المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe

Thesis Advisors: Hamel, Sylvie, Chauve, Cedric, Philippe, Hervé

مصطلحات موضوعية: Famille de gènes, Gene family, Duplication de gène, Gene duplication, Perte de gène, Gene loss, Homologie, Homology, Génomique comparative, Comparative genomics, Arbre d’espèces, Species tree, Arbre de gènes, Gene tree, Coévolution, Coevolution, Probabilité, Probability, Réconciliation, Reconciliation, Parcimonie, Parsimony, Évolution, Evolution, Phylogénétique, Phylogenetic, Applied Sciences - Computer Science / Sciences appliqués et technologie - Informatique (UMI : 0984)

الاتاحة: http://hdl.handle.net/1866/3868

المؤلفون: Berry, Vincent, Chevenet, François, Doyon, Jean-Philippe, Jousselin, Emmanuelle

المساهمون: Institut de Biologie Computationnelle (IBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie ), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), ANR-09-PEXT-0002,PhyloSpace,Intégrer des cophylogénies, changements d'aires et cartes paléoclimatiques pour inférer l'histoire d'associations sous changements climatiques.(2009), ANR-11-BINF-0002,IBC,Institut de biologie Computationnelle(2011)

المصدر: ISSN: 1755-098X.

مصطلحات موضوعية: biogeography, cophylogeny, host/parasite, software, tree visualization, reconciliation, [SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/29697894; IRD: fdi:010073767; PUBMED: 29697894; WOS: 000441753000020

الاتاحة: https://hal.umontpellier.fr/hal-01942777
https://hal.umontpellier.fr/hal-01942777v1/document
https://hal.umontpellier.fr/hal-01942777v1/file/166215v4.full.pdf
https://doi.org/10.1111/1755-0998.12897

المؤلفون: Ranwez, Vincent, Scornavacca, Celine, Doyon, Jean-Philippe, Berry, Vincent

المساهمون: Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut de Biologie Computationnelle (IBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: ISSN: 0303-6812.

مصطلحات موضوعية: tree embedding, tree reconciliation, parsimony, phylogenetics, equivalence, gene evolution, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]

Relation: hal-01370854; https://hal.science/hal-01370854; https://hal.science/hal-01370854/document; https://hal.science/hal-01370854/file/main.pdf; PRODINRA: 369097; WOS: 000380234200004

الاتاحة: https://hal.science/hal-01370854
https://hal.science/hal-01370854/document
https://hal.science/hal-01370854/file/main.pdf
https://doi.org/10.1007/s00285-015-0930-z

المؤلفون: Chevenet, François, Doyon, Jean-Philippe, Scornavacca, Celine, Jacox, Edwin, Jousselin, Emmanuelle, Berry, Vincent

المساهمون: Institut de Biologie Computationnelle (IBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Du gène à l'écosystème (MIVEGEC-GeneSys), Pathogènes, Environnement, Santé Humaine (EPATH), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie )-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD Occitanie ), Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Korean Research Institute of Bioscience , National Research Foundation of Korea, Ministry of Science, ICT & Future Planning , Biotechnology Research Initiative Program

المصدر: ISSN: 1367-4803.

مصطلحات موضوعية: [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy

Relation: PRODINRA: 355830; WOS: 000371693700022

الاتاحة: https://hal.umontpellier.fr/hal-01942605
https://hal.umontpellier.fr/hal-01942605v1/document
https://hal.umontpellier.fr/hal-01942605v1/file/Chevenet_etal_2016_viewer_phylogenetic_1.pdf
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv625

المؤلفون: Nguyen, Thi-Hau, Doyon, Jean-Philippe, Pointet, Stéphanie, Arigon Chifolleau, Anne-Muriel, Ranwez, Vincent, Berry, Vincent

المساهمون: Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), ANR-10-BINF-0001,ANCESTROME,Approche de phylogénie intégrative pour la reconstruction de génomes ancestraux(2010)

المصدر: ISSN: 0302-9743 ; Lecture Notes in Computer Science ; 12th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2012) ; https://hal.science/hal-00718347 ; 12th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2012), Sep 2012, Ljubljana, Slovenia. pp.123-134, ⟨10.1007/978-3-642-33122-0_10⟩ ; http://algo12.fri.uni-lj.si/?file=wabi.

مصطلحات موضوعية: [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology

جغرافية الموضوع: Ljubljana, Slovenia

Relation: hal-00718347; https://hal.science/hal-00718347; https://hal.science/hal-00718347v3/document; https://hal.science/hal-00718347v3/file/WABI12_Nguyen.pdf; PRODINRA: 253030

الاتاحة: https://hal.science/hal-00718347
https://hal.science/hal-00718347v3/document
https://hal.science/hal-00718347v3/file/WABI12_Nguyen.pdf
https://doi.org/10.1007/978-3-642-33122-0_10

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Scornavacca, Celine, Szöllősi, Gergely J., Ranwez, Vincent, Berry, Vincent

المساهمون: Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for Bioinformatics (ZBIT), Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen, Bioinformatique, phylogénie et génomique évolutive LBBE (BPGE), Département PEGASE LBBE (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National d'Etudes Supérieures Agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro). Montpellier, FRA.

المصدر: Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques ; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00833164 ; Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Institut National d'Etudes Supérieures Agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro). Montpellier, FRA., Sep 2010, Montpellier, France. pp.8 ; http://www.jobim2010.fr/

مصطلحات موضوعية: reconciliation, gene and species trees, transfers, duplications, losses, parsimony, [INFO.INFO-DS]Computer Science [cs]/Data Structures and Algorithms [cs.DS], [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]

جغرافية الموضوع: Montpellier, France

Relation: lirmm-00833164; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00833164; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00833164/document; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00833164/file/2010_jobim.pdf; PRODINRA: 315741

الاتاحة: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00833164
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00833164/document
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00833164/file/2010_jobim.pdf

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Scornavacca, Celine, Gorbunov, Yu, Szöllősi, Gergely, J., Ranwez, Vincent, Berry, Vincent

المساهمون: Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for Bioinformatics (ZBIT), Eberhard Karls Universität Tübingen = University of Tübingen, Institute for Information Transmission Problems (IITP), Russian Academy of Sciences Moscow (RAS), Bioinformatique, phylogénie et génomique évolutive LBBE (BPGE), Département PEGASE LBBE (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Eric Tannier

المصدر: Comparative Genomics. RECOMB-CG 2010 ; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00818889 ; Eric Tannier. Comparative Genomics. RECOMB-CG 2010, LNCS (6398), Springer Berlin Heidelberg, pp.93-108, 2010, 978-3-642-16181-0. ⟨10.1007/978-3-642-16181-0_9⟩ ; http://recombcg.uottawa.ca/recombcg2010/

مصطلحات موضوعية: [INFO.INFO-DS]Computer Science [cs]/Data Structures and Algorithms [cs.DS]

Relation: lirmm-00818889; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00818889; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00818889/document; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00818889/file/camera-ready_accepted_by_all.pdf

الاتاحة: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00818889
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00818889/document
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00818889/file/camera-ready_accepted_by_all.pdf
https://doi.org/10.1007/978-3-642-16181-0_9

المؤلفون: Nguyen, Thi, Ranwez, Vincent, Pointet, Stéphanie, Arigon Chifolleau, Anne-Muriel, Doyon, Jean-Philippe, Berry, Vincent

المساهمون: Laboratoire de Modélisation et Simulation Multi Echelle (MSME), Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Diversité, Adaptation et Amélioration de la Vigne AGAP (DAAV), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Montpellier (UM), Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Computationnelle, ANR-10-BINF-0002,BACNET,Exploring composition and dynamics of bacterial regulatory networks(2010), ANR-09-PEXT-0009,ADAPTANTHROP,Adaptation des insectes aux anthroposystèmes(2009)

المصدر: ISSN: 1748-7188 ; Algorithms for Molecular Biology ; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00812726 ; Algorithms for Molecular Biology, 2013, 8 (12), ⟨10.1186/1748-7188-8-12⟩ ; http://www.biomedcentral.com/.

مصطلحات موضوعية: Reconciliation, Evolution, Method, Gene tree correction, Nearest neighbor interchange, Loss, Transfer, Duplication, Software, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/23566548; PRODINRA: 190069; PUBMED: 23566548; WOS: 000324271400001

الاتاحة: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00812726
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00812726v1/document
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00812726v1/file/Nguyen_et_al-ALMOB_2013.pdf
https://doi.org/10.1186/1748-7188-8-12

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Ranwez, Vincent, Daubin, Vincent, Berry, Vincent

المساهمون: Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Bioinformatique, phylogénie et génomique évolutive LBBE (BPGE), Département PEGASE LBBE (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), French Agence Nationale de la Recherche 'Domaines Emergents' : ANR-08-EMER-011, Languedoc-Roussillon 'Chercheur d'Avenir', ANR-08-EMER-0011,PHYL-ARIANE,Phylogénomique : Algorithmes et Représentations Intégrés pour l'ANalyse de l'Evolution du vivant(2008)

المصدر: ISSN: 1467-5463.

مصطلحات موضوعية: lateral gene transfer, phylogeny, parsimony, probability, loss, gene duplication, reconciliation, [INFO.INFO-DS]Computer Science [cs]/Data Structures and Algorithms [cs.DS], [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: lirmm-00825041; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00825041; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00825041/document; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00825041/file/BriefingsSubmitted.pdf; PRODINRA: 315894; WOS: 000295171700004

الاتاحة: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00825041
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00825041/document
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00825041/file/BriefingsSubmitted.pdf
https://doi.org/10.1093/bib/bbr045

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Hamel, Sylvie, Chauve, Cedric

المساهمون: Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département d'Informatique et de Recherche Opérationnelle Montreal (DIRO), Université de Montréal (UdeM), Department of Mathematics Burnaby (SFU), Simon Fraser University = Université Simon Fraser (SFU.ca)

المصدر: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448486 ; RR-10002, 2010, pp.19.

مصطلحات موضوعية: Comparative genomics, species tree, gene tree, probability, reconciliation, parsimony, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]

Relation: Report N°: RR-10002; lirmm-00448486; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448486; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448486/document; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448486/file/RR-10002.pdf

الاتاحة: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448486
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448486/document
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448486/file/RR-10002.pdf

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Chauve, Cedric

المساهمون: Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Mathematics Burnaby (SFU), Simon Fraser University = Université Simon Fraser (SFU.ca)

المصدر: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448481 ; RR-10001, 2010, pp.18.

مصطلحات موضوعية: Comparative genomics, Evolution and phylogenetics, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]

Relation: Report N°: RR-10001; lirmm-00448481; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448481; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448481v2/document; https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448481v2/file/branchAndBound.pdf

الاتاحة: https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448481
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448481v2/document
https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00448481v2/file/branchAndBound.pdf

المؤلفون: Berry, Vincent, Chevenet, François, Doyon, Jean-Philippe, Jousselin, Emmanuelle

مصطلحات موضوعية: cospeciation, biogeography, software, host/parasite, ancestral trait reconstruction

Relation: Berry V, Chevenet F, Doyon J, Jousselin E (2018) A geography-aware reconciliation method to investigate diversification patterns in host/parasite interactions. Molecular Ecology Resources 18(5): 1173-1184.; http://hdl.handle.net/10255/dryad.168243

الاتاحة: http://hdl.handle.net/10255/dryad.168243
https://doi.org/10.5061/dryad.dv164

المؤلفون: Berry, Vincent, Chevenet, François, Doyon, Jean-Philippe, Jousselin, Emmanuelle

مصطلحات موضوعية: cospeciation, biogeography, software, host/parasite, ancestral trait reconstruction

Relation: http://hdl.handle.net/10255/dryad.168245

الاتاحة: http://hdl.handle.net/10255/dryad.168245
https://doi.org/10.5061/dryad.dv164/2

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Chauve, Cedric

المصدر: Advances in Experimental Medicine and Biology ; Software Tools and Algorithms for Biological Systems ; page 287-295 ; ISSN 0065-2598 ; ISBN 9781441970459 9781441970466

الاتاحة: http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4419-7046-6_29
http://link.springer.com/content/pdf/10.1007/978-1-4419-7046-6_29.pdf

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Chauve, Cedric, Hamel, Sylvie

المصدر: Comparative Genomics ; Lecture Notes in Computer Science ; page 1-13 ; ISSN 0302-9743 1611-3349 ; ISBN 9783540879886 9783540879893

الاتاحة: http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-87989-3_1
http://link.springer.com/content/pdf/10.1007/978-3-540-87989-3_1.pdf

المؤلفون: Chauve, Cedric, Doyon, Jean-Philippe, El-Mabrouk, Nadia

المصدر: Comparative Genomics ; Lecture Notes in Computer Science ; page 45-57 ; ISSN 0302-9743 1611-3349 ; ISBN 9783540749592 9783540749608

الاتاحة: http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74960-8_4
http://link.springer.com/content/pdf/10.1007/978-3-540-74960-8_4.pdf

المؤلفون: Doyon, Jean‐Philippe, Berry, Vincent, Chevenet, François, Jousselin, Emmanuelle

المصدر: Molecular Ecology Resources; Sep2018, Vol. 18 Issue 5, p1173-1184, 12p

مصطلحات موضوعية: BIOGEOGRAPHY, PHYLOGENY, ALGORITHMS, BIG data, FICUS (Plants)

المؤلفون: Doyon, Jean-Philippe, Chauve, Cedric, Hamel, Sylvie

المصدر: Journal of Computational Biology ; volume 16, issue 10, page 1399-1418 ; ISSN 1066-5277 1557-8666

الاتاحة: http://dx.doi.org/10.1089/cmb.2009.0095
http://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/cmb.2009.0095

المؤلفون: Chauve, Cedric, Doyon, Jean-Philippe, El-Mabrouk, Nadia

المصدر: Journal of Computational Biology ; volume 15, issue 8, page 1043-1062 ; ISSN 1066-5277 1557-8666

الاتاحة: http://dx.doi.org/10.1089/cmb.2008.0054
http://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/cmb.2008.0054

المؤلفون: Nguyen, Thi Hau, Doyon, Jean-Philippe, Pointet, Stéphanie, Arigon Chifolleau, Anne-Muriel, Ranwez, Vincent, Berry, Vincent

المصدر: Algorithms in Bioinformatics (9783642331213); 2012, p123-134, 12p