التفاصيل البيبلوغرافية
| العنوان: |
Development of a SYBR Green-based real-time quantitative polymerase chain reaction assay to detect enzootic nasal tumor virus in goats. |
| المؤلفون: |
Rongze He, Yulan Du, Linli Gan, Mohsin, Muhammad Ali, Bao-Xiang He |
| المصدر: |
Canadian Journal of Veterinary Research / Revue Canadienne de Recherche Vétérinaire; Apr2021, Vol. 85 Issue 2, p145-150, 6p |
| مصطلحات موضوعية: |
POLYMERASE chain reaction, PESTE des petits ruminants, ONCOGENIC viruses, NASAL tumors, GOAT diseases, RETROVIRUSES |
| Abstract (English): |
Enzootic nasal adenocarcinoma is a contagious respiratory disease in goats that is caused by the enzootic nasal tumor virus 2 (ENTV-2). In order to increase the number of available detection methods for ENTV-2, we developed a SYBR Green real-time polymerase chain reaction (SGrPCR) assay that targets the gag gene of ENTV-2. The low limit of detection of the assay was 3.68×10¹ copies/μL, a hundredfold more sensitive than conventional PCR. The melt curve showed a single sharp melt peak at 83°C, which indicated that there was no non-specific amplification or primer dimer formation. The intra-assay and inter-assay coefficients of variation were 1.58% and 1.82%, respectively. There was no cross-reactivity with closely related goat viruses (i.e., orf virus, peste des petits ruminants virus, goatpox virus, foot-and-mouth disease virus) and endogenous retroviruses. In conclusion, the SGrPCR assay is specific for the gag gene of ENTV-2 and provides a rapid and sensitive approach for detecting ENTV-2 in clinical samples. [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
| Abstract (French): |
L’adénocarcinome nasal enzootique est une maladie respiratoire contagieuse chez les chèvres qui est causé par le virus de la tumeur nasale enzootique 2 (ENTV-2). Afin d’augmenter le nombre de méthodes de détection disponibles pour ENTV-2, nous avons développé un test de réaction en chaîne par polymérase en temps réel SYBR Green (SGrPCR) qui cible le gène gag de ENTV-2. La limite basse de détection du test était de 3.68×10¹ copies/μL, cent fois plus sensible que la PCR conventionnelle. La courbe de fusion montrait un seul pic de fusion net à 83 °C, ce qui indiquait qu’il n’y avait pas d’amplification non spécifique ou de formation de dimère d’amorce. Les coefficients de variation intra-essai et inter-essai étaient respectivement de 1,58 % et 1,82 %. Il n’y avait pas de réactivité croisée avec les virus caprins étroitement apparentés (c’est-à-dire le virus orf, le virus de la peste des petits ruminants, le virus de la variole caprine, le virus de la fièvre aphteuse) et les rétrovirus endogènes. En conclusion, le test SGrPCR est spécifique du gène gag de l’ENTV-2 et fournit une approche rapide et sensible pour la détection d’ENTV-2 dans des échantillons cliniques. [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
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