| الوصف: |
Galvenais visu D vitamīna metabolītu saistīšanas vai transportēšanas proteīns ir GC gēns. GC gēna ģenētiskās variācijas ir saistītas ar dažādām autoimūnām slimībām, kā 1. tipa cukura diabētu (1TCD) dažādās populācijas. GC gēna polimorfismi rs4588 un rs7041 tiek pētīti kā potenciāli 1. tipa cukura diabēta ietekmējoši faktori. Šī pētījuma mērķis bija analizēt GC gēna viena nukleotīda polimorfisma (SNP; single nucleotide polymorphism) rs4588 A>C un rs7041 T>G asociāciju ar 1. tipa cukura diabētu Latvijas populācijā. Lai noskaidrotu šo abu polimorfismu potenciālo ietekmi uz saslimšanas iespējamību, tika genotipēti 185 1. tipa cukura diabēta slimnieku DNS paraugi un 253 kontroles grupas paraugi, izmantojot restrikcijas fragmentu garumu polimorfisma metodi. Statistiskās analīzes rezultātā tika konstatēts, ka biežas alēles C (rs4588) un G (rs7041), kā arī homozigota GG (rs7041), ir statistiski nozīmīgas saistībā ar 1TCD attīstības risku Latvijas populācijā (C (rs4588): p = 2,87 x10-2; ORA = 1,37, CI 95% [1,03 – 1,82], G (rs7041): p = 2,59 x10-2; ORA = 1,45, CI 95% [0,85 – 2,08]). Haplotipu analīzes rezultātā tika noskaidrots, ka T-A un G-A ir iespējami 1TCD risku samazinoši faktori, un T-C kā iespējams slimības risku palielinošs. Statistiskās analīzes rezultātā tika konstatēts, ka biežo alēļu divu lokusu genotips GG-CC būtiski palielina slimības risku ar augstu statistisko nozīmīgumu, toties rets divu lokusu GG-TT genotips tika identificēts kā ļoti nozīmīgs iespējams molekulārais marķieris, kas pēc izteikti zemās OR vērtības ievērojami samazina 1TCD risku. Lai uzzinātu vairāk par polimorfismu funkcionālo nozīmi, tika izmantota bioinformātiskā analīze, kuras rezultātā tika noskaidrots, ka abu polimorfismu alēļu nomaiņa spēj ietekmēt transkripcijas faktoru piesaisti, DNS liekšanās spēju, kā arī rs7041 alternatīvās alēles rada atšķirīgas DNS sekundārās struktūras. Apkopojot visus rezultātus, tika secināts, ka GC gēna polimorfismi spēj ietekmēt 1. tipa cukura diabētu saslimšanas risku un, ka tie varētu kļūt par ... |