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  1. 1
    Academic Journal
    Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD) に基づくタンパク質の遷移経路探索

    المؤلفون: 保田 拓範, 原田 隆平

    المصدر: アンサンブル / Ensemble. 2023, 25(1):19

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  2. 2
    Academic Journal
    「相分離生物学」にあたって

    المؤلفون: 原田 隆平

    المصدر: アンサンブル / Ensemble. 2022, 24(4):191

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  3. 3
    Academic Journal
    4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (HPPD)における金属活性中心の力場パラメータの構築とその評価 / Building and Evaluating Force Field Parameters around Transition Metal-including Active Site in 4-Hydroxyphenylpyruvate Dioxygenase (HPPD)

    المؤلفون: HENGPHASATPORN Kowit, Kowit HENGPHASATPORN, Ryuhei HARADA, Yasuteru SHIGETA, Yohei MUNEI, Yuta HORI, 原田 隆平, 堀 優太, 宗井 陽平, 重田 育照

    المصدر: Journal of Computer Chemistry, Japan. 2022, 21(4):82

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  4. 4
    Academic Journal
    Investigation of Computational Methods for Membrane Permeability of Middle-Sized Molecules / 中分子の膜透過性に対する計算手法の検討

    المؤلفون: Hengphasatporn Kowit, K. HENGPHASATPORN, R. HARADA, T. TAKAHASHI, Y. SHIGETA, 原田 隆平, 重田 育照, 高橋 輝行

    المصدر: Journal of Computer Chemistry, Japan. 2022, 21(4):118

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  5. 5
    Academic Journal
    学術賞受賞寄稿「タンパク質の機能発現に重要なレアイベントを抽出するサンプリング手法の開発」

    المؤلفون: 原田 隆平

    المصدر: アンサンブル / Ensemble. 2020, 22(1):1

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  6. 6
    Academic Journal
    Membrane Permeability from Solvation Free Energy Calculation of Cyclic Dipeptide (CDP) / 環状ペプチドの膜透過における溶媒和自由エネルギー計算

    المؤلفون: Kohki YANAGI, Ryuhei HARADA, Yasuteru SHIGETA, Yuki MITSUTA, 原田 隆平, 栁 昂輝, 満田 祐樹, 重田 育照

    المصدر: Journal of Computer Chemistry, Japan. 2020, 19(4):125

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  7. 7
    Academic Journal
    Rare Event Sampling of Biomolecules Based on Distributed Computing / 分散型シミュレーションを用いて生体分子のレアイベントを捉える

    المؤلفون: Ryuhei Harada, 原田 隆平

    المصدر: 日本物理学会誌 / Butsuri. 2020, 75(1):28


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  8. 8
    Academic Journal
    Studies of molecular crowding by simulations and development of parallel cascade selection molecular dynamics / 分子混雑のシミュレーション研究とカスケード選択型分子動力学シミュレーションの開発

    المؤلفون: Ryuhei Harada, 原田 隆平

    المصدر: Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan. 2019, :3083

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  9. 9
    Academic Journal
    Developments of Rare Event Sampling Methods for Proteins / レアイベントサンプリング法の開発と応用研究

    المؤلفون: Ryuhei HARADA, Vladimir SLADEK, Vladimir Sladek, Yasuteru SHIGETA, 原田 隆平, 重田 育照

    المصدر: Journal of Computer Chemistry, Japan. 2019, 18(5):199

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  10. 10
    Academic Journal
    Analyses on Dynamical Ordering of Protein Functions by Means of Cascade Selection Molecular Dynamics / カスケード選択型分子動力学法によるタンパク質機能の動的秩序解析

    المؤلفون: Ryuhei HARADA, Yasuteru SHIGETA, 原田 隆平, 重田 育照

    المصدر: Journal of Computer Chemistry, Japan. 2018, 17(1):46

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  11. 11
    Academic Journal
    Structure refinement and prediction by data-driven molecular dynamics simulations / データ駆動型分子動力学法による構造細密化と遷移構造探索

    المؤلفون: Ryuhei Harada, Yasuteru Shigeta, 原田 隆平, 重田 育照

    المصدر: Proceedings of the Symposium on Chemoinformatics. 2018, :2


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  12. 12
    Academic Journal
    Free energy calculation method based on the parallel cascade selection molecular dynamics simulation combined with Markov state model / カスケード型並列分子動力学シミュレーションとマルコフ状態モデルを併用したタンパク質の自由エネルギー計算

    المؤلفون: Ryuhei Harada, Yasuteru Shigeta, 原田 隆平, 重田 育照

    المصدر: Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan. 2018, :2525

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  13. 13
    Academic Journal
    Molecular Dynamics studies on the effects of Antifreezing Protein from Rhagium inquisitor (RiAFP) on Ice Growth / 分子動力学シミュレーションによる不凍タンパク質RiAFPの氷の結晶成長に及ぼす影響の解析

    المؤلفون: Masato KIMATSUKA, Mitsuo SHOJI, Ryuhei HARADA, Ryuma SATO, Yasuteru SHIGETA, 佐藤 竜馬, 原田 隆平, 庄司 光男, 木間塚 政人, 重田 育照

    المصدر: Journal of Computer Chemistry, Japan. 2018, 17(5):222

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  14. 14
    Academic Journal
    Developments of Efficient Conformational Sampling Methods for Reproducing and Predicting Biologically Relevant Rare Events of Proteins / 生物学的レアイベントを再現予測するタンパク質構造サンプリング手法の開発

    المؤلفون: Ryuhei Harada, Yasuteru Shigeta, 原田 隆平, 重田 育照

    المصدر: Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan. 2018, :3010

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  15. 15
    Academic Journal
    Smart IAS Engineering for Next Generation LNG Carriers / 次世代LNG船に向けたIASエンジニアリングについて - Projectリスクの効果的低減を考える

    المؤلفون: Kei Yamasaki, Kentaro Tohi, Ryuuhei Harada, Tetsuya Hiraki, 原田 隆平, 土肥 賢大郎, 山崎 圭, 開 哲也

    المصدر: マリンエンジニアリング / Marine Engineering. 2017, 52(1):77


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  16. 16
    Academic Journal
    最近の研究から「カスケード型超並列シミュレーションに基づく遷移経路探索法」

    المؤلفون: 原田 隆平

    المصدر: アンサンブル / Ensemble. 2016, 18(3):159

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  17. 17
    Academic Journal
    30pAA-7 Free energy calculation of protein conformational changes using parallel cascade selection molecular dynamics and Markov state model / 30pAA-7 Parallel cascade selection molecular dynamicsとMarkov state modelを用いたタンパク質構造変化の自由エネルギー計算(30pAA 生物物理3,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理))

    المؤلفون: A. Kitao, N. Wakai, R. Harada, Y. Nishihara, 北尾 彰朗, 原田 隆平, 若井 信彦, 西原 泰孝

    المصدر: Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan. 2014, :437

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  18. 18
    Academic Journal
    Molecular Simulation Methods to Enhance Soft Protein Motions / タンパク質の柔らかな運動を誘起する分子シミュレーション

    المؤلفون: Akio KITAO, Ryuhei HARADA, 北尾 彰朗, 原田 隆平

    المصدر: 生物物理 / Seibutsu Butsuri. 2014, 54(3):167

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  19. 19
    Academic Journal
    Hydration and Protein Stability under Cellular Environments / 細胞環境における水和構造とタンパク質の構造安定性

    المؤلفون: Ryuhei HARADA, 原田 隆平

    المصدر: 生物物理 / Seibutsu Butsuri. 2013, 53(4):216

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  20. 20
    Academic Journal
    超並列マルチスケールシミュレーションMSFEL法で探る生体分子の自由エネルギー地形

    المؤلفون: 原田 隆平

    المصدر: アンサンブル / Ensemble. 2013, 15(1):61

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