Porast proizvodnje goriva, maziva i ostalih energenata zbog povećane potrebe za energentima, doprinosi i porastu prisutnosti otpadnih rafinerijskih spojeva u vodama i okolišu. Zbog dokazane štetnosti, zakonske regulative i očuvanja okoliša, ovi spojevi se moraju ukloniti iz otpadnih voda prije ispuštanja u vodoprijemnike. U ovom radu je opisana biološka obrada rafinerijskih otpadnih voda uz primjenu različitih reaktorskih sustava. U preglednom dijelu je opisana provedba procesa biološke obrade sa suspendiranim i imobiliziranim mikroorganizmima u različitim reaktorima s prikazom utjecaja procesnih parametara na tijek procesa biološke obrade. Prema literaturnim podacima, prisutnost različitih mikroorganizama, ulazno organsko opterećenje (UOO) i hidrauličko vrijeme zadržavanja (Hvz) značajno utječu na učinkovitost procesa biološke obrade. Sukladno tome, primjena pogodnih mikroorganizama i odabir optimalnih uvjeta provedbe procesa u reaktorskim sustavima s imobiliziranim stanicama mikroorganizama omogućuje učinkovito uklanjanje štetnih organskih tvari prisutnih u rafinerijskim otpadnim vodama.