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1Academic Journal
المؤلفون: Alex Ranieri Jerônimo Lima, Herbert Guimarães de Sousa Silva, Saloe Poubel, Juliana Nunes Rosón, Loyze Paola Oliveira de Lima, Héllida Marina Costa-Silva, Camila Silva Gonçalves, Pedro A. F. Galante, Fabiola Holetz, Maria Cristina Machado M. Motta, Ariel M. Silber, M. Carolina Elias, Julia Pinheiro Chagas da Cunha
المصدر: Epigenetics & Chromatin, Vol 15, Iss 1, Pp 1-16 (2022)
مصطلحات موضوعية: Trypanosoma cruzi, FAIRE-seq, tRNA, Active chromatin, Gene expression control, Polycistronic transcription, Genetics, QH426-470
وصف الملف: electronic resource
Relation: https://doaj.org/toc/1756-8935
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2Academic Journal
المصدر: Hereditas, Vol 158, Iss 1, Pp 1-8 (2021)
مصطلحات موضوعية: Aedes aegypti, AaegL5, Functional genomics, Cis-regulatory elements, FAIRE-Seq, Genetics, QH426-470
وصف الملف: electronic resource
Relation: https://doaj.org/toc/1601-5223
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3Academic Journal
المؤلفون: Regan J. Hayward, James W. Marsh, Michael S. Humphrys, Wilhelmina M. Huston, Garry S. A. Myers
المصدر: Epigenetics & Chromatin, Vol 13, Iss 1, Pp 1-18 (2020)
مصطلحات موضوعية: Chlamydial infection, Chlamydia trachomatis, Chromatin accessibility, FAIRE-Seq, Bacterial infection, Genetics, QH426-470
وصف الملف: electronic resource
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4Academic Journal
المؤلفون: Nowling, Ronald J., Behura, Susanta, Halfon, Marc S., Emrich, Scott J., Duman-Scheel, Molly
المساهمون: Medical and Molecular Genetics, School of Medicine
المصدر: PMC
مصطلحات موضوعية: Aedes aegypti, AaegL5, Functional genomics, Cis-regulatory elements, FAIRE-Seq
وصف الملف: application/pdf
Relation: Hereditas; Nowling RJ, Behura SK, Halfon MS, Emrich SJ, Duman-Scheel M. PeakMatcher facilitates updated Aedes aegypti embryonic cis-regulatory element map. Hereditas. 2021;158(1):7. Published 2021 Jan 28. doi:10.1186/s41065-021-00172-2; https://hdl.handle.net/1805/29111
الاتاحة: https://hdl.handle.net/1805/29111
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5Academic Journal
المؤلفون: Jeremy R. Wang, Bryan Quach, Terrence S. Furey
المصدر: BMC Bioinformatics, Vol 18, Iss 1, Pp 1-10 (2017)
مصطلحات موضوعية: Epigenomics, Bias correction, DNase-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, FAIRE-seq, Computer applications to medicine. Medical informatics, R858-859.7, Biology (General), QH301-705.5
وصف الملف: electronic resource
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6Academic Journal
المؤلفون: Fernández, Rosa, Marcet-Houben, Marina, Legeai, Fabrice, Richard, Gautier, Robin, Stéphanie, Wucher, Valentin, Pegueroles, Cinta, Gabaldón, Toni, Tagu, Denis
المساهمون: Centre for Genomic Regulation - Centre de Regulació Genòmica Barcelona (CRG), Universitat Pompeu Fabra Barcelona (UPF)-Centro Nacional de Analisis Genomico Barcelona (CNAG), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT), Plateforme bioinformatique GenOuest Rennes, Université de Rennes (UR)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Centro de Regulación Genómica (CRG), Universitat Pompeu Fabra Barcelona (UPF), Juan de la Cierva-Incorporación Fellowship, IJCI-2015-26627, Government of Spain, Spanish Ministry of Economy, Industry, and Competitiveness
المصدر: ISSN: 0737-4038.
مصطلحات موضوعية: FAIRE-Seq, gene duplicates, insect, neofunctionalization, phylogenomics, positive selection, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/32359152; PUBMED: 32359152; PUBMEDCENTRAL: PMC7475028; WOS: 000574386500011
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7Academic Journal
المؤلفون: Suzan Stelloo, Ekaterina Nevedomskaya, Henk G van der Poel, Jeroen de Jong, Geert JLH van Leenders, Guido Jenster, Lodewyk FA Wessels, Andries M Bergman, Wilbert Zwart
المصدر: EMBO Molecular Medicine, Vol 7, Iss 11, Pp 1450-1464 (2015)
مصطلحات موضوعية: androgen receptor profiling, ChIP‐seq, companion diagnostics for prostate cancer, FAIRE‐seq, treatment prediction, Medicine (General), R5-920, Genetics, QH426-470
وصف الملف: electronic resource
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8Academic Journal
المؤلفون: Carlberg, Carsten, Seuter, Sabine, Nurmi, Tarja, Tuomainen, Tomi-Pekka, Virtanen, Jyrki K, Neme, Antonio
المساهمون: School of Medicine / Biomedicine, School of Medicine / Public Health
مصطلحات موضوعية: vitamin D3, epigenome, bolus supplementation, accessible chromatin, PBMCs, FAIRE-seq, SOM, HLA cluster
وصف الملف: 142-148
Relation: JOURNAL OF STEROID BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY; http://dx.doi.org/10.1016/j.jsbmb.2018.01.002; 180; https://erepo.uef.fi/handle/123456789/6702
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9
المصدر: Hereditas, Vol 158, Iss 1, Pp 1-8 (2021)
Hereditasمصطلحات موضوعية: lcsh:QH426-470, Genome, Insect, Sequence assembly, Locus (genetics), Aedes aegypti, Computational biology, Genome, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Aedes, Genetics, Animals, Cis-regulatory elements, Regulatory Elements, Transcriptional, AaegL5, Gene, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, biology, Brief Report, FAIRE-Seq, Chromosome, Molecular Sequence Annotation, Functional genomics, General Medicine, biology.organism_classification, lcsh:Genetics, 030217 neurology & neurosurgery
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10Dissertation/ Thesis
المؤلفون: Deem, Kevin David
مصطلحات موضوعية: Biology, Evolution and Development, Developmental Biology, Entomology, evo-devo, evolutionary developmental biology, wing origin, tergal, pleural, dual, enhancer reporter assay, enhancers, insects, FAIRE-seq, open chromatin, Drosophila, Tribolium, gene regulatory networks, GRNs, Gal4-UAS, PhiC31, insect transgenic, insect reporter assay, cross species reporter assay, vestigial, cross-wiring
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11Academic Journal
المؤلفون: Behura, Susanta K., Sarro, Joseph, Li, Ping, Mysore, Keshava, Severson, David W., Emrich, Scott J., Duman-Scheel, Molly
المساهمون: Department of Medical & Molecular Genetics, IU School of Medicine
المصدر: PMC
مصطلحات موضوعية: Genome, FAIRE-seq, Dengue virus, Zika, Next generation sequencing, Drosophila
وصف الملف: application/pdf
Relation: BMC Genomics; Behura, S. K., Sarro, J., Li, P., Mysore, K., Severson, D. W., Emrich, S. J., & Duman-Scheel, M. (2016). High-throughput cis-regulatory element discovery in the vector mosquito Aedes aegypti. BMC Genomics, 17, 341. http://doi.org/10.1186/s12864-016-2468-x; https://hdl.handle.net/1805/13470
الاتاحة: https://hdl.handle.net/1805/13470
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12Academic Journal
المؤلفون: Behura, Susanta, Sarro, Joseph, Li, Ping, Mysore, Keshava, Severson, David, Emrich, Scott, Duman-Scheel, Molly
مصطلحات موضوعية: Genome, FAIRE-seq, Dengue virus, Zika, Next generation sequencing, Drosophila
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13Report
المؤلفون: Du, Juan, Leung, Amy, Trac, Candi, Lee, Michael, Parks, Brian, Lusis, Aldons, Natarajan, Rama, Schones, Dustin
مصطلحات موضوعية: Chromatin accessibility, Transposable element, Transcription factor, DNA methylation, FAIRE-seq
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14
المؤلفون: Wilhelmina M. Huston, Garry S. A. Myers, James W. Marsh, Michael S. Humphrys, Regan J. Hayward
المصدر: Epigenetics & Chromatin
Epigenetics & Chromatin, Vol 13, Iss 1, Pp 1-18 (2020)مصطلحات موضوعية: Chlamydial infection, lcsh:QH426-470, Chlamydia trachomatis, Biology, medicine.disease_cause, Transcriptome, Epigenome, Genetics, Transcriptional regulation, medicine, Humans, Chlamydia, Molecular Biology, Transcription factor, Gene, Regulation of gene expression, Chromatin accessibility, Research, FAIRE-Seq, Epithelial Cells, Hep G2 Cells, Chlamydia Infections, medicine.disease, Chromatin Assembly and Disassembly, Chromatin, Cell biology, lcsh:Genetics, Bacterial infection
وصف الملف: application/pdf
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15
المؤلفون: Tomi-Pekka Tuomainen, Sabine Seuter, Tarja Nurmi, Jyrki K. Virtanen, Carsten Carlberg, Antonio Neme
المصدر: The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 180:142-148
مصطلحات موضوعية: Epigenomics, Male, 0301 basic medicine, Vitamin, medicine.medical_specialty, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Clinical Biochemistry, Biology, Biochemistry, Peripheral blood mononuclear cell, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Endocrinology, In vivo, Internal medicine, Vitamin D and neurology, medicine, Humans, Vitamin D, Molecular Biology, Genome, Human, Vitamins, Cell Biology, Epigenome, Middle Aged, Chromatin, 3. Good health, 030104 developmental biology, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, Leukocytes, Mononuclear, FAIRE-Seq, Molecular Medicine, Transcriptome, In vitro cell culture, Hormone
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16
المؤلفون: Nadine E Tatto, Josef W. Moser, Brigitte Gasser, Diethard Mattanovich, Corinna Rebnegger, Alexandra B. Graf, Sonakshi De
المصدر: FEMS Yeast Research
مصطلحات موضوعية: Saccharomyces cerevisiae, pseudohyphal growth, Hyphae, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, Fungal Proteins, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Pseudohyphal growth, Pichia pastoris, Gene Expression Regulation, Fungal, Transcriptional regulation, Gene family, Gene, Psychological repression, 030304 developmental biology, Komagataella phaffii, 0303 health sciences, AcademicSubjects/SCI01150, Membrane Glycoproteins, biology, epigenetics, FAIRE-Seq, General Medicine, biology.organism_classification, Phenotype, Chromatin, Cell biology, specific growth rate, Multigene Family, Saccharomycetales, FLO genes, 030217 neurology & neurosurgery, Research Article
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17
المؤلفون: Sourav Ghosh, Manu Agarwal, Amar Kumar, Somya Singh, Surekha Katiyar-Agarwal, Vivek K. Raxwal, Vinod Scaria, Arun Jagannath, Shailendra Goel
المصدر: Journal of experimental botany. 71(17)
مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Physiology, Arabidopsis, Plant Science, 01 natural sciences, DNase-Seq, 03 medical and health sciences, Gene Expression Regulation, Plant, Stress, Physiological, Transcription factor, Abiotic component, biology, Abiotic stress, Arabidopsis Proteins, Promoter, biology.organism_classification, Plants, Genetically Modified, Chromatin, Cell biology, Droughts, 030104 developmental biology, FAIRE-Seq, 010606 plant biology & botany
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18
المؤلفون: Valentin Wucher, Rosa Fernández, Cinta Pegueroles, Stéphanie Robin, Fabrice Legeai, Gautier Richard, Marina Marcet-Houben, Toni Gabaldón, Denis Tagu
المساهمون: Ministerio de Economía y Competitividad (España), European Commission, Generalitat de Catalunya, Institut National de la Recherche Agronomique (France), Beijing Genomics Institute, Centre for Genomic Regulation [Barcelona] (CRG), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF)-Centro Nacional de Analisis Genomico [Barcelona] (CNAG), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Plateforme bioinformatique GenOuest [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Centro de Regulación Genómica (CRG), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF), Juan de la Cierva-Incorporación Fellowship, IJCI-2015-26627, Government of Spain, Spanish Ministry of Economy, Industry, and Competitiveness, Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Université de Rennes (UR)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Barcelona Supercomputing Center
المصدر: Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
instname
Molecular Biology and Evolution
Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2020, 37 (9), pp.2601-2615. ⟨10.1093/molbev/msaa110⟩
bioRxiv
Molecular Biology and Evolution, 2020, 37 (9), pp.2601-2615. ⟨10.1093/molbev/msaa110⟩
UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
Under review Molecular Biology and Evolutionمصطلحات موضوعية: Genome, Insect, ADN, Gene duplicates, Gene Expression, AcademicSubjects/SCI01180, Gens -- Mapatge, 0302 clinical medicine, Gene Duplication, Phylogenomics, Gene duplication, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, biology, 030302 biochemistry & molecular biology, food and beverages, Biological Evolution, Positive selection, Neofunctionalization, Genoma -- Evolució, Duplicació cromosòmica, Data sets, Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica [Àrees temàtiques de la UPC], Genome evolution, 03 medical and health sciences, DNA Packaging, Genetics, Animals, Selection, Genetic, Molecular Biology, Gene, Discoveries, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, Comparative genomics, Phenotypic plasticity, FAIRE-Seq, AcademicSubjects/SCI01130, Pugons, biology.organism_classification, Acyrthosiphon pisum, Insectes, Evolutionary biology, Aphids, Adaptation, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Insect, 030217 neurology & neurosurgery, Genètica
وصف الملف: application/pdf
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19
المؤلفون: Sabine Seuter, Antonio Neme, Carsten Carlberg
مصطلحات موضوعية: genomic DNA, FAIRE-Seq, Nucleosome, Promoter, Computational biology, Biology, Enhancer, Genome, Gene, Chromatin
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20