Филогенетическое положение Phlojodicarpus villosus (Apiaceae) на основе анализа последовательностей ITS и trnH-psbA
| العنوان: | Филогенетическое положение Phlojodicarpus villosus (Apiaceae) на основе анализа последовательностей ITS и trnH-psbA |
|---|---|
| المؤلفون: | Olga Valuyskikh, Dmitry Shadrin |
| المصدر: | Turczaninowia; Том 24 № 4 (2021): Turczaninowia; 12-22 Turczaninowia; Vol 24 No 4 (2021): Turczaninowia; 12-22 |
| بيانات النشر: | Altai State University, 2021. |
| سنة النشر: | 2021 |
| مصطلحات موضوعية: | Ecology, Phlojodicarpus, вздутоплодник, гербарные коллекции, Республика Коми, herbarium collections, Plant Science, Ural, Red Data Book, plant genetic diversity, Урал, генетическое разнообразие растений, DNA barcoding, ДНК-штрихкодирование, Красная книга, ITS, Komi Republic, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics |
| الوصف: | The aim of our work was to obtain chloroplast (trnH-psbA) and nuclear (ITS1-ITS2) DNA nucleotide sequences and identify the phylogenetic position of Phlojodicarpus villosus (Apiaceae). This species of vascular plants is represented in the Urals by isolated relic populations and is included in the regional Red Data Books. There is no data on P. villosus nucleotide sequences in the international open genetic databases. We studied two herbarium specimens of P.villosus, one collected from the Ural part of its range in the Komi Republic (Northern Urals) and the second collected from the main part of its range in the Magadan Region (Kolyma Highlands). Combining nuclear and chloroplast markers made it possible to reliably determine phylogenetic position of P. villosus within the tribe Selineae (subfamily Apioideae, family Apiaceae). We found ITS1-ITS2 and trnH-psbA nucleotide sequences to be sufficiently informative to identify specimens of this genus. High polymorphism of P. villosus sequences obtained from different parts of its range (Northern Urals and Kolyma Highlands) and the presence of evolutionary events (deletions) require more detail study of P. villosus and other Phlojodicarpus taxa by DNA barcoding methods. В международных открытых генетических базах данных отсутствуют сведения о нуклеотидных последовательностях для Phlojodicarpus villosus. Этот вид сосудистых растений представлен на Урале изолированными реликтовыми популяциями и включен в региональные Красные книги. Совместное применение ядерного и хлоропластного маркеров позволило надежно определить филогенетическое положение P. villosus в пределах трибы Selineae (подсемейство Apioideae, семейство Apiaceae). Установлено, что нуклеотидные последовательности ITS1-ITS2 и trnH-psbA достаточно информативны для того, чтобы идентифицировать представителей данного рода. Высокий полиморфизм полученных последовательностей P. villosus из разных частей ареала (Северный Урал и Колымское нагорье) и наличие эволюционных событий (делеции) оправдывает более пристальное изучение P. villosus и других таксонов рода Phlojodicarpus с использованием молекулярно-генетических методов. |
| وصف الملف: | application/pdf |
| اللغة: | Russian |
| تدمد: | 1560-7259 1560-7267 |
| URL الوصول: | https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::5d15b84cb67bf69506b12da83c95bd15 http://turczaninowia.asu.ru/article/view/10767 |
| Rights: | OPEN |
| رقم الانضمام: | edsair.doi.dedup.....5d15b84cb67bf69506b12da83c95bd15 |
| قاعدة البيانات: | OpenAIRE |
| تدمد: | 15607259 15607267 |
|---|