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Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos
المؤلفون: Benitez, Carlos Marcelo, Represa, Natacha Soledad, Di Pasquale, Ricardo, Betina Comba, María, Medina, Vanina, Zanardi, María Marta
المصدر: JAIIO, Jornadas Argentinas de Informática; Vol. 10 Núm. 1 (2024): ASAID – Simposio Argentino de Inteligencia Artificial y Ciencia de Datos; 56-59 ; JAIIO, Jornadas Argentinas de Informática; Vol. 10 No. 1 (2024): ASAID – Argentine Symposium on Artificial Intelligence and Big Data; 56-59 ; 2451-7496
بيانات النشر: SADIO Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa
سنة النشر: 2024
المجموعة: Universidad Nacional de La Plata: Portal del Revistas del UNLP
مصطلحات موضوعية: machine learning, receptor histamina RH3, cribado virtual
الوصف: Los antagonistas del receptor de histamina H3 (RH3) emergen como potenciales fármacos para diversos trastornos neurológicos como Alzheimer o Parkinson, además de su reciente evaluación en el cáncer de mama triple negativo. En este contexto, identificar nuevos ligandos antagonistas del RH3 es de gran interés por su amplio espectro de aplicaciones. Este estudio emplea técnicas de machine learning, específicamente, de regresión con el algoritmo Gradient Boosting (XGBoost), para predecir la afinidad de compuestos orgánicos antagonistas por el RH3 (pKi) utilizando descriptores moleculares. Se recopiló una base de datos con 831 compuestos antagonistas con valores de pKi conocidos, a partir de los cuales se generaron representaciones SMILES y se calcularon 1173 descriptores moleculares de baja dimensionalidad. La base se dividió en conjuntos de entrenamiento (665 registros) y testeo (166 registros). Se entrenaron y evaluaron 10 modelos diferentes, aplicando validación cruzada K-fold=5. El modelo más destacado alcanzó un MSE de 0.54 y un MAE de 0.50 en el conjunto de entrenamiento, y un MSE de 0.76 y un MAE de 0.53 en el conjunto de prueba, con un RMSE de 0.72 y 0.87, respectivamente. Este abordaje quimioinformático propone una metodología eficaz para el cribado virtual de potenciales ligandos antagonistas del RH3, acelerando el descubrimiento de nuevos compuestos terapéuticos.
نوع الوثيقة: article in journal/newspaper
وصف الملف: application/pdf
اللغة: Spanish; Castilian
Relation: https://revistas.unlp.edu.ar/JAIIO/article/view/17922/17589; https://revistas.unlp.edu.ar/JAIIO/article/view/17922
الاتاحة: https://revistas.unlp.edu.ar/JAIIO/article/view/17922
Rights: Derechos de autor 2024 Carlos Marcelo Benitez, Natacha Soledad Represa, Ricardo Di Pasquale, María Betina Comba, Vanina Medina, María Marta Zanardi ; https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
رقم الانضمام: edsbas.D4372155
قاعدة البيانات: BASE