المؤلفون: Romain Fernandez, Loïc Le Cunff, Samuel Mérigeaud, Jean-Luc Verdeil, Julie Perry, Philippe Larignon, Anne-Sophie Spilmont, Philippe Chatelet, Maïda Cardoso, Christophe Goze-Bac, Cédric Moisy

المصدر: Scientific Reports, Vol 14, Iss 1, Pp 1-14 (2024)

مصطلحات موضوعية: 3D imaging, Image processing, MRI, X-ray CT, Plant phenotyping, Plant diseases, Medicine, Science

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/2045-2322

URL الوصول: https://doaj.org/article/fc7fc4933a514b279e0a6354b592157d

المؤلفون: Serigne Mansour Diene, Ibrahima Diack, Alain Audebert, Olivier Roupsard, Louise Leroux, Abdoul Aziz Diouf, Modou Mbaye, Romain Fernandez, Moussa Diallo, Idrissa Sarr

المصدر: IEEE Access, Vol 12, Pp 132626-132643 (2024)

مصطلحات موضوعية: Agroforestry, drone, heterogeneity, multispectral, machine learning, upscaling, Electrical engineering. Electronics. Nuclear engineering, TK1-9971

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://ieeexplore.ieee.org/document/10680013/; https://doaj.org/toc/2169-3536

URL الوصول: https://doaj.org/article/d8e612250ee942169fab1006833b67ab

المؤلفون: Romain Fernandez, Amandine Crabos, Morgan Maillard, Philippe Nacry, Christophe Pradal

المصدر: Plant Methods, Vol 18, Iss 1, Pp 1-19 (2022)

مصطلحات موضوعية: High-throughput phenotyping, Computer vision, Dynamic analysis, Root system architecture, Tracking, Plant culture, SB1-1110, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1746-4811

URL الوصول: https://doaj.org/article/5a970fa4dc2b49a49daaa7edcf0f4bd2

المؤلفون: Benoit Daviet, Romain Fernandez, Llorenç Cabrera-Bosquet, Christophe Pradal, Christian Fournier

المصدر: Plant Methods, Vol 18, Iss 1, Pp 1-14 (2022)

مصطلحات موضوعية: High-throughput phenotyping, Computer vision, Maize, Tracking, Sequence alignment, Plant physiology, Plant culture, SB1-1110, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1746-4811

URL الوصول: https://doaj.org/article/11c4a234816d41779ea259a11123a181

المؤلفون: Serigne Mansour Diene, Romain Fernandez, Eric Goze, Ibrahima Diack, Marième Faye, Al Housseynou Dabo, Pape Oumar Ba Bousso, Alain Audebert, Olivier Roupsard, Louise Leroux, Modou Mbaye, Abdou Aziz Diouf, Moussa Diallo, Idrissa Sarr

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::9dfc759eeb632b20f9b503722a22b4d7
https://doi.org/10.5194/egusphere-egu23-7531

المؤلفون: Pierre Fernique, Frederic Boudon, Christophe Pradal, Julien, jpeyhardi, Romain Fernandez, ricomos, Thomas Cokelaer, ferraro-simbals, Christophe Godin, Daniel, asbriand, Pierre Barbier de Reuille, Matthias Puech, Guillaume Cerutti, MOmidvar, Adama Ndour, Olli, Guillaume Baty, Anaelle, Jerome Chopard, RomainAzais, sribes, baugetfa

Relation: https://github.com/openalea/hydroroot/tree/v2.0.0; https://doi.org/10.5281/zenodo.6584199; https://doi.org/10.5281/zenodo.7666116; oai:zenodo.org:7666116

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7666116

المؤلفون: Romain Fernandez, Cedric Moisy

مصطلحات موضوعية: RMN, Image Analysis, Fiji

Relation: https://github.com/Rocsg/FijiRelax/tree/v4.0.10; https://doi.org/10.5281/zenodo.7198500; https://doi.org/10.5281/zenodo.7554691; oai:zenodo.org:7554691

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7554691

المؤلفون: Romain Fernandez, Loïc Le Cunff, Samuel Mérigeaud, Jean-Luc Verdeil, Julie Perry, Philippe Larignon, Anne-Sophie Spilmont, Philippe Chatelet, Maïda Cardoso, Christophe Goze-Bac, Cédric Moisy

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::1ab3942c9c9c504bbeb78a91eda7a0b1
https://doi.org/10.1101/2022.06.09.495457

المؤلفون: Romain Fernandez, Cedric Moisy

مصطلحات موضوعية: RMN, 3D+t, Open-source, ImageJ, FijiRelax plugin

Relation: https://doi.org/10.5281/zenodo.4518730; https://doi.org/10.5281/zenodo.7198971; oai:zenodo.org:7198971

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7198971

المؤلفون: Romain Fernandez

Relation: https://github.com/Rocsg/FijiRelax/tree/v4.0.4; https://doi.org/10.5281/zenodo.7198500; https://doi.org/10.5281/zenodo.7458071; oai:zenodo.org:7458071

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7458071

المؤلفون: Romain Fernandez

Relation: https://github.com/Rocsg/FijiRelax/tree/v4.0.8; https://doi.org/10.5281/zenodo.7198500; https://doi.org/10.5281/zenodo.7473014; oai:zenodo.org:7473014

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7473014

المؤلفون: Romain Fernandez

Relation: https://github.com/Rocsg/FijiRelax/tree/v4.0.5; https://doi.org/10.5281/zenodo.7198500; https://doi.org/10.5281/zenodo.7459230; oai:zenodo.org:7459230

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7459230

المؤلفون: Romain Fernandez

Relation: https://github.com/Rocsg/FijiRelax/tree/v4.0.6; https://doi.org/10.5281/zenodo.7198500; https://doi.org/10.5281/zenodo.7460691; oai:zenodo.org:7460691

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7460691

المؤلفون: Leenhardt, Romain Fernandez-Urien Sainz, Ignacio Rondonotti, Emanuele Toth, Ervin van de Bruaene, Cedric Baltes, Peter and Rosa, Bruno Joel Triantafyllou, Konstantinos Histace, Aymeric Koulaouzidis, Anastasios Dray, Xavier I-CARE Grp

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______2127::ea96e8267ef1998e420a56f940263ac4
https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/object/uoadl:3033138

المؤلفون: Cédric Moisy, Romain Fernandez

المصدر: Bioinformatics

مصطلحات موضوعية: Statistics and Probability, Computer science, Traitement d'images, Biochemistry, Time-Lapse Imaging, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Imaging, Three-Dimensional, Bioinformatique, Imagerie par résonance magnétique, Animals, Computer vision, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Multimodal imaging, 0303 health sciences, Analyse de tissus, business.industry, Orientation (computer vision), U10 - Informatique, mathématiques et statistiques, Magnetic Resonance Imaging, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Computational Theory and Mathematics, Imagerie, Artificial intelligence, business, 030217 neurology & neurosurgery, Algorithms, Software, Analyse de séries chronologiques

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::d2603d6deec8214e5071cdf28577a62b
http://agritrop.cirad.fr/599031/

المؤلفون: Romain Fernandez

المساهمون: Romain Fernandez, Cédric Moisy

مصطلحات موضوعية: Image processing, Image registration, Multimodal imaging, Time-lapse imaging, Fijiyama, Fiji

Relation: https://doi.org/10.5281/zenodo.3695735; https://doi.org/10.5281/zenodo.3695736; oai:zenodo.org:3695736

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.3695736

المؤلفون: Romain Fernandez, Cedric Moisy

مصطلحات موضوعية: RMN, 3D+t, Open-source, ImageJ, FijiRelax plugin

Relation: https://doi.org/10.5281/zenodo.4518730; https://doi.org/10.5281/zenodo.7195985; oai:zenodo.org:7195985

الاتاحة: https://doi.org/10.5281/zenodo.7195985

المؤلفون: Grégoire Malandain, Christophe Godin, Jan Traas, Pradeep Das, Eric Moscardi, Jean-Luc Verdeil, Romain Fernandez, Vincent Mirabet

المساهمون: Analysis and Simulation of Biomedical Images (ASCLEPIOS), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Modeling plant morphogenesis at different scales, from genes to phenotype (VIRTUAL PLANTS), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Reproduction et développement des plantes (RDP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)

المصدر: Nature Methods
Nature Methods, Nature Publishing Group, 2010, pp.547-553. ⟨10.1038/NMETH.1472⟩
Nature Methods, Nature Publishing Group, 2010, pp.547-553
Nature Methods, 2010, 7, pp.547-553. ⟨10.1038/NMETH.1472⟩

مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, Plant growth, Time Factors, Cell division, Lineage (evolution), Cell, Green Fluorescent Proteins, Meristem, Morphogenesis, Arabidopsis, F62 - Physiologie végétale - Croissance et développement, Image processing, Computational biology, Flowers, Biology, F50 - Anatomie et morphologie des plantes, 01 natural sciences, Biochemistry, 03 medical and health sciences, medicine, Image Processing, Computer-Assisted, Arabidopsis thaliana, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Cell Lineage, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Plant Proteins, 0303 health sciences, U10 - Informatique, mathématiques et statistiques, Resolution (electron density), Reproducibility of Results, food and beverages, Cell Biology, Anatomy, biology.organism_classification, medicine.anatomical_structure, Algorithms, Cell Division, 010606 plant biology & botany, Biotechnology

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::089642c1cf4eb95941c022b494ba255b
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00521491

المؤلفون: Génin, Élie

المساهمون: LITT&ARTS. Arts et pratiques du texte, de l’image, de l’écran et de la scène (LITT&ARTS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Romain Fernandez, Anastasia Gladoshchuk

المصدر: Arts et document, journées doctorales du laboratoire Litt&Arts ; https://hal.science/hal-04725680 ; Arts et document, journées doctorales du laboratoire Litt&Arts, Romain Fernandez; Anastasia Gladoshchuk, Jun 2024, Grenoble, France

مصطلحات موضوعية: [SHS.LITT]Humanities and Social Sciences/Literature, [SHS]Humanities and Social Sciences

جغرافية الموضوع: Grenoble, France

الاتاحة: https://hal.science/hal-04725680

المؤلفون: Bietrix, Florence, Carazo, José-Maria, Capella-Gutierrez, Salvador, Coppens, Frederik, Chiusano, Maria-Luisa, David, Romain, Fernandez Jose, Maria, Fratelli, Maddalena, Heriche, Jean-Karim, Goble, Carole, Gribbon, Philip, Holub, Petr, P.Joosten, Robbie, Leo, Simone, Owen, Stuart, Parkinson, Helen, Pieruschka, Roland, Pireddu, Luca, Porcu, Luca, Raess, Michael, Rodriguez-Navas, Laura, Scherer, Andreas, Soiland-Reyes, Stian, Tang, Jing, Saunders, Gary

المساهمون: European Advanced Translational Research Infrastructure (EATRIS), National Center for Biotechnology Information (NCBI), National Institutes of Health Bethesda, MD, USA (NIH), Barcelona Supercomputing Center - Centro Nacional de Supercomputacion (BSC-CNS), Center for Plant Systems Biology (PSB Center), Vlaams Instituut voor Biotechnologie Ghent, Belgique (VIB), University of Naples Federico II = Università degli studi di Napoli Federico II, European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents (ERINHA-AISBL), Istituto di Ricerche Farmacologiche "Mario Negri" = Mario Negri Institute for Pharmacological Research (IRCCS), European Molecular Biology Laboratory Heidelberg (EMBL), University of Manchester Manchester, ITMP Drug Discovery (ITMP), Czech Academy of Sciences Prague (CAS), European Bioinformatics Institute Hinxton (EMBL-EBI), EMBL Heidelberg, Forschungszentrum Jülich GmbH, Helmholtz-Gemeinschaft = Helmholtz Association, CRS4 Bioinformat, INFRAFRONTIER GmbH Neuherberg, TKK Helsinki University of Technology (TKK), Bietrix, Florence, Carazo, José Maria, Capella-Gutierrez, Salvador, Coppens, Frederik, Chiusano, Maria Luisa, David, Romain, Fernandez, Jose Maria, Fratelli, Maddalena, Heriche, Jean-Karim, Goble, Carole, Gribbon, Philip, Holub, Petr, P. Joosten, Robbie, Leo, Simone, Owen, Stuart, Parkinson, Helen, Pieruschka, Roland, Pireddu, Luca, Porcu, Luca, … Saunders, Gary. (2022). EOSC-Life Methodology framework to enhance reproducibility within EOSC-Life – revised version. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7137744, EOSC-Life, INFRAFRONTIER, VIB, EMBRC, ERINHA, IRFMN, EMBL-HD, UNIMAN, Fraunhofer, BBMRI-ERIC, NKI, EMBL-EBI, CSR4, HU, CSIC, BSC, European Project: 824087,EOSC-Life(2019)

المصدر: https://hal.science/hal-04161693 ; EOSC-Life; INFRAFRONTIER; VIB; EMBRC; ERINHA; IRFMN; EMBL-HD; UNIMAN; Fraunhofer; BBMRI-ERIC; NKI; EMBL-EBI; CSR4; HU; CSIC; BSC. 2022.

مصطلحات موضوعية: Reproducibility, Open Science, Data sharing, Data sharing tools, Life science, research infrastructures, Framework Implementation, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]

Relation: info:eu-repo/grantAgreement//824087/EU/Providing an open collaborative space for digital biology in Europe/EOSC-Life

الاتاحة: https://hal.science/hal-04161693
https://hal.science/hal-04161693v1/document
https://hal.science/hal-04161693v1/file/EOSC-Life_D8.1_Methodology%20framework%20to%20enhance%20reproducibility%20within%20EOSC-Life_revised%20version_September%202022.pdf
https://doi.org/10.5281/zenodo.7137744