Sea Urchin Pigments as Potential Therapeutic Agents Against the Spike Protein of SARS-CoV-2 Based on in Silico Analysis
| العنوان: | Sea Urchin Pigments as Potential Therapeutic Agents Against the Spike Protein of SARS-CoV-2 Based on in Silico Analysis |
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| المؤلفون: | Ayelén, Barbieri, AgustÃn, Elena Susana, Jimena PÃa, Gázquez, Rubilar, Lucas, Mercedes, Vera-Piombo, Florencia, Tamara, Sepulveda, Chaar, Gittardi, Erina NoÃ, Seiler, Marisa, Avaro, Fernandez |
| المصدر: | CONICET Digital (CONICET) Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas instacron:CONICET |
| بيانات النشر: | American Chemical Society (ACS), 2020. |
| سنة النشر: | 2020 |
| مصطلحات موضوعية: | 0301 basic medicine, antiviral drug, medicine.drug_class, viruses, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), In silico, 030106 microbiology, Echinochrome A, Spinochromes, medicine.disease_cause, Ciencias Biológicas, purl.org/becyt/ford/1 [https], 03 medical and health sciences, Pigment, biology.animal, medicine, purl.org/becyt/ford/1.6 [https], Receptor, Sea urchin, Coronavirus, biology, 2019 PANDEMIC, Chemistry, 1,4-naphtoquinones polihydroxilate, COVID-19, 030104 developmental biology, Biochemistry, Docking (molecular), visual_art, visual_art.visual_art_medium, Antiviral drug, Virología, CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS |
| الوصف: | Several studies have been published regarding the interaction between the spike protein of the novel coronavirus SARS-CoV-2 and ACE2 receptor in the host cells. In the presente work, we evaluated the in silico properties of two sea urchin pigments, Echinochrome A (EchA) and Spinochromes (SpinA) against the Spike protein (S) towards finding a potential therapeutic drug against the disease caused by the novel coronavirus (COVID-19). The best ensemble docking pose of EchaA and SpinA showed a binding affinity of -5.9 and -6.7 kcal mol-1, respectively. The linked aminoacids (T505, G496 and Y449 for EchA and Y449, Q493 and G496 for SpinA) are in positions involved in ACE2 binding in both RBDs frim SARS-CoV and SARS-CoV-2 suggesting that EchA and SpinA may interact with Spike proteins drom both viruses. The results suggest that these pigments could act as inhibitors of S protein, pointing them as antiviral drugs for SARS-CoV-2. Fil: Barbieri, Elena Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina Fil: Rubilar Panasiuk, Cynthia Tamara. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina Fil: Gázquez, Ayelén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina Fil: Avaro, Marisa. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina Fil: Seiler, Erina Noé. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina Fil: Vera Piombo, Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina Fil: Gittardi Calderón, Agustín Adolfo. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina Fil: Chaar, Florencia. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina Fil: Fernandez, Jimena Pía. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina Fil: Sepúlveda, Lucas Roberto. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina |
| وصف الملف: | application/pdf |
| DOI: | 10.26434/chemrxiv.12568595.v1 |
| URL الوصول: | https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::354ad77611cd5e71fb4b5a39015c44c6 https://doi.org/10.26434/chemrxiv.12568595.v1 |
| Rights: | OPEN |
| رقم الانضمام: | edsair.doi.dedup.....354ad77611cd5e71fb4b5a39015c44c6 |
| قاعدة البيانات: | OpenAIRE |
| DOI: | 10.26434/chemrxiv.12568595.v1 |
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