Academic Journal

Integrative transcriptome profiling for identifying ALS potential treatment using the drug repurposing approach.

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: Integrative transcriptome profiling for identifying ALS potential treatment using the drug repurposing approach.
المؤلفون: Kashani, Navid1 (AUTHOR), Sabbaghian, Amir2 (AUTHOR), EmamiPari, Fatemeh3 (AUTHOR), Khalili Gorjimahalleh, Mohammad4 (AUTHOR), Aalikhani, Mahdi5 (AUTHOR) aalikhanip@gmail.com
المصدر: Egyptian Journal of Medical Human Genetics. 1/21/2025, Vol. 26 Issue 1, p1-14. 14p.
مصطلحات موضوعية: *MEDICAL sciences, *DRUG repositioning, *MOLECULAR docking, *MUSCULAR atrophy, *SYSTEMS biology, *AMYOTROPHIC lateral sclerosis
Abstract (English): Background: Amyotrophic lateral sclerosis (ALS), an alarming neurodegenerative disorder, induces muscle atrophy and motor deterioration. The current treatments exhibit limited improvement in survival rates. Thus, we here attempted to identify crucial genetic biomarkers through transcriptome profiling and systems biology methodologies to advance our knowledge of the diagnosis and pathogenesis of ALS. Following this, a drug repurposing approach was employed to introduce possible treatments for ALS. Results: After analyzing differentially expressed genes (DEG) using different in silico approaches, 43 DEGs (23 upregulated and 20 downregulated) were identified, which were abnormally expressed in ALS patients compared to healthy individuals. Two proteins CMPK2 and IFI44L were identified as ALS biomarkers and selected for molecular docking. Then, molecular docking was performed to repurpose drugs that have the potential to suppress upregulated proteins. Accordingly, three drugs including ketoprofen, thalitone, and cromolyn have been repurposed against CMPK2 and IFI44L proteins. Conclusions: CMPK2 and IFI44L serve as potential biomarkers for ALS and may be applied in the diagnostic assessment of this disorder within the bloodstream of affected individuals. Furthermore, three drugs were proposed as potential therapeutic candidates for ALS with the help of transcriptomics profiling. We advocate for the implementation of these identified pharmacotherapies in animal models of ALS to validate their therapeutic efficacy. This approach also would help narrow down the options to more suitable targets and economically viable treatments. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
Abstract (Arabic): المقال يركز على تحديد العلاجات المحتملة للتصلب الجانبي الضموري (ALS) من خلال تحليل النسخ المتكامل واتباع نهج إعادة استخدام الأدوية. قام الباحثون بتحليل بيانات تسلسل RNA من مرضى ALS لتحديد 43 جينًا معبرًا عنه بشكل مختلف (DEGs)، حيث تم تسليط الضوء على CMPK2 (كيناز أحادي الفوسفات السيتيدين/اليوريدين 2) وIFI44L (بروتين مستحث بواسطة الإنترفيرون 44 مثل) كعلامات حيوية هامة. اقترحت الدراسة ثلاثة أدوية معاد استخدامها—كيتوبروفين، ثاليتون، وكروماولين—كمرشحين علاجيين محتملين، موضحة قدرتها على تثبيط البروتينات المحددة المرتبطة بـ ALS. يدعو المؤلفون إلى مزيد من التحقق من هذه النتائج من خلال نماذج حيوانية وتجارب سريرية لتقييم فعالية العلاجات المقترحة. [Extracted from the article]
قاعدة البيانات: Academic Search Index
الوصف
تدمد:11108630
DOI:10.1186/s43042-025-00648-0