المؤلفون: Mansouri, Leila

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida

Thesis Advisors: Notredame, Cedric

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Alineamiento de secuencias múltiples, AlphaFold2, Filogenia, Estructura de proteínas, Evolución de proteínas, Multiple Sequence alignment, Phylogeny, Structure of protein, Protein evolution

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/688007

المؤلفون: Baltzis, Athanasios

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida

Thesis Advisors: Notredame, Cedric

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Protein structure modelling, Multiple sequence alignment, Phylogenetic reconstruction, Functional inference, Large-scale analysis, Modelització d'estructures de proteïna, Alineació de seqüències múltiples, Reconstrucció filogenètica, Inferència funcional, Anàlisis de gran escala

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/687992

المؤلفون: Garriga Nogales, Edgar

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Thesis Advisors: Notredame, Cedric

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Multiple sequence alignment, Regressive alignment, Reproducibility, Guide-tree, Containers, Alineaments, Reproducibilitat, Escalabilitat, Alineament regressiu

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/673526

المؤلفون: Floden, Evan

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Thesis Advisors: Notredame, Cedric

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Multiple sequence alignment, Alignment incertainty, Regressive alignment, Workflows, Alineament de seqüència múltiple, Incertesa d'alineació, Alineació regressiva, Fluxos de treball

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/665300

المؤلفون: Lladós Segura, Jordi

المساهمون: University/Department: Universitat de Lleida. Departament d'Informàtica i Enginyeria Industrial

Thesis Advisors: Guirado Fernández, Fernando, Cores Prado, Fernando

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Alineament Múltiple de Seqüències, Big Data, Basat en consistència, Alineamiento Múltiple de Secuencias, Basado en consistencia, Multiple Sequence Alignment, Consistency-based, Arquitectura i Tecnologia de Computadors

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/663293

المؤلفون: Montañola Lacort, Alberto

المساهمون: University/Department: Universitat de Lleida. Departament d'Informàtica i Enginyeria Industrial

Thesis Advisors: Roig Mateu, Concepció, Hernández Budé, Porfidio

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Alineació múltiple de seqüencies, Computació distribuïda, Bioinformàtica, Alineamiento múltiple de secuencias, Computación distribuida, Bioinformática, Multiple sequence alignment, Distributed computing, Bioinformatics, Arquitectura i tecnologia d'ordinadors

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/385282

المؤلفون: Villanueva Cañas, José Luis

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Thesis Advisors: Albà Soler, Mar

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Genòmica evolutiva, Mamífers, Hivernació, Aliniament múltiple de seqüències, Gens de novo, Evolutionary genomics, Mammals, Hibernation, Multiple sequence alignment, De novo genes

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/397756

المؤلفون: Krzysztof Zdąbłasz, Anna Lisiecka, Norbert Dojer

المصدر: BMC Genomics, Vol 25, Iss 1, Pp 1-7 (2024)

مصطلحات موضوعية: Multiple sequence alignment, Partial order alignment, Sankey diagram, Webserver, Biotechnology, TP248.13-248.65, Genetics, QH426-470

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1471-2164

URL الوصول: https://doaj.org/article/48332ed8cef04753a4878e247620158a

المؤلفون: Chang, Jia-Ming

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Thesis Advisors: Notredame, Cedric

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: T-­Coffee, TM-­Coffee, Multiple sequence alignment, Transmembrane alignment, Alignment uncertainty, Phylogenetic tree, Bootstrap, Internal uncertainty, Alineación de secuencias múltiples, Alineación transmembrana, La incertidumbre alineación, Árbol filogenético, De arranque, La incertidumbre interna

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/129301

المؤلفون: Kemena, Carsten

المساهمون: University/Department: Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Thesis Advisors: Notredame, Cedric

المصدر: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

مصطلحات موضوعية: Bioinformatics, Multiple sequence alignment, Alignment evaluation, Large-scale alignment, Protein structure, RNA structure, Bioinformática, Alineamiento múltiple de secuencias, Evaluación de alineamientos, Alineamientos múltiples de secuencia a gran escala, Estructura de proteínas, Estructura de ARN

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: http://hdl.handle.net/10803/128678

المؤلفون: Zheng‐Wei Tan, Dan‐Dan Lu, Yong‐Liang Yu, Lei Li, Lan‐Jie Xu, Wei Dong, Chun‐Ming Li, Qing Yang, Hui‐Zhen Liang

المصدر: Plant Direct, Vol 9, Iss 1, Pp n/a-n/a (2025)

مصطلحات موضوعية: APETALA2/ethylene‐responsive factor, Carthamus tinctorius L, expression pattern, multiple sequence alignment, transcription factor, Botany, QK1-989

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/2475-4455

URL الوصول: https://doaj.org/article/05eba6420dbd4bafa567ec671d227136

المؤلفون: Agustín Amalfitano, Nicolás Stocchi, Hugo Marcelo Atencio, Fernando Villarreal, Arjen ten Have

المصدر: Genome Biology, Vol 25, Iss 1, Pp 1-23 (2024)

مصطلحات موضوعية: Phylogenomics, Multiple sequence alignment, Phylogeny, Pseudogene, Gene model, Classification, Biology (General), QH301-705.5, Genetics, QH426-470

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1474-760X

URL الوصول: https://doaj.org/article/c08cd85c9d5a4c518657f35dbfe03942

المؤلفون: Olamilekan Banwo, Olalekan Jeremiah, Rofiat Adesina, Abraham Adeyemo, Olusegun Fagbohun

المصدر: Iranian Journal of Parasitology, Vol 19, Iss 4 (2024)

مصطلحات موضوعية: Cattle, Haemonchus placei, Multiple sequence alignment, Nigeria, Infectious and parasitic diseases, RC109-216

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://ijpa.tums.ac.ir/index.php/ijpa/article/view/3967; https://doaj.org/toc/1735-7020; https://doaj.org/toc/2008-238X

URL الوصول: https://doaj.org/article/c3ad056e35b7476ba0f28023cb8aaceb

المؤلفون: Coralie Rohmer, Hélène Touzet, Antoine Limasset

المصدر: PeerJ, Vol 12, p e17731 (2024)

مصطلحات موضوعية: Long reads, Multiple sequence alignment, Sequencing errors, Heterozygosity, Pacific bioscience, Oxford nanopore, Medicine, Biology (General), QH301-705.5

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://peerj.com/articles/17731.pdf; https://peerj.com/articles/17731/; https://doaj.org/toc/2167-8359

URL الوصول: https://doaj.org/article/16c374b663f8449e804479fef62bce30

المؤلفون: Jeremias Schebera, Dirk Zeckzer, Daniel Wiegreffe

المصدر: Frontiers in Bioinformatics, Vol 4 (2024)

مصطلحات موضوعية: genome analysis, multiple sequence alignment, graph drawing, visualization, genome comparison, Computer applications to medicine. Medical informatics, R858-859.7

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fbinf.2024.1358374/full; https://doaj.org/toc/2673-7647

URL الوصول: https://doaj.org/article/96442699425b4f37b3c6fe4265cac3bf

المؤلفون: Chengze Shen, Baqiao Liu, Kelly P. Williams, Tandy Warnow

المصدر: Algorithms for Molecular Biology, Vol 18, Iss 1, Pp 1-14 (2023)

مصطلحات موضوعية: Multiple sequence alignment, Constraint alignment, MAFFT, Biology (General), QH301-705.5, Genetics, QH426-470

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1748-7188

URL الوصول: https://doaj.org/article/3ff599092538409eb4e3b3b0db256f89

المؤلفون: Mona Gharib, Fatima Rajab, Mona Mohamed

المصدر: Neutrosophic Sets and Systems, Vol 61, Pp 579-597 (2023)

مصطلحات موضوعية: bioinformatics, multiple sequence alignment, logic programming, multi-criteria decision-making, single value neutrosophic sets, tree soft sets, Mathematics, QA1-939, Electronic computers. Computer science, QA75.5-76.95

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://fs.unm.edu/NSS/HarnessingTreeSoft30.pdf; https://doaj.org/toc/2331-6055; https://doaj.org/toc/2331-608X

URL الوصول: https://doaj.org/article/cbeaaf0f4e134c498b46955b2fa6702d

المؤلفون: Chenyue Zhang, Qinxin Wang, Yiyang Li, Anqi Teng, Gang Hu, Qiqige Wuyun, Wei Zheng

المصدر: Biomolecules, Vol 14, Iss 12, p 1531 (2024)

مصطلحات موضوعية: pairwise sequence alignment, multiple sequence alignment, protein monomer, protein complex, RNA, protein language model, Microbiology, QR1-502

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://www.mdpi.com/2218-273X/14/12/1531; https://doaj.org/toc/2218-273X

URL الوصول: https://doaj.org/article/bd23c67ac30d4249a4fa7ef801817ca9

المؤلفون: Young, Colin, Meng, Sarah, Moshiri, Niema

المصدر: Viruses. 14(4)

مصطلحات موضوعية: Biological Sciences, Bioinformatics and Computational Biology, Digestive Diseases, Liver Disease, Infectious Diseases, Emerging Infectious Diseases, Aetiology, 2.2 Factors relating to the physical environment, Infection, Good Health and Well Being, Humans, Molecular Epidemiology, Phylogeny, Sequence Alignment, Workflow, multiple sequence alignment, phylogenetics, epidemiology, bioinformatics, Microbiology

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: https://escholarship.org/uc/item/6211j6qc
https://escholarship.org/content/qt6211j6qc/qt6211j6qc.pdf

المؤلفون: Tianze Cao, Qian Li, Yuexia Huang, Anshui Li

المصدر: BMC Genomics, Vol 24, Iss 1, Pp 1-8 (2023)

مصطلحات موضوعية: ggplot2, plotnine, Bioinformatics tool, Sequence logo, Multiple sequence alignment, Biotechnology, TP248.13-248.65, Genetics, QH426-470

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1471-2164

URL الوصول: https://doaj.org/article/18754c775a1d4f53b09b4d3ff394db24