المؤلفون: Candan Çelik, Pavol Bokes, Abhyudai Singh

المصدر: BMC Bioinformatics, Vol 24, Iss S1, Pp 1-22 (2024)

مصطلحات موضوعية: Stochastic gene expression, Master equation, Stochastic simulation, Computer applications to medicine. Medical informatics, R858-859.7, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1471-2105

URL الوصول: https://doaj.org/article/19368e4472c3462a86c6fe0af636246e

المؤلفون: Burga Ramos, Alejandro Raúl

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Thesis Advisors: Lehner, Ben

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Caenorhabditis elegans, Stochastic gene expression, Genetics, Incomplete penetrance, Redundancy, Robustness, Evolution

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/104484

المؤلفون: Thi Nhu Thao Nguyen, Madge Martin, Christophe Arpin, Samuel Bernard, Olivier Gandrillon, Fabien Crauste

المصدر: ImmunoInformatics, Vol 15, Iss , Pp 100043- (2024)

مصطلحات موضوعية: Gene regulatory networks, Cell population dynamics, CD8 T cell immune response, Stochastic gene expression, Multiscale modeling, Computer applications to medicine. Medical informatics, R858-859.7

وصف الملف: electronic resource

Relation: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2667119024000132; https://doaj.org/toc/2667-1190

URL الوصول: https://doaj.org/article/723f23237fc345ca8565728c8ff74cde

المؤلفون: Loell, Kaiser, Wu, Yawei, Staller, Max, Cohen, Barak

المصدر: Cell Reports. 40(3)

مصطلحات موضوعية: CP: Molecular biology, noise, single-cell variability, stochastic gene expression, synthetic biology, transcription, transcription factors, transcriptional regulation, yeast genetics, Gene Expression, Selection, Genetic, Stochastic Processes, Synthetic Biology

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: https://escholarship.org/uc/item/0dt5x73w
https://escholarship.org/content/qt0dt5x73w/qt0dt5x73w.pdf

المؤلفون: El Meouche, Imane, Jain, Paras, Jolly, Mohit, Kumar, Capp, Jean-Pascal

المساهمون: Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Indian Institute of Science Bangalore (IISc Bangalore), Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

المصدر: ISSN: 1944-7124.

مصطلحات موضوعية: Drug tolerance, Drug persistence, Antibiotics, Antifungal, Chemotherapy, Targeted therapy, Stochastic gene expression, Phenotypic heterogeneity, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology

Relation: WOS: 001292143500001

الاتاحة: https://hal.science/hal-04720374
https://hal.science/hal-04720374v1/document
https://hal.science/hal-04720374v1/file/2024,%20El%20Meouche%20et%20al,%20%20Drug%20tolerance%20and%20persistence%20in%20bacteria,%20fungi%20and%20cancer%20cells,%20Role%20of%20non-genetic%20heterogeneity.pdf
https://doi.org/10.1016/j.tranon.2024.102069

المؤلفون: Bokes, Pavol, Singh, Abhyudai

المصدر: J Theor Biol ; ISSN:1095-8541 ; Volume:598

مصطلحات موضوعية: Antibiotic persistence, Antibiotic resistance, Antibiotic tolerance, Phenotypic heterogeneity, Stochastic gene expression

Relation: https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2024.111996; https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39603338; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC11656104/

الاتاحة: https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2024.111996
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39603338
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC11656104/

المؤلفون: Nguyen, Thi Nhu Thao, Martin, Madge, Arpin, C, Bernard, Samuel, Gandrillon, Olivier, Crauste, Fabien

المساهمون: Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Inria Lyon, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Modélisation multi-échelle des dynamiques cellulaires : application à l'hématopoïese (DRACULA), Institut Camille Jordan (ICJ), École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Lyon, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Laboratoire Modélisation et Simulation Multi-Echelle (MSME), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Gustave Eiffel, Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modélisation mathématique, calcul scientifique (MMCS), Mathématiques Appliquées Paris 5 (MAP5 - UMR 8145), Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions - CNRS Mathématiques (INSMI-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), ANR-18-CE45-0001,MEMOIRE,Modélisation multi-échelles des réponses immunes T CD8(2018)

المصدر: https://hal.science/hal-04489553 ; 2024.

مصطلحات موضوعية: Gene Regulatory Networks, cell population dynamics, CD8 T cells, stochastic gene expression, multiscale modeling, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [MATH.MATH-GM]Mathematics [math]/General Mathematics [math.GM], [SDV.IMM.IA]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Adaptive immunology

Relation: hal-04489553; https://hal.science/hal-04489553; https://hal.science/hal-04489553/document; https://hal.science/hal-04489553/file/Nguyen-et-al-HAL.pdf; BIORXIV: 2024.03.01.582928

الاتاحة: https://hal.science/hal-04489553
https://hal.science/hal-04489553/document
https://hal.science/hal-04489553/file/Nguyen-et-al-HAL.pdf

المؤلفون: Patange, Om

المساهمون: Locke, James C. W.

مصطلحات موضوعية: noise, rpos, growth, stress response, e. coli, phenotypic heterogeneity, single-cell, time-lapse microscopy, quantitative biology, stochastic simulation, Gillespie algorithm, Mother Machine, microfluidic, bet-hedging, stochastic gene expression

URL الوصول: https://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.782827

المؤلفون: Huy D. Vo, Linda S. Forero-Quintero, Luis U. Aguilera, Brian Munsky

المصدر: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Vol 11 (2023)

مصطلحات موضوعية: single-cell, fluorescence in situ hybridization (FISH), stochastic gene expression, experiment design, Fisher Information matrix, measurement noise, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2023.1133994/full; https://doaj.org/toc/2296-634X

URL الوصول: https://doaj.org/article/1a1255a85e8e4bc284d539fcc192d7de

المؤلفون: William S. Raymond, Sadaf Ghaffari, Luis U. Aguilera, Eric Ron, Tatsuya Morisaki, Zachary R. Fox, Michael P. May, Timothy J. Stasevich, Brian Munsky

المصدر: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Vol 11 (2023)

مصطلحات موضوعية: mRNA translation, nascent chain tracking, single-cell experimental design, stochastic gene expression, fluorescence microscopy simulation, machine learning, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2023.1151318/full; https://doaj.org/toc/2296-634X

URL الوصول: https://doaj.org/article/d8c230a85e8541d088a66298ef414a15

المؤلفون: Matthew V Cowley, Johanna Pruller, Massimo Ganassi, Peter S Zammit, Christopher RS Banerji

المصدر: eLife, Vol 12 (2023)

مصطلحات موضوعية: facioscapulohumeral muscular dystrophy, DUX4, stochastic gene expression, FSHD, muscle, cellular automaton, Medicine, Science, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://elifesciences.org/articles/88345; https://doaj.org/toc/2050-084X

URL الوصول: https://doaj.org/article/dd33421a7a064060bd67e70bcede832c

المؤلفون: Ventre, Elias, Herbach, Ulysse, Espinasse, Thibault, Benoit, Gérard, Gandrillon, Olivier

المساهمون: Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Camille Jordan (ICJ), École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modélisation multi-échelle des dynamiques cellulaires : application à l'hématopoïese (DRACULA), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon), Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Lyon, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Institut Élie Cartan de Lorraine (IECL), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biology, genetics and statistics (BIGS), Inria Nancy - Grand Est, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut Élie Cartan de Lorraine (IECL), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Probabilités, statistique, physique mathématique (PSPM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes (Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique), ANR-18-CE45-0023-03, Agence Nationale de la Recherche, ANR-18-CE45-0023,SingleStatOmics,Statistique et Apprentissage pour la génomique en cellules uniques(2018)

المصدر: ISSN: 1553-734X.

مصطلحات موضوعية: Gene regulatory networks, Causal inference, Data simulation, Transcriptional bursting, Stochastic gene expression, Single-cell transcriptomics, Time-course profiles, Lineage commitment, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [MATH]Mathematics [math], [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/36972296; PUBMED: 36972296

الاتاحة: https://inria.hal.science/hal-04071033
https://inria.hal.science/hal-04071033v1/document
https://inria.hal.science/hal-04071033v1/file/Ventre.23.pdf
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010962

المؤلفون: Christian P Schwall, Torkel E Loman, Bruno M C Martins, Sandra Cortijo, Casandra Villava, Vassili Kusmartsev, Toby Livesey, Teresa Saez, James C W Locke

المصدر: Molecular Systems Biology, Vol 17, Iss 7, Pp 1-16 (2021)

مصطلحات موضوعية: Bacillus subtilis, microbial systems biology, single‐cell time‐lapse microscopy, stochastic gene expression, stress priming, Biology (General), QH301-705.5, Medicine (General), R5-920

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1744-4292

URL الوصول: https://doaj.org/article/69c0b08003614400b39971bb6826f28a

المؤلفون: Jean‐Pascal Capp

المصدر: Evolutionary Applications, Vol 14, Iss 4, Pp 893-901 (2021)

مصطلحات موضوعية: cancer evolution, cell‐to‐cell heterogeneity, chromatin, DNA repair, stochastic gene expression, Evolution, QH359-425

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1752-4571

URL الوصول: https://doaj.org/article/0773860560fe49cb8e59c047a5990253

المؤلفون: Zechuan Chen, Zeruo Yang, Xiaojun Yuan, Xiaoming Zhang, Pei Hao

المصدر: BMC Bioinformatics, Vol 22, Iss 1, Pp 1-13 (2021)

مصطلحات موضوعية: Sensitive genes, Single-cell RNA sequencing, Stochastic gene expression, Unsupervised clustering, Computer applications to medicine. Medical informatics, R858-859.7, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1471-2105

URL الوصول: https://doaj.org/article/420012e5dc514a5b9190b3590d42c103

المؤلفون: Nicholas E Phillips, Alice Hugues, Jake Yeung, Eric Durandau, Damien Nicolas, Felix Naef

المصدر: Molecular Systems Biology, Vol 17, Iss 3, Pp 1-18 (2021)

مصطلحات موضوعية: circadian oscillator, single cells, smFISH, stochastic gene expression, transcriptional bursting, Biology (General), QH301-705.5, Medicine (General), R5-920

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1744-4292

URL الوصول: https://doaj.org/article/36fdc94623c04c04a5bbf604b6a559e6

المؤلفون: Earnest, Tyler M, Cole, John A, Peterson, Joseph R, Hallock, Michael J, Kuhlman, Thomas E, Luthey‐Schulten, Zaida

المصدر: Biopolymers. 105(10)

مصطلحات موضوعية: Biochemistry and Cell Biology, Bioinformatics and Computational Biology, Biological Sciences, Genetics, Underpinning research, 1.1 Normal biological development and functioning, Generic health relevance, Cell Division, DNA Replication, DNA, Bacterial, Escherichia coli, Models, Biological, Ribosomes, bacterial cell division, ribosome biogenesis, stochastic gene expression, Chemical Sciences, Biophysics, Biological sciences, Chemical sciences

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: https://escholarship.org/uc/item/12q6s853

المؤلفون: Barbara R. Migeon

المصدر: Nucleus, Vol 12, Iss 1, Pp 1-5 (2021)

مصطلحات موضوعية: x chromosome inactivation, protecting the active x from xist silencing, stochastic gene expression, 3-d nuclear interactions, x/autosome interactions, 19p trisomies, Genetics, QH426-470, Cytology, QH573-671

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1949-1034; https://doaj.org/toc/1949-1042

URL الوصول: https://doaj.org/article/2660ce7a7b104a52b17713ee1cbb1699

المؤلفون: Capp, Jean‐pascal, Thomas, Frédéric

المساهمون: Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherches Ecologiques et Evolutives sur le Cancer (MIVEGEC-CREEC), Processus Écologiques et Évolutifs au sein des Communautés (PEEC), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Université de Montpellier (UM)-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Université de Montpellier (UM), MAVA Foundation, ANR-18-CE35-0009,TRANSCAN,ECOLOGIE ET EVOLUTION DES CANCERS TRANSMISSIBLES(2018)

المصدر: ISSN: 0265-9247.

مصطلحات موضوعية: Atavism, Bet-hedging, Cell-cell heterogeneity, Cellular plasticity, Oncogenesis, Stochastic gene expression, Transcriptional diversity, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/35839471; PUBMED: 35839471; WOS: 000825672000001

الاتاحة: https://hal.inrae.fr/hal-03752205
https://hal.inrae.fr/hal-03752205v1/document
https://hal.inrae.fr/hal-03752205v1/file/BioEssays%20-%202022%20-%20Capp%20-%20From%20developmental%20to%20atavistic%20bet%E2%80%90hedging%20How%20cancer%20cells%20pervert%20the%20exploitation%20of%20random.pdf
https://doi.org/10.1002/bies.202200048

المؤلفون: Traets, Joleen Jh, van der Burght, Servaas N, Rademakers, Suzanne, Jansen, Gert, van Zon, Jeroen S

مصطلحات موضوعية: C. elegans, bistability, chemotaxis, developmental biology, gene regulatory network, molecular fluctuations, neuronal cell fate, physics of living systems, stochastic gene expression, Animals, Caenorhabditis elegans, Caenorhabditis elegans Proteins, Neurons, Transcription Factors

وصف الملف: Electronic; application/pdf

Relation: https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/334528

الاتاحة: https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/334528
https://doi.org/10.17863/CAM.81946