https://doaj.org/article/20c524e7566c4a24b18faa7f21c7ad17 |
| رقم الانضمام: | edsdoj.20c524e7566c4a24b18faa7f21c7ad17 |
| قاعدة البيانات: | Directory of Open Access Journals |
| تدمد: | 16084306 24236608 |
|---|---|
| DOI: | 10.22092/bot.j.iran.2023.360969.1343 |