Dissertation/ Thesis

Viral quasispecies dynamics in the design and efficacy of antiviral strategies ; Dinámica de cuasiespecies virales en el diseño y eficacia de estrategias antivirales

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: Viral quasispecies dynamics in the design and efficacy of antiviral strategies ; Dinámica de cuasiespecies virales en el diseño y eficacia de estrategias antivirales
المؤلفون: García Crespo, Carlos
المساهمون: Perales Viejo, Celia, Gastaminza Landart, Pablo, UAM. Departamento de Biología Molecular, Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBM), López Bueno, Alberto
سنة النشر: 2024
المجموعة: Universidad Autónoma de Madrid (UAM): Biblos-e Archivo
مصطلحات موضوعية: Biología y Biomedicina / Biología
الوصف: Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 15-03-2024 ; Las poblaciones de virus RNA son reservorios de mutantes en continuo cambio. Esta estructura poblacional, denominada cuasiespecies viral, tiene múltiples implicaciones en la relación virus-hospedador, en la respuesta a antivirales y en el diseño de estrategias antivíricas, entre ellas, la mutagénesis letal. Cómo la dinámica de la cuasiespecie puede afectar la eficacia de los antivirales solo se comprende parcialmente. En la presente Tesis Doctoral, hemos analizado la dinámica de cuasiespecies del virus de la hepatitis C en células de hepatoma humano. Hemos observado un aumento en el número de mutaciones y variaciones en su frecuencia (que hemos denominado 'ondas mutacionales') tras pases del virus en células Huh-7.5. Estas ondas mutacionales fueron más prominentes en los virus de alta capacidad replicativa, o en presencia de mutágenos letales. Por lo tanto, la adaptación del virus de la hepatitis C a un entorno celular sin perturbaciones externas resultó en una ampliación del espectro de mutantes en lugar de una convergencia hacia un número limitado de secuencias genómicas. Esta inestabilidad de las poblaciones virales tiene implicaciones en el diseño computacional de vacunas universales, anticuerpos terapéuticos y agentes antivirales pan-genómicos, que generalmente se basa en la identificación de regiones genómicas y proteicas conservadas. Estos procedimientos no tienen en cuenta la variación de residuos determinada a partir de análisis de cuasiespecies. Hemos demostrado que la conservación en los espectros de mutantes de poblaciones de cultivo celular del virus de la hepatitis C (y también de pacientes infectados) no coincide con la conservación basada ni en secuencias consenso de las mismas poblaciones, ni en las secuencias de bases de datos. Se han obtenido resultados similares con los espectros de mutantes de SARS-CoV-2 de pacientes con COVID-19. Por lo ...
نوع الوثيقة: doctoral or postdoctoral thesis
وصف الملف: application/pdf
اللغة: English
Relation: http://hdl.handle.net/10486/713838
الاتاحة: http://hdl.handle.net/10486/713838
Rights: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ ; Reconocimiento – NoComercial – SinObraDerivada ; openAccess
رقم الانضمام: edsbas.184CE35E
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