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1Academic Journal
المؤلفون: Cacho-Navas, C, López-Pujante, C, Reglero-Real, N, Colás-Algora, N, Cuervo, A, Conesa, JJ, Barroso, S, de Rivas, G, Ciordia, S, Paradela, A, D'Agostino, G, Manzo, C, Feito, J, Andrés, G, Molina-Jiménez, F, Majano, P, Correas, I, Carazo, J-M, Nourshargh, S, Huch, M, Millán, J
مصطلحات موضوعية: Liver Disease, Digestive Diseases, 1.1 Normal biological development and functioning, 1 Underpinning research, Generic health relevance
Relation: eLife; Cristina Cacho-NavasCarmen López-PujanteNatalia Reglero-RealNatalia Colás-AlgoraAna CuervoJose Javier ConesaSusana BarrosoGema de RivasSergio CiordiaAlberto ParadelaGianluca D'AgostinoCarlo ManzoJorge FeitoGermán AndrésFrancisca Molina-JiménezPedro MajanoIsabel CorreasJosé-Maria CarazoSussan NoursharghMeritxell HuchJaime Millán (2024) ICAM-1 nanoclusters regulate hepatic epithelial cell polarity by leukocyte adhesion-independent control of apical actomyosin eLife 12:RP89261. https://doi.org/10.7554/eLife.89261.3; https://qmro.qmul.ac.uk/xmlui/handle/123456789/96343
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2Academic Journal
المساهمون: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (España)
Relation: #PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE#; info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020/PID2019-104757RB-I00/ES/AIM-CRYOEM: PROCESAMIENTO DE IMAGEN AVANZADO ORIENTADO AL ANALISIS DE PARTICULAS INDIVIDUALES EN MICROSCOPIA ELECTRONICA EN CONDICIONES CRIOGENICAS/; Journal of structural biology; Publisher's version; Sí; http://hdl.handle.net/10261/358505; 2-s2.0-85180588375; https://api.elsevier.com/content/abstract/scopus_id/85180588375
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3Academic Journal
المؤلفون: Fernandez-Gimenez, E, Carazo, J M, Sorzano, C O S
المساهمون: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (España), Carazo, J M, Sorzano, C O S
مصطلحات موضوعية: CTF, Cryo-EM, Defocus, High-resolution, Local defocus, SPA
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4Academic Journal
المؤلفون: Herreros, D, Krieger, J, M, Fonseca, Y, Conesa, P, Harastani, M, Vuillemot, R, Hamitouche, I, Serrano Gutiérrez, R, Gragera, M, Melero, R, Jonic, Slavica, Carazo, J, M, Sorzano, C, O S
المساهمون: Centro Nacional de Biotecnología Madrid (CNB-CSIC), Consejo Superior de Investigaciones Cientificas España = Spanish National Research Council Spain (CSIC), Centro national de Biotecnologia = Spanish National Centre for Biotechnology (CNB-CSIC), Bioinformatique et BioPhysique IMPMC (IMPMC_BIBIP), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR206-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR206-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
المصدر: ISSN: 2059-7983 ; EISSN: 2059-7983.
مصطلحات موضوعية: single-particle analysis image processing cryo-electron microscopy protein dynamics continuous conformational variability Scipion Flexibility Hub, single-particle analysis, image processing, cryo-electron microscopy, protein dynamics, continuous conformational variability, Scipion Flexibility Hub, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Relation: hal-04147629; https://hal.science/hal-04147629; https://hal.science/hal-04147629/document; https://hal.science/hal-04147629/file/ic5121.pdf
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5Academic Journal
المؤلفون: Herreros, D, Kiska, J, Ramírez-Aportela, E, Filipovic, J, Carazo, J M, Sorzano, C O S
المساهمون: Ministerio de Ciencia e Innovación (España), Comunidad de Madrid, Air Force Office of Scientific Research (US), National Institute of General Medical Sciences (US), Ramírez-Aportela, Erney, Carazo, José M., Sorzano, Carlos Óscar S
مصطلحات موضوعية: Cryo-Electron Microscopy (CryoEM), Zernike polynomials, Zernike3D-based Algebraic Reconstruction Technique (ZART), map reconstruction, spherical harmonics
Relation: #PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE#; info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020/PID2019-104757RB-I00/ES/AIM-CRYOEM: PROCESAMIENTO DE IMAGEN AVANZADO ORIENTADO AL ANALISIS DE PARTICULAS INDIVIDUALES EN MICROSCOPIA ELECTRONICA EN CONDICIONES CRIOGENICAS/; Journal of molecular biology; Publisher's version; application/pdf; https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002228362300150X; Sí; Journal of Molecular Biology 2023; 435: 168088; http://hdl.handle.net/10261/364258; 2-s2.0-85152735879; https://api.elsevier.com/content/abstract/scopus_id/85152735879
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6Academic Journal
المؤلفون: Fernández-Giménez, E, Martínez, M M, Marabini, R, Strelak, D, Sánchez-García, R, Carazo, J M, Sorzano, C O S
المساهمون: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (España), Comunidad de Madrid, Agencia Estatal de Investigación (España), Martínez, Marta, Marabini, Roberto, Carazo, José María, Sorzano, Carlos Óscar S, Consejo Superior de Investigaciones Científicas https://ror.org/02gfc7t72
مصطلحات موضوعية: Cryo-EM, Ligand, Nanodisc, Projection subtraction, SPA
Relation: #PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE#; info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020/PID2019-104757RB-I00/ES/AIM-CRYOEM: PROCESAMIENTO DE IMAGEN AVANZADO ORIENTADO AL ANALISIS DE PARTICULAS INDIVIDUALES EN MICROSCOPIA ELECTRONICA EN CONDICIONES CRIOGENICAS/; info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020/PID2019-104098GB-I00/ES/ENSAMBLAJE, ARQUITECTURA Y PROPIEDADES FISICAS DE VIRUS DEL LINAJE DOUBLE JELLY ROLL CON IMPLICACIONES EN BIOMEDICINA, ECOLOGIA Y EVOLUCION DE VIRUS/; Journal of structural biology; Publisher's version; application/pdf; https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1047847723000874?via%3Dihub; Sí; Journal of Structural Biology 215 (2023) 108024; http://hdl.handle.net/10261/362218; http://dx.doi.org/10.13039/501100011033; http://dx.doi.org/10.13039/100012818; 2-s2.0-85172292610; https://api.elsevier.com/content/abstract/scopus_id/85172292610
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7Academic Journal
المؤلفون: Herreros, D., Lederman, R. R., Krieger, J. M., Jiménez-Moreno, A., Martínez, M., Myška, D., Strelak, D., Filipovic, J., Sorzano, C. O. S., Carazo, J. M.
المصدر: Nature Communications ; volume 14, issue 1 ; ISSN 2041-1723
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المؤلفون: Gómez-Blanco, J., de la Rosa-Trevín, José Miguel, Marabini, R., del Cano, L., Jimenez, A., Martinez, M., Melero, R., Majtner, T., Maluenda, D., Mota, J., Rancel, Y., Ramirez-Aportela, E., Vilas, J. L., Carroni, Marta, Fleischmann, Stefan, Lindahl, Erik, Ashton, A. W., Basham, M., Clare, D. K., Savage, K., Siebert, C. A., Sharov, G. G., Sorzano, C. O. S., Conesa, P., Carazo, J. M.
المصدر: Journal of Structural Biology. 204(3):457-463
مصطلحات موضوعية: Electron microscopy, Streaming Image processing, Live processing, High throughput, Scipion
وصف الملف: print
URL الوصول: https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-165809
https://doi.org/10.1016/j .jsb.2018.10.001 -
9Electronic Resource
المؤلفون: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (España), de Isidro-Gómez, F P, Vilas, J L, Losana, P, Carazo, J M, Sorzano, Carlos Óscar S.
مصطلحات الفهرس: artículo
URL:
http://hdl.handle.net/10261/358505 https://api.elsevier.com/content/abstract/scopus_id/85180588375
Journal of structural biology
Publisher's version
Sí
info:eu-repo/grantAgreement/AEI/Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020/PID2019-104757RB-I00/ES/AIM-CRYOEM: PROCESAMIENTO DE IMAGEN AVANZADO ORIENTADO AL ANALISIS DE PARTICULAS INDIVIDUALES EN MICROSCOPIA ELECTRONICA EN CONDICIONES CRIOGENICAS -
10Academic Journal
المؤلفون: Varadi M., Anyango S., Armstrong D., Berrisford J., Choudhary P., Deshpande M., Nadzirin N., Nair S. S., Pravda L., Tanweer A., Al-Lazikani B., Andreini C., Barton G. J., Bednar D., Berka K., Blundell T., Brock K. P., Carazo J. M., Damborsky J., David A., Dey S., Dunbrack R., Recio J. F., Fraternali F., Gibson T., Helmer Citterich M., Hoksza D., Hopf T., Jakubec D., Kannan N., Krivak R., Kumar M., Levy E. D., London N., Macias J. R., Srivatsan M. M., Marks D. S., Martens L., McGowan S. A., McGreig J. E., Modi V., Parra R. G., Pepe G., Piovesan D., Prilusky J., Putignano V., Radusky L. G., Ramasamy P., Rausch A. O., Reuter N., Rodriguez L. A., Rollins N. J., Rosato A., Rubach P., Serrano L., Singh G., Skoda P., Sorzano C. O. S., Stourac J., Sulkowska J. I., Svobodova R., Tichshenko N., Tosatto S. C. E., Vranken W., Wass M. N., Xue D., Zaidman D., Thornton J., Sternberg M., Orengo C., Velankar S.
المساهمون: Varadi, M, Anyango, S, Armstrong, D, Berrisford, J, Choudhary, P, Deshpande, M, Nadzirin, N, Nair, S, Pravda, L, Tanweer, A, Al-Lazikani, B, Andreini, C, Barton, Gj, Bednar, D, Berka, K, Blundell, T, Brock, Kp, Carazo, Jm, Damborsky, J, David, A, Dey, S, Dunbrack, R, Recio, Jf, Fraternali, F, Gibson, T, Helmer Citterich, M, Hoksza, D, Hopf, T, Jakubec, D, Kannan, N, Krivak, R, Kumar, M, Levy, Ed, London, N, Macias, Jr, Srivatsan, Mm, Marks, D, Martens, L, Mcgowan, Sa, Mcgreig, Je, Modi, V, Parra, Rg, Pepe, G, Piovesan, D, Prilusky, J, Putignano, V, Radusky, Lg, Ramasamy, P, Rausch, Ao, Reuter, N, Rodriguez, La, Rollins, Nj, Rosato, A, Rubach, P, Serrano, L, Singh, G, Skoda, P, Sorzano, Co, Stourac, J, Sulkowska, Ji, Svobodova, R, Tichshenko, N, Tosatto, Sce, Vranken, W, Wass, Mn, Xue, D, Zaidman, D, Thornton, J, Sternberg, M, Orengo, C, Velankar, S
مصطلحات موضوعية: Europe, Gene Ontology, Humans, Internet, Knowledge Bases, Models, Molecular, Molecular Sequence Annotation, Mutation, Phosphorylation, Protein Conformation, Proteins, Structure-Activity Relationship, Databases, Protein, Protein Processing, Post-Translational, User-Computer Interface, Settore BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/34755867; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/wos/WOS:000743496700065; volume:50; issue:D1; firstpage:D534; lastpage:D542; journal:NUCLEIC ACIDS RESEARCH; http://hdl.handle.net/2108/293527; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/scopus/2-s2.0-85125170185; https://academic.oup.com/nar/article/50/D1/D534/6424755?login=false
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11Academic Journal
المؤلفون: Sorzano, Carlos O. S, Vilas Prieto, José Luis, Ramírez Aportela, Erney, Krieger, J., Hoyo, D. del, Herreros, David, Fernández Giménez, Estrella, Marchán, D., Macías, J. R., Sánchez, I., Caño, L. del, Fonseca Reyna, Y., Conesa, A., García Mena, A., Burguet Castell, Jordi, García Condado, J., Méndez García, J., Martínez, M., Muñoz Barrutia, A., Marabini, R., Vargas Balbuena, Javier, Carazo, J. M.
مصطلحات موضوعية: Local resolution, Electron, EM, Model, Reproducibility, Orientation, Óptica (Física), 2209.19 Óptica Física
Time: 535
وصف الملف: application/pdf
Relation: (EOSC-Life (824087); EOSC-synergy (857647); HighResCells (810057); IMpaCT (857203); iNEXT-Discovery (871037); EnLaCES (MSCA-101024130)); IMPaCT-Data (IMP 00019); (PID2019-108850RA-I00; PID2019-109820RB-I00; PID2019-104757RB-I00; PRE2020 - 093527); S2017/BMD-3817; http://dx.doi.org/10.1039/d2fd00059h; https://pubs.rsc.org; https://hdl.handle.net/20.500.14352/71859
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12Academic Journal
المؤلفون: Vilas, J. L., Oton, J., Messaoudi, C., Melero, R., Conesa, P., Ramirez-Aportela, E., Mota, J., Martinez, M., Jimenez, A., Marabini Ruiz, Roberto, Carazo, J. M., Vargas, J., Sorzano, C. O.S.
المساهمون: UAM. Departamento de Ingeniería Informática
مصطلحات موضوعية: Cryoem, Electron tomography, Image processing, Local resolution, Informática
وصف الملف: application/pdf
Relation: Journal of Structural Biology: X; http://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2019.100016; Gobierno de España. BIO2016- 76400-R; Comunidad de Madrid. S2017/BMD-3817/TomoXliver-CM; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/739563/EU/EOSCpilot; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/731005/EU/INSTRUCT-ULTRA; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/824087/EU/EOSC-LIFE; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/810057/ERC/HighResCells; Journal of Structural Biology: X 4(2020): 100016; http://hdl.handle.net/10486/702881; 100016-1; 100016-8
الاتاحة: http://hdl.handle.net/10486/702881
https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2019.100016 -
13Academic Journal
المؤلفون: Jiménez-Moreno, A., Del Caño, L., Martínez, M., Ramírez-Aportela, E., Cuervo, A., Melero, R., Sánchez-García, R., Strelak, D., Fernández-Giménez, E., de Isidro-Gómez, F. P., Herreros, D., Conesa, P., Fonseca, Y., Maluenda, D., Jiménez de la Morena, J., Macías, J. R., Losana, P., Marabini Ruiz, Roberto, Carazo, J. M., Sorzano, C. O.S.
المساهمون: UAM. Departamento de Ingeniería Informática
مصطلحات موضوعية: Cryo-electron microscop, macromolecul, near-atomic resolution, Scipion, Informática
وصف الملف: application/pdf
Relation: Journal of Visualized Experiments. JoVE; https://doi.org/10.3791/62261; Journal of Visualized Experiments. JoVE 171 (2021): e62261; http://hdl.handle.net/10486/697520; 171
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14Academic Journal
المؤلفون: Peschiera I., Giuliani M., Giusti F., Melero R., Paccagnini E., Donnarumma D., Pansegrau W., Carazo J. M., Sorzano C. O. S., Scarselli M., Masignani V., Liljeroos L. J., Ferlenghi I.
المساهمون: Peschiera, I., Giuliani, M., Giusti, F., Melero, R., Paccagnini, E., Donnarumma, D., Pansegrau, W., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S., Scarselli, M., Masignani, V., Liljeroos, L. J., Ferlenghi, I.
مصطلحات موضوعية: Cryoelectron microscopy, Cryoelectron tomography, Meningitis
وصف الملف: ELETTRONICO
Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/31263785; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/wos/WOS:000473750300001; volume:2; issue:1; firstpage:1; lastpage:9; numberofpages:9; journal:COMMUNICATIONS BIOLOGY; http://hdl.handle.net/11365/1082076; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/scopus/2-s2.0-85070987465; nature.com/commsbio/
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15Academic Journal
المؤلفون: Marabini Ruiz, Roberto, Kazemi, M, Sorzano, C.O.S, Carazo, J. M
المساهمون: UAM. Departamento de Ingeniería Informática, Tratamiento de Señales Biomédicas (ING EPS-011)
مصطلحات موضوعية: Structural biology, Electron microscopy, 3D reconstruction, High-resolution, Benchmarking, Challenge, Informática
وصف الملف: application/pdf
Relation: Journal of Structural Biology; https://doi.org/10.1016/j.jsb.2018.09.009; Gobierno de España. BIO2013-44647-R; Gobierno de España. BIO2016-76400-R; Gobierno de España. AEI/FEDER BFU 2016 74868P; Comunidad de Madrid. S2017/BMD-3817; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/654248; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/654142; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/675858; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/676559; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/653706; Journal of Structural Biology 204.3 (2018): 527-542; 1047-8477 (print); 1095-8657 (online); http://hdl.handle.net/10486/691640; 527; 542; 204
الاتاحة: http://hdl.handle.net/10486/691640
https://doi.org/10.1016/j.jsb.2018.09.009 -
16Academic Journal
المؤلفون: Sorzano, C. O. S, Jiménez, A, Mota, J, Vilas, J. L, Maluenda, D, Martínez, M, Ramírez-Aportela, E, Segura, J, Sánchez-García, R, Rancel, Y, Del Caño, L, Conesa, P, Melero, R, Vargas, J, Cazals, F, Marabini, R, Carazo, J. M, Majtner, T, Freyberg, Z, Krieger, J, Jonic, S, Bahar, I
المساهمون: UAM. Departamento de Ingeniería Informática, Tratamiento de Señales Biomédicas (ING EPS-011)
مصطلحات موضوعية: Electron microscopy, Image processing, Continuous heterogeneity, Single-particle analysis, Normal-mode analysis, Informática
وصف الملف: application/pdf
Relation: Acta Crystallographica Section F; https://doi.org/10.1107/S2053230X18015108; Comunidad de Madrid. S2017/BMD-3817; Gobierno de España. BIO2013-44647-R; Comunidad de Madrid. BIO2016-76400-R; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/675858; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/654248; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/676559; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/653706; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/739563; Acta Crystallographica Section F- Structural Biology Communications F75(2019): 19–32; http://hdl.handle.net/10486/689991; 19; 32; F75
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17Electronic Resource
المؤلفون: Carmona Saez, P., Pascual Marqui, R. D., Tirado Fernández, Francisco, Carazo, J. M., Pascual Montano, Alberto
مصطلحات الفهرس: 004, Gastrointestinal stromal tumors, Self-organizing maps, Normal human tissues, Kinase-c-theta, Microarray data, Identification, Discovery, Patterns., Informática (Informática), 1203.17 Informática, journal article
URL:
https://hdl.handle.net/20.500.14352/51560 http://www.biomedcentral.com/
GR/SAL/0653/2004
CICYT BFU2004-00217/BMC
GEN2003-20235-c05-05
TIN2005-5619
PR27/05-13964-BSCH
CSIC- 050402040003 -
18Academic Journal
المؤلفون: Segura, Joan, Sanchez-Garcia, Ruben, Sorzano, C O S, Carazo, J M
المساهمون: Valencia, Alfonso, Ministerio de Economía, Industria y Competitividad, Gobierno de España, Comunidad de Madrid, Instituto de Salud Carlos III, INB, Horizon 2020, Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, Gobierno de España, Ministerio de Educación, Cultura y Deporte
المصدر: Bioinformatics ; volume 35, issue 18, page 3512-3513 ; ISSN 1367-4803 1367-4811
مصطلحات موضوعية: Computational Mathematics, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Molecular Biology, Biochemistry, Statistics and Probability
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19Academic Journal
المؤلفون: Vilas, J. L., Tabassum, N., Mota, J., Maluenda Niubó, David, Jiménez-Moreno, Amaya, Majtner, T., Carazo, J. M., Acton, S. T., Sorzano, C. O. S.
المصدر: Articles publicats en revistes (Física Aplicada)
مصطلحات موضوعية: Microscòpia electrònica, Algorismes, Electron microscopy, Algorithms
وصف الملف: 55 p.; application/pdf
Relation: Versió postprint del document publicat a: https://doi.org/10.1016/j.sbi.2018.11.004; Current Opinion in Structural Biology, 2018, vol. 52, p. 127-145; https://doi.org/10.1016/j.sbi.2018.11.004; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/653706/EU//iNEXT; http://hdl.handle.net/2445/178454; 710025
الاتاحة: http://hdl.handle.net/2445/178454
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20Academic Journal
المؤلفون: Sanchez-Garcia, Ruben, Sorzano, C O S, Carazo, J M, Segura, Joan
المساهمون: Valencia, Alfonso, Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Economía y Competitividad, Horizon 2020 Framework Programme, Comunidad Autónoma de Madrid, Ministerio de Educación, Cultura y Deporte
المصدر: Bioinformatics ; volume 35, issue 3, page 470-477 ; ISSN 1367-4803 1367-4811