Academic Journal
Investigation of the anti-influenza activity of siRNA complexes against the cellular genes FLT4, Nup98, and Nup205 in vitro ; Исследование противогриппозной активности комплексов миРНК против клеточных генов FLT4, Nup98 и Nup205 на модели in vitro
| العنوان: | Investigation of the anti-influenza activity of siRNA complexes against the cellular genes FLT4, Nup98, and Nup205 in vitro ; Исследование противогриппозной активности комплексов миРНК против клеточных генов FLT4, Nup98 и Nup205 на модели in vitro |
|---|---|
| المؤلفون: | E. A. Pashkov, M. O. Korotysheva, A. V. Pak, E. B. Faizuloev, A. V. Sidorov, A. V. Poddubikov, E. P. Bystritskaya, Yu. E. Dronina, V. K. Solntseva, T. A. Zaiceva, E. P. Pashkov, A. S. Bykov, O. A. Svitich, V. V. Zverev, Е. А. Пашков, М. О. Коротышева, А. В. Пак, Е. Б. Файзулоев, А. В. Сидоров, А. В. Поддубиков, Е. П. Быстрицкая, Ю. Е. Дронина, В. К. Солнцева, Т. А. Зайцева, Е. П. Пашков, А. С. Быков, О. А. Свитич, В. В. Зверев |
| المساهمون: | The authors are grateful to the Center for Collective Use of the I.I. Mechnikov Research Institute of Vaccines and Sera., Авторы выражают благодарность центру коллективного пользования НИИВС им И.И. Мечникова. |
| المصدر: | Fine Chemical Technologies; Vol 17, No 2 (2022); 140-151 ; Тонкие химические технологии; Vol 17, No 2 (2022); 140-151 ; 2686-7575 ; 2410-6593 |
| بيانات النشر: | MIREA – Russian Technological University (RTU MIREA). |
| سنة النشر: | 2022 |
| المجموعة: | Fine Chemical Technologies (E-Journal) / Тонкие химические технологии |
| مصطلحات موضوعية: | вирусная РНК, influenza A virus, gene expression, mRNA, small interfering RNA, viral RNA, вирус гриппа А, экспрессия генов, матричная РНК, малые интерферирующие РНК |
| الوصف: | Objectives. Evaluation of changes in the viral activity of influenza A/WSN/33 after complex knockdown of combinations of cellular genes FLT4, Nup98 and Nup205 in human lung cell culture A549. Methods. The work was carried out using the equipment of the Center for Collective Use of the I. Mechnikov Research Institute of Vaccines and Sera, Russia. The authors performed transfection of combinations of small interfering ribonucleic acid (siRNA) complexes that cause simultaneous disruption of the expression of cellular genes FLT4, Nup98, and Nup205. Within three days from the moment of transfection and infection, the supernatant fluid and cell lysate were taken for subsequent viral reproduction intensity determination using the titration method for cytopathic action. The dynamics of changes in the concentration of viral ribonucleic acid (vRNA) was determined by real-time reverse transcription polymerase chain reaction (real-time RT-PCR). The nonparametric Mann–Whitney test was used to calculate statistically significant differences between groups.Results. Using all of the combinations of siRNA complexes, cell viability did not decrease below the threshold level of 70%. In cells treated with complex FLT4.2 + Nup98.1 + Nup205 at the multiplicity of infection (MOI) equal to 0.1, a significant decrease in viral reproduction by 1.5 lg was noted on the first day in relation to nonspecific and viral controls. The use of siRNA complexes at MOI 0.01 resulted in a more pronounced antiviral effect. The viral titer in cells treated with siRNA complexes FLT4.2 + Nup98.1 and Nup98.1 + Nup205 decreased by 1.5 lg on the first day. In cells treated with complexes FLT4.2 + Nup205 and FLT4.2 + Nup98.1 + Nup205, it decreased by 1.8 and 2.0 lg on the first day and by 1.8 and 2.5 lg on the second day, respectively, in relation to nonspecific and viral controls. When conducting real-time RT-PCR, a significant decrease in the concentration of vRNA was noted. At MOI 0.1, a 295, 55, and 63-fold decrease in the viral load was observed with the ... |
| نوع الوثيقة: | article in journal/newspaper |
| وصف الملف: | application/pdf |
| اللغة: | Russian English |
| Relation: | https://www.finechem-mirea.ru/jour/article/view/1822/1834; https://www.finechem-mirea.ru/jour/article/view/1822/1841; https://www.finechem-mirea.ru/jour/article/downloadSuppFile/1822/627; Peteranderl C., Herold S., Schmoldt C. Human Influenza Virus Infections. Semin. Respir. Crit. Care Med. 2016;37(4):487–500. https://doi.org/10.1055/s-0036-1584801; Sellers S.A., Hagan R.S., Hayden F.G., Fischer W.A. 2nd. The hidden burden of influenza: A review of the extrapulmonary complications of influenza infection. Influenza Other Respir. Viruses. 2017;11(5):372–393. https://doi.org/10.1111/irv.12470; Koehler P., Bassetti M., Kochanek M., Shimabukuro-Vornhagen A., Cornely O.A. Intensive care management of influenza-associated pulmonary aspergillosis. Clin. Microbiol. Infect. 2019;25(12):1501–1509. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.04.031; Radzišauskienė D., Vitkauskaitė M., Žvinytė K., Mameniškienė R. Neurological complications of pandemic A(H1N1)2009pdm, postpandemic A(H1N1)v, and seasonal influenza A. Brain Behav. 2021;11(1):e01916. https://doi.org/10.1002/brb3.1916; Kalil A.C., Thomas P.G. Influenza virus-related critical illness: pathophysiology and epidemiology. Crit. Care. 2019;23(1):258. https://doi.org/10.1186/s13054-019-2539-x; Webby R.J., Webster R.G. Emergence of influenza A viruses. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 2001;356(1416):1817–1828. https://doi.org/10.1098/rstb.2001.0997; Kirby B.J., Symonds W.T., Kearney B.P., Mathias A.A. Pharmacokinetic, Pharmacodynamic, and Drug-Interaction Profile of the Hepatitis C Virus NS5B Polymerase Inhibitor Sofosbuvir. Clin. Pharmacokinet. 2015;54(7):677–690. https://doi.org/10.1007/s40262-015-0261-7; Gentile I., Buonomo A.R., Borgia G. Dasabuvir: A Non-Nucleoside Inhibitor of NS5B for the Treatment of Hepatitis C Virus Infection. Rev. Recent Clin. Trials. 2014;9(2):115–123. https://doi.org/10.2174/1574887109666140529222602; Magro P., Zanella I., Pescarolo M., Castelli F., Quiros-Roldan E. Lopinavir/ritonavir: Repurposing an old drug for HIV infection in COVID-19 treatment. Biomed. J. 2021;44(1):43–53. https://doi.org/10.1016/j.bj.2020.11.005; Han J., Perez J., Schafer A., Cheng H., Peet N., Rong L., Manicassamy B. Influenza Virus: Small Molecule Therapeutics and Mechanisms of Antiviral Resistance. Curr. Med. Chem. 2018;25(38):5115–5127. https://doi.org/10.2174/0929867324666170920165926; Castle S.C. Clinical relevance of age-related immune dysfunction. Clin. Infect. Dis. 2000;31(2):578–585. https://doi.org/10.1086/313947; Looi Q.H., Foo J.B., Lim M.T., Le C.F., Show P.L. How far have we reached in development of effective influenza vaccine? Int. Rev. Immunol. 2018;37(5):266–276. https://doi.org/10.1080/08830185.2018.1500570; Pleguezuelos O., James E., Fernandez A., Lopes V., Rosas L.A., Cervantes-Medina A., Cleath J., Edwards K., Neitzey D., Gu W, Hunsberger S., Taubenberger J.K., Stoloff G., Memoli M.J. Efficacy of FLU-v, a broad-spectrum influenza vaccine, in a randomized phase IIb human influenza challenge study. npj Vaccines. 2020;5(1):22. https://doi.org/10.1038/s41541-020-0174-9; Wang F., Chen G., Zhao Y. Biomimetic nanoparticles as universal influenza vaccine. Smart Mater. Med. 2020;1:21–23. https://doi.org/10.1016/j.smaim.2020.03.001; Smith M. Vaccine safety: medical contraindications, myths, and risk communication. Pediatr. Rev. 2015;36(6):227–238. https://doi.org/10.1542/pir.36.6.227; McManus M.T., Sharp P.A. Gene silencing in mammals by small interfering RNAs. Nat. Rev. Genet. 2002;3(10):737–747. https://doi.org/10.1038/nrg908; Пашков Е.А., Файзулоев Е.Б., Свитич О.А., Сергеев О.В., Зверев В.В. Перспектива создания специфических противогриппозных препаратов на основе синтетических малых интерферирующих РНК. Вопросы вирусологии. 2020;65(4):182–190. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-4-182-190; Adams D., Suhr O.B. Patisiran, an investigational RNAi therapeutic for patients with hereditary transthyretinmediated (hATTR) amyloidosis: Results from the phase 3 APOLLO study. Revue Neurologique. 2018;174(S1):S37. https://doi.org/10.1016/j.neurol.2018.01.085; Zhao L., Wang X., Zhang X., Liu X., Zhang Y., Zhang S. Therapeutic strategies for acute intermittent porphyria. Intractable & Rare Diseases Research. 2020;9(4):205–216. https://doi.org/10.5582/irdr.2020.03089; Van der Ree M.H., et al. Miravirsen dosing in chronic hepatitis C patients results in decreased microRNA-122 levels without affecting other microRNAs in plasma. Alimentary Pharmacology & Therapeutics. 2015;43(1):102–113. https://doi.org/10.1111/apt.13432; DeVincenzo J., et al. A randomized, double-blind, placebo-controlled study of an RNAi-based therapy directed against respiratory syncytial virus. Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS). 2010;107(19):8800–8805. https://doi.org/10.1073/pnas.0912186107; Qureshi A., Tantray V.G., Kirmani A.R., Ahangar A.G. A review on current status of antiviral siRNA. Rev. Med. Virol. 2018;28(4):1976. https://doi.org/10.1002/rmv.1976; Lesch M., Luckner M., Meyer M., Weege F., Gravenstein I., Raftery M., Sieben C., Martin-Sancho L., Imai-Matsushima A., Welke R.W., Frise R., Barclay W., Schönrich G., Herrmann A., Meyer T.F., Karlas A. RNAi-based small molecule repositioning reveals clinically approved urea-based kinase inhibitors as broadly active antivirals. PLoS Pathog. 201918;15(3):e1007601. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1007601; Пашков Е.А., Файзулоев Е.Б., Корчевая Е.Р., Ртищев А.А., Черепович Б.С., Сидоров А.В., Поддубиков А.В., Быстрицкая Е.П., Дронина Ю.Е., Быков А.С., Свитич О.А., Зверев В.В. Нокдаун клеточных генов FLT4, Nup98 и Nup205 как супрессор вирусной активности гриппа А/WSN/33 (H1N1) в культуре клеток А549. Тонкие химические технологии. 2021;16(6):476–489. https://doi.org/10.32362/2410-6593-2021-16-6-476-489; Пашков Е.А., Корчевая Е.Р., Файзулоев Е.Б., Пашков Е.П., Зайцева Т.А., Ртищев А.А., Поддубиков А.В., Свитич О.А., Зверев В.В., Создание модели изучения противовирусного действия малых интерферирующих РНК in vitro. Санитарный врач. 2022;1. https://doi.org/10.33920/med-08-2201-07; Lee H.K, Loh T.P., Lee C.K., Tang J.W., Chiu L., Koay E.S. A universal influenza A and B duplex real-time RT-PCR assay. J. Med. Virol. 2012;84(10):1646–1651. https://doi.org/10.1002/jmv.23375; Ramakrishnan M.A. Determination of 50% endpoint titer using a simple formula. World J. Virol. 2016;5(2):85–86. https://doi.org/10.5501/wjv.v5.i2.85; Estrin M.A., Hussein I.T.M., Puryear W.B., Kuan A.C., Artim S.C., Runstadler J.A. Host-directed combinatorial RNAi improves inhibition of diverse strains of influenza A virus in human respiratory epithelial cells. PLoS One. 2018;13(5):e0197246. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0197246; Piasecka J., Lenartowicz E., Soszynska-Jozwiak M., Szutkowska B., Kierzek R., Kierzek E. RNA Secondary Structure Motifs of the Influenza A Virus as Targets for siRNA-Mediated RNA Interference. Mol. Ther. Nucleic Acids. 2020;19:627–642. https://doi.org/10.1016/j.omtn.2019.12.018; https://www.finechem-mirea.ru/jour/article/view/1822 |
| DOI: | 10.32362/2410-6593-2022-17-2-140-151 |
| الاتاحة: | https://www.finechem-mirea.ru/jour/article/view/1822 https://doi.org/10.32362/2410-6593-2022-17-2-140-151 |
| Rights: | Authors who wish to publish their work in this journal agree to the following terms:Authors retain the copyright and grant the journal the right of first publication in print and online. The is distributed licensed under the Creative Commons Attribution License, which allows others to share the work with an acknowledgment of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with a proper acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).LICENSE AGREEMENT (public offer)In accordance with Article 437 of the Civil Code of the Russian Federation, this document is publicly available, which is addressed to an indefinite circle of adults and capable individuals.Terms and DefinitionsA public offer – compliance with all essential conditions – this is a proposal from which the will of the person is seen, the division of the proposal, the conclusion of an agreement on the proposal of conditions with anyone who responds.The work – the creative work created by the Author (Authors) – an article/paper.Publisher – the publisher of the Tonkie Khimicheskie Tekhnologii [Fine Chemical Technologies] journal – MIREA – Russian Technological University (RTU MIREA). Address: 78, Vernadskogo pr., Moscow, 119454 Russian Federation. Phone: +7 499 215-65-65.License Agreement is an agreement under which the right to use the results of intellectual property is provided (copyright articles).Website – the website of the Tonkie Khimicheskie Tekhnologii [Fine Chemical Technologies] journal (hereinafter – the Journal) https://www.finechem-mirea.ruConsent – Consent with the actor, expressed in the download. In accordance with the provisions of the License Agreement, and also taking into account the equitable conclusion of this Agreement in the conditions set forth in it. The written form of this Agreement must be sent to the Publisher's address.License Terms1. Accepting the terms of this License Agreement, the Author of the article (hereinafter referred to as Article / Work) guarantees the Publisher that:1.1. He is the Author and copyright holder of the Article; the Article is original, is not restrain borrowings that violate the rights of other authors, and has not been previously submitted to other publishers and will not be transferred to other persons, including publishers, mass media, etc. for reproduction, publication, and distribution.1.2. The content of the Article does not violate the legislation of the Russian Federation, does not contain offensive information that contradicts moral principles and generally accepted values;1.3. The content of the Article does not violate the rights of third parties.2. The copyright for the articles uploaded to the Website is the property of the authors of corresponding articles.3. Accepting the terms of this License Agreement, the Author grants the Publisher the right to publish its Article.4. Accepting the terms of this License Agreement, the Author grants the Publisher public rights (non-exclusive license) to use the Article via manners stipulated by the civil legislation of the Russian Federation, including:publication of the Article in the Tonkie Khimicheskie Tekhnologii [Fine Chemical Technologies] journal in print and online;distribution by sale of copies of the Article by any development and in any form;public testimony in any form, during the events of the Publisher;import of original or copies produced for distribution;hire of the original or copy of works;public performance of works (radio, television and technical equipment);processing by any existing products (the creation of any independent work, including the translation into another language);the message of public researches, including the message on air;arguments to all publicly available information (in any form and on the Internet);5. The Author grants the public right the use of works licensed in all countries of the world.6. The Author of the Article agrees that the Publisher as a result of the processing of the Article may create any other independent works, including, but not limited to, any books, magazines, collections, encyclopedias, etc., as well as audiovisual works, animation, advertising, promotional, image, informational and promotional videos and clips, as well as other results of intellectual activity and means of individualization and materials. At the same time, the Publisher will have the exclusive right in full to new results of intellectual activity and means of individualization, including the right to multiple (unlimited) use in full and / or partially (fragmentary) and multiple (unlimited) disposal on a paid and / or free basis intellectual activity and means of individualization without limitation of the territory and term at its discretion by any existing or which may arise in the future, do not contradict the legislation of the Russian Federation.7. The author grants the Publisher the right to conclude sublicensing agreements / agreements with third parties on paid or non-reimbursable terms within the limits of the rights granted to the Publisher in accordance with this License Agreement. At the same time, the Publisher has the right to independently determine the cost of sublicenses and not provide the author of the Article with reports on the use of the Article and the concluded sublicense agreements / agreements.8. The term of a non-exclusive license, which grants the Publisher the right to use the Articles of the author, is the term of the exclusive right of the author to the Article from the moment the Article is downloaded to the Website.9. When uploading Articles to the Website, the authors automatically give their consent to use their own name and the Articles uploaded to the Website for the Publisher's statutory purposes, as well as consent to the use of the Articles in the manner provided for in this License Agreement.10. Uploading an Article to the Website confirms that the author understands all the terms of this License Agreement, he is aware of the legal consequences of non-compliance with the terms of this License Agreement, agrees with the terms of this License Agreement, and also understands and agrees with the scope of the non-exclusive rights transferred to the Publisher in accordance with this License Agreement. ; Авторы, публикующие работы в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет третьим лицам распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся неэксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).ЛИЦЕНЗИОННОЕ СОГЛАШЕНИЕ (публичная оферта)В соответствии со статьей 437 Гражданского Кодекса Российской Федерации данный документ является публичной офертой, который адресован неопределенному кругу совершеннолетних и дееспособных физических лиц.Термины и определенияПубличная оферта – содержащее все существенные условия соглашения предложение, из которого усматривается воля лица, делающего предложение, заключить соглашение на указанных в предложении условиях с любым, кто отзовется. Произведение – созданное творческим трудом физического лица (автора) произведение – Статья.Издатель – ФГБОУ ВО "МИРЭА – Российский технологический университет" (РТУ МИРЭА). Адрес: 119454, РФ, Москва, проспект Вернадского, 78. РТУ МИРЭА. Телефон: +7 499 215-65-65.Лицензионное соглашение – соглашение, в соответствии с которым обладатель исключительного права на результат интеллектуальной деятельности (автор статьи) предоставляет другой стороне (Издателю) право использования такого результата в предусмотренных соглашением пределах.Сайт – сайт журнала Издателя в сети Интернет https://www.finechem-mirea.ruАкцепт – конклюдентное действие физического лица, выражающееся в загрузке Статьи на Сайт и подтверждающее полное и безоговорочное принятие условий настоящего Лицензионного соглашения, а также считающееся равносильным заключению настоящего соглашения на изложенных в нём условиях. Письменная форма настоящего договора за подписью всех авторов должна быть отправлена почтовым отправлением на адрес Издателя журнала. Условия лицензионного соглашения1. Загружая Статью на Сайт, и тем самым акцептуя условия настоящего Лицензионного соглашения, автор статьи (далее Статья / Произведение) гарантирует Издателю, что:1.1. он является автором и правообладателем Статьи; Статья является оригинальной, не сдержит заимствований, нарушающих права иных авторов, а равно не передавалась ранее и не будет передана другим лицам, включая издателей, средства массовой информации и др. для воспроизведения, обнародования и распространения.1.2. содержание статьи не нарушает законодательство Российской Федерации, не содержит оскорбительной информации, а также информации, противоречащей нравственным началам и общепризнанным ценностям;1.3. содержание Статьи не нарушает права третьих лиц.2. Авторское право на Статьи, загруженные на Сайт, сохраняется за авторами соответствующих Статей.3. Акцептуя условия настоящего Лицензионного соглашения, автор предоставляет Издателю право на обнародование своей Статьи.4. Акцептуя условия настоящего Лицензионного соглашения, автор предоставляет Издателю право (неисключительную лицензию) на использование Издателем Статьи способами, предусмотренными гражданским законодательством Российской Федерации, в том числе:воспроизведение, включая, но не ограничиваясь, путём размещения Статьи в журнале «Тонкие химические технологии = Fine Chemical Technologies» (далее – Журнал) в печатном и электронном виде, а также в иных изданиях Издателя;распространение путём продажи экземпляров Статьи любыми способами и в любых формах;публичный показ в любых формах, в том числе, но не ограничиваясь, во время проведения мероприятий Издателя;импорт оригинала или экземпляров Произведения в целях распространения;прокат оригинала или экземпляра Произведения;публичное исполнение Произведения (представление произведения в живом исполнении или с помощью технических средств (радио, телевидения и иных технических средств);переработка любыми существующими способами (в том числе любое редактирование, перевод на другой язык, наложение графического или музыкального оформления, создание любых самостоятельных произведений);сообщение общественности любыми способами, включая сообщение в эфир, сообщение по кабелю;доведение до всеобщего сведения (в любой форме и любым способом по сети Интернет), включая социальные сети и все сайты Издателя).5. Автор предоставляет Издателю право использовать Произведение способами, предусмотренными настоящим Лицензионным соглашением на территории всех стран мира.6. Автор Статьи соглашается с тем, что Издателем в результате переработки Статьи могут быть созданы любые иные самостоятельные произведения, включая, но не ограничиваясь, любые книги, журналы, сборники, энциклопедии, и т.п., а также аудиовизуальные произведения, анимационные, рекламные, промо-, имиджевые, информационные и анонсирующие ролики и клипы, а также иные результаты интеллектуальной деятельности и средства индивидуализации и материалы. При этом Издатель будет обладать исключительным правом в полном объёме на новые результаты интеллектуальной деятельности и средства индивидуализации, включая право на многократное (неограниченное) использование полностью и/или частично (фрагментарно) и многократное (неограниченное) распоряжение на возмездной и/или безвозмездной основе новыми результатами интеллектуальной деятельности и средствами индивидуализации без ограничения территории и срока по своему усмотрению любыми существующими или могущими возникнуть в будущем способами, не противоречащими законодательству Российской Федерации.7. Автор предоставляет Издателю право заключать с третьими лицами сублицензионные договоры/соглашения на возмездных или безвозмездных условиях в пределах тех прав, которые предоставлены Издателю в соответствии настоящим Лицензионным соглашением. При этом Издатель вправе самостоятельно определять стоимость сублицензий и не предоставлять автору Статьи отчёты об использовании Статьи и заключённых сублицензионных договорах/соглашениях.8. Срок неисключительной лицензии, которая предоставляет Издателю право использовать Статью автора, – срок действия исключительного права автора на Статью с момента загрузки Статьи на Сайт.9. Загружая Статьи на Сайт, авторы автоматически дают свое согласие на использование своего имени и загруженных на Сайт Статей в уставных целях Издателя, а также согласие на использование Статей способами, предусмотренными настоящим Лицензионным соглашением.10. Загрузка Статьи на Сайт подтверждает, что автору понятны все условия настоящего Лицензионного соглашения, он осознаёт правовые последствия неисполнения условий настоящего Лицензионного соглашения, согласен с условиями настоящего Лицензионного соглашения, а также понимает и согласен с объёмом неисключительных прав, передаваемых Издателю в соответствии с настоящим Лицензионным соглашением. |
| رقم الانضمام: | edsbas.8CB6D8F3 |
| قاعدة البيانات: | BASE |
| DOI: | 10.32362/2410-6593-2022-17-2-140-151 |
|---|