-
1Academic Journal
المؤلفون: L. N. Yashina, N. A. Smetannikova, N. I. Zdanovskaya, D. N. Poleshchuk, A. S. Lapin, A. G. Koval’sky, Л. Н. Яшина, Н. А. Сметанникова, Н. И. Здановская, Д. Н. Полещук, А. С. Лапин, А. Г. Ковальский
المساهمون: The study was carried out within the framework of the State assignment of the Rospotrebnadzor SA-8/21., Исследование выполнено в рамках Государственного задания Роспотребнадзора ГЗ -8/21.
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 3 (2024); 170-177 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 3 (2024); 170-177 ; 2658-719X ; 0370-1069
مصطلحات موضوعية: Россия, Seoul virus, Rattus norvegicus, hemorrhagic fever with renal syndrome, Khabarovsk, Russia, вирус Сеул, ГЛПС, Хабаровск
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2057/1514; Jonsson C.B., Figueiredo L.T., Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin. Microbiol. Rev. 2010; 23(2):412–41. DOI:10.1128/CMR.00062-09.; Tkachenko E.A., Ishmukhamedov A.A., Dzagurova T.K., Bernshtein A.D., Morozov V.G., Siniugina A.A., Kurashova S.S., Balkina A.S., Tkachenko P.E., Kruger D.H., Klempa B. Hemorrhagic fever with renal syndrome, Russia. Emerg. Infect. Dis. 2019; 25(12):2325–8. DOI:10.3201/eid2512.181649.; Klempa B., Tkachenko E.A., Dzagurova T.K., Yunicheva Y.V., Morozov V.G., Okulova N.M., Slyusarenko G.P., Smirnov A., Kruger D.H. Hemorrhagic fever with renal syndrome caused by 2 lineages of Dobrava hantavirus, Russia. Emerg. Inf. Dis. 2008; 14(4):617–25. DOI:10.3201/eid1404.071310.; Слонова Р.А., Кушнарева Т.В., Компанец Г.Г., Максема И.Г., Симонова Т.Л., Симонов С.Б. Хантавирусная инфекция в Приморском крае – эпидемиологическая ситуация в очагах циркуляции разных серотипов вируса. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2006; S3:74–7.; Yashina L.N., Patrushev N.A., Ivanov L.I., Slonova R.A., Mishin V.P., Kompanez G.G., Zdanovskaya N.I., Kuzina I.I., Safronov P.F., Chizhikov V.E., Schmaljohn С., Netesov S.V. Genetic diversity of hantaviruses associated with hemorrhagic fever with renal syndrome in the Far East of Russia. Virus Res. 2000; 70(1-2):31–44. DOI:10.1016/s0168-1702(00)00203-3.; Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Компанец Г.Г., Здановская Н.И., Иванов Л.И. Молекулярная эпидемиология патогенных хантавирусов на Дальнем Востоке России, 2015–2018 гг. Проблемы особо опасных инфекций. 2019; 4:102–8. DOI:10.21055/0370-1069-2019-4-102-108.; Lin X.D., Guo W.P., Wang W., Zou Y., Hao Z.Y., Zhou D.J., Dong X., Qu Y.G., Li M.H., Tian H.F., Wen J.F., Plyusnin A., Xu J., Zhang Y.Z. Migration of Norway rats resulted in the worldwide distribution of Seoul hantavirus today. J. Virol. 2012; 86(2):972–81. DOI:10.1128/JVL00725-11.; Clement J., LeDuc J.W., Lloyd G., Reynes J.-M., McElhinney L., Van Ranst M., Lee H.-W. Wild rats, laboratory rats, pet rats: global Seoul hantavirus disease revisited. Viruses. 2019; 11(7):652. DOI:10.3390/v11070652.; Clement J., LeDuc J.W., McElhinney L.M., Reynes J.M., Van Ranst M., Calisher C.H. Clinical characteristics of ratborne Seoul hantavirus disease. Emerg. Infect. Dis. 2019; 25(2):387–8. DOI:10.3201/eid2502.181643.; Plyusnina A., Heyman P., Baert K., Stuyck J., Cochez C., Plyusnin A. Genetic characterization of Seoul hantavirus originated from Norway rats (Rattus norvegicus) captured in Belgium. J. Med. Virol. 2012; 84(8):1298–303. DOI:10.1002/jmv.23321.; Reynes J.M., Carli D., Bour J.B., Boudjeltia S, Dewilde A., Gerbier G., Nussbaumer T., Jacomo V., Rapt M.P., Rollin P.E., Septfons A. Seoul virus infection in humans, France, 2014–2016. Emerg. Infect. Dis. 2017; 23(6):973–7. DOI:10.3201/eid2306.160927.; Dupinay T., Pounder K.C., Ayral F., Laaberki M.H., Marston D.A., Lacôte S., Rey C., Barbet F., Voller K., Nazaret N., Artois M., Marianneau P., Lachuer J., Fooks A.R., Pépin M., Legras-Lachuer C., McElhinney L.M. Detection and genetic characterization of Seoul virus from commensal brown rats in France. Virol. J. 2014; 11:32. DOI:10.1186/1743-422X-11-32.; Слонова Р.А., Компанец Г.Г., Подогова Л.М., Астахова Т.И., Перминова Л.А., Хоменко Т.В., Трофимчук Г.Д., Тимофеев А.А., Шереметьев И.С., Иванис В.А., Сокотун О.А. Циркуляция хантавируса Сеул в популяциях синантропных грызунов и его значение в заболеваемости геморрагической лихорадкой с почечным синдромом в Приморском крае. Вопросы вирусологии.1999; 5:213–7.; Марунич Н.А., Гавриловская И.Н., Горбачкова Е.А., Апекина Н.С., Фигурнов В.А., Якунин К.Ф., Бурлакова Н.Г., Лопатин А.И. Заболевания геморрагической лихорадкой с почечным синдромом в Амурской области, связанные с крысиным серотипом вируса. Журнал микробиологии эпидемиологии иммунобиологии. 1990; 3:48–52.; Иванов Л.И., Здановская Н.И., Ткаченко Е.А., Резапкин Г.В., Рыльцева Е.В., Гапонова Л.К., Воробьева Р.Н., Волков В.И. Ареал и природные резервуары вируса геморрагической лихорадки с почечным синдромом на Дальнем Востоке СССР. Вопросы вирусологии. 1989; 34(5):595–8.; Yashina L.N., Hay J., Smetannikova N.A., Kushnareva T.V., Iunikhina O.V., Kompanets G.G. Hemorrhagic fever with renal syndrome in Vladivostok city, Russia. Front. Public Health. 2021; 9:620279. DOI:10.3389/fpubh.2021.620279.; Kariwa H., Yoshikawa K., Tanikawa Y., Seto T., Sanada T., Saasa N., Ivanov L.I., Slonova R., Zakharycheva T.A., Nakamura I., Yoshimatsu K., Arikawa J., Yoshii K., Takashima I. Isolation and characterization of hantaviruses in Far East Russia and etiology of hemorrhagic fever with renal syndrome in the region. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2012; 86(3):545–53. DOI:10.4269/ajtmh.2012.11-0297.; Klempa B., Fichet-Calvet E., Lecompte E., Auste B., Aniskin V., Meisel H., Denys C., Koivogui L., ter Meulen J., Krüger D.H. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12(5):838–40. DOI: 10/3201/eid1205.051487.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2057
-
2Academic Journal
المؤلفون: L. N. Yashina, S. A. Abramov, N. A. Smetannikova, B. S. Malyshev, A. V. Krivopalov, T. A. Dupal, Л. Н. Яшина, С. А. Абрамов, Н. А. Сметанникова, Б. С. Малышев, А. В. Кривопалов, Т. А. Дупал
المساهمون: Результаты исследования были получены при поддержке гранта Российского научного фонда № 22-24-00377.
المصدر: Acta Biomedica Scientifica; Том 8, № 6 (2023); 117-123 ; 2587-9596 ; 2541-9420
مصطلحات موضوعية: Сибирь, taxonomy, rodents, shrews, Siberia, таксономия, грызуны, насекомоядные
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/4497/2685; Drosten C, Günther S, Preiser W, van der Werf S, Brodt HR, Becker S, et al. Identification of a novel coronavirus in patients with severe acute respiratory syndrome. N Engl J Med. 2003; 348(20): 1967-1976. doi:10.1056/NEJMoa030747; Bermingham A, Chand MA, Brown CS, Aarons E, Tong C, Langrish C, et al. Severe respiratory illness caused by a novel coronavirus, in a patient transferred to the United Kingdom from the Middle East, September 2012. Euro Surveill. 2012; 17(40): 20290.; Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Song ZG, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature. 2020; 579: 265-269. doi:10.1038/s41586-020-2008-3; Guan Y, Zheng BJ, He YQ, Liu XL, Zhuang ZX, Cheung CL, et al. Isolation and characterization of viruses related to the SARS coronavirus from animals in southern China. Science. 2003; 302(5643): 276-278. doi:10.1126/science.1087139; Lau SK, Woo PC, Li KS, Huang Y, Tsoi HW, Wong BH, et al. Severe acute respiratory syndrome coronavirus-like virus in Chinese horseshoe bats. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005; 102(39): 14040-14045. doi:10.1073/pnas.0506735102; Mohd HA, Al-Tawfiq JA, Memish ZA. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) origin and animal reservoir. Virol J. 2016; 13: 87. doi:10.1186/s12985-016-0544-0; Hu B, Zeng LP, Yang XL, Ge XY, Zhang W, Li B, et al. Discovery of a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights into the origin of SARS coronavirus. PLoS Pathog. 2017; 13(11): e1006698. doi:10.1371/journal.ppat.1006698; Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020; 579(7798): 270-273. doi:10.1038/s41586-020-2012-7; Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat Rev Microbiol. 2019; 17(3): 181-192. doi:10.1038/s41579-018-0118-9; Singh J, Pandit P, McArthur AG, Banerjee A, Mossman K. Evolutionary trajectory of SARS-CoV-2 and emerging variants. Virol J. 2021; 18(1): 166. doi:10.1186/s12985-021-01633-w; Shi M, Lin XD, Chen X, Tian JH, Chen LJ, Li K, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature. 2018; 556(7700): 197-202. doi:10.1038/s41586-018-0012-7; Wang W, Lin XD, Guo WP, Zhou RH, Wang MR, Wang CQ, et al. Discovery, diversity and evolution of novel coronaviruses sampled from rodents in China. Virology. 2015; 474: 19-27. doi:10.1016/j.virol.2014.10.017; Monchatre-Leroy E, Boué F, Boucher JM, Renault C, Moutou F, Ar Gouilh M, et al. Identification of alpha and beta coronavirus in wildlife species in France: Bats, rodents, rabbits, and hedgehogs. Viruses. 2017; 9(12): 364. doi:10.3390/v9120364; Tsoleridis T, Chappell JG, Onianwa O, Marston DA, Fooks AR, Monchatre-Leroy E, et al. Shared common ancestry of rodent Alphacoronaviruses sampled globally. Viruses. 2019; 11(2): 125. doi:10.3390/v11020125; Wang W, Lin XD, Zhang HL, Wang MR, Guan XQ, Holmes EC, et al. Extensive genetic diversity and host range of rodent-borne coronaviruses. Virus Evol. 2020; 6(2): veaa078. doi:10.1093/ve/veaa078; Forni D, Cagliani R, Clerici M, Sironi M. Molecular evolution of human coronavirus genomes. Trends Microbiol. 2017; 25(1): 35-48. doi:10.1016/j.tim.2016.09.001; Wang W, Lin XD, Liao Y, Guan XQ, Guo WP, Xing JG, et al. Discovery of a highly divergent coronavirus in the Asian house shrew from China illuminates the origin of the alphacoronaviruses. J Virol. 2017. 91: e00764-17. doi:10.1128/JVI.00764-17; Alkhovsky S, Lenshin S, Romashin A, Vishnevskaya T, Vyshemirsky O, Bulycheva Y, et al. SARS-like coronaviruses in horseshoe bats (Rhinolophus spp.) in Russia, 2020. Viruses. 2022; 14(1): 113. doi:10.3390/v14010113; Seifert SN, Bai S, Fawcett S, Norton EB, Zwezdaryk KJ, Robinson J, et al. An ACE2-dependent Sarbecovirus in Russian bats is resistant to SARS-CoV-2 vaccines. PLoS Pathog. 2022; 18(9): e1010828. doi:10.1371/journal.ppat.1010828; Speranskaya AS, Artiushin IV, Samoilov AE, Korneenko EV, Khabudaev KV, Ilina EN, et al. Identification and genetic characterization of MERS-related coronavirus isolated from Nathusius’ pipistrelle (Pipistrellus nathusii) near Zvenigorod (Moscow Region, Russia). Int J Environ Res Public Health. 2023; 20(4): 3702. doi:10.3390/ijerph20043702; Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Панов В.В. Совместная циркуляция коронавирусов среди грызунов и насекомоядных. Проблемы особо опасных инфекций. 2023; 2: 167-172. doi:10.21055/0370-1069-2023-2-167-172; International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Taxonomy 2017. URL: http://talk.ictvonline.org/taxonomy [date of access: 10.06.2023].; Yashina LN, Abramov SA, Dupal TA, Danchinova GA, Malyshev BS, Hay J, et al. Hokkaido genotype of Puumala virus in the grey red-backed vole (Myodes rufocanus) and northern redbacked vole (Myodes rutilus) in Siberia. Infect Genet Evol. 2015; 33: 304-313. doi:10.1016/j.meegid.2015.05.021; Yashina LN, Abramov SA, Gutorov VV, Dupal TA, Krivopalov AV, Panov VV, et al. Seewis virus: Phylogeography of a shrewborne hantavirus in Siberia, Russia. Vector Borne Zoonotic Dis. 2010; 10(6): 585-591. doi:10.1089/vbz.2009.0154; https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/4497
-
3Academic Journal
المؤلفون: L. N. Yashina, N. A. Smetannikova, V. V. Panov, Л. Н. Яшина, Н. А. Сметанникова, В. В. Панов
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 2 (2023); 167-172 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 2 (2023); 167-172 ; 2658-719X ; 0370-1069
مصطلحات موضوعية: Сибирь, rodents, insectivores, Siberia, грызуны, насекомоядные
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1836/1395; Masters P., Perlman S. Coronaviridae. In: Knipe D.M., Cohen J.I., Griffin D.E., Lamb R.A., Martin M.A., Racaniello V.R., Roizman B., editors. Fields Virology. Vol. I. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, PA; 2013. P. 825–58.; International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Taxonomy 2017. (Cited 29 June 2022). [Internet]. Available from: http://talk.ictvonline.org/taxonomy.; Cui J., Li F., Shi Z.L. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat. Rev. Microbiol. 2019; 17(3):181–92. DOI:10.1038/s41579-018-0118-9.; Woo P.C., Lau S.K., Lam C.S., Lau C.C., Tsang A.K., Lau J.H., Bai R., Teng J.L., Tsang C.C., Wang M., Zheng B.J., Chan K.H., Yuen K.Y. Discovery of seven novel mammalian and avian coronaviruses in the genus deltacoronavirus supports bat coronaviruses as the gene source of alphacoronavirus and betacoronavirus and avian coronaviruses as the gene source of gammacoronavirus and deltacoronavirus. J. Virol. 2012; 86(7):3995–4008. DOI:10.1128/JVI.06540-11.; Zaki A.M., van Boheemen S., Bestebroer T.M., Osterhaus A.D., Fouchier R.A. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia. N. Engl. J. Med. 2012; 367(19):1814–20. DOI:10.1056/NEJMoa1211721.; Wu F., Zhao S., Yu B., Chen Y.M., Wang W., Song Z.G., Hu Y., Tao Z.W., Tian J.H., Pei Y.Y., Yuan M.L., Zhang Y.L., Dai F.H., Liu Y., Wang Q.M., Zheng J.J., Xu L., Holmes E.C., Zhang Y.Z. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature. 2020; 579(7798):265–9. DOI:10.1038/s41586-020-2008-3.; Wong A.C.P., Li X., Lau S.K.P., Woo P.C.Y. Global epidemiology of bat coronaviruses. Viruses. 2019; 11(2):174. DOI:10.3390/v11020174.; Hu B., Zeng L.P., Yang X.L., Ge X.Y., Zhang W., Li B., Xie J.Z., Shen X.R., Zhang Y.Z., Wang N., Luo D.S., Zheng X.S., Wang M.N., Daszak P., Wang L.F., Cui J., Shi Z.L. Discovery of a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights into the origin of SARS coronavirus. PLoS Pathog. 2017; 13(11):e1006698. DOI:10.1371/journal.ppat.1006698.; Guan Y., Zheng B.J., He Y.Q., Liu X.L., Zhuang Z.X., Cheung C.L., Luo S.W., Li P.H., Zhang L.J., Guan Y.J., Butt K.M., Wong K.L., Chan K.W., Lim W., Shortridge K.F., Yuen K.Y., Peiris J.S., Poon L.L. Isolation and characterization of viruses related to the SARS coronavirus from animals in southern China. Science. 2003; 302(5643):276–8. DOI:10.1126/science.1087139.; Li W., Shi Z., Yu M., Ren W., Smith C., Epstein J.H., Wang H., Crameri G., Hu Z., Zhang H., Zhang J., McEachern J., Field H., Daszak P., Eaton B.T., Zhang S., Wang L.F. Bats are natural reservoirs of SARS-like coronaviruses. Science. 2005; 310(5748):676–9. DOI:10.1126/science.1118391.; Alagaili A.N., Briese T., Mishra N., Kapoor V., Sameroff S.C., Burbelo P.D., de Wit E., Munster V.J., Hensley L.E., Zalmout I.S., Kapoor A., Epstein J.H., Karesh W.B., Daszak P., Mohammed O.B., Lipkin W.I. Middle East respiratory syndrome coronavirus infection in dromedary camels in Saudi Arabia. mBio. 2014; 5(2):e00884–14. DOI:10.1128/mBio.00884-14.; Jo W.K., de Oliveira-Filho E.F., Rasche A., Greenwood A.D., Osterrieder K., Drexler J.F. Potential zoonotic sources of SARS‑CoV‑2 infections. Transbound Emerg. Dis. 2021; 68(4):1824– 34. DOI:10.1111/tbed.13872.; Lam T.T., Jia N., Zhang Y.W., Shum M.H., Jiang J.F., Zhu H.C., Tong Y.G., Shi Y.X., Ni X.B., Liao Y.S., Li W., Jiang B.G., Wei W., Yuan T.T., Zheng K., Cui X.M., Li J., Pei G.Q., Qiang X., Cheung W.Y., Li L.F., Sun F.F., Qin S., Huang J.C., Leung G.M., Holmes E.C., Hu Y.L., Guan Y., Cao W.C. Identifying SARS‑CoV‑2-related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature. 2020; 583(7815):282–5. DOI:10.1038/s41586-020-2169-0.; Li X., Zai J., Zhao Q., Nie Q., Li Y., Foley B.T., Chaillon A. Evolutionary history, potential intermediate animal host, and crossspecies analyses of SARS‑CoV‑2. J. Med. Virol. 2020; 92(6): 602–11. DOI:10.1002/jmv.25731.; Lundstrom K., Seyran M., Pizzol D., Adadi P., Mohamed Abd El-Aziz T., Hassan S.S., Soares A., Kandimalla R., Tambuwala M.M., Aljabali A.A.A., Kumar Azad G., Pal Choudhury P., Uversky V.N., Sherchan S.P., Uhal B.D., Rezaei N., Brufsky A.M. Viewpoint: Origin of SARS‑CoV‑2. Viruses. 2020; 12(11):1203. DOI:10.3390/v12111203.; Corman V.M., Baldwin H.J., Tateno A.F., Zerbinati R.M., Annan A., Owusu M., Nkrumah E.E., Maganga G.D., Oppong S., Adu-Sarkodie Y., Vallo P., da Silva Filho L.V., Leroy E.M., Thiel V., van der Hoek L., Poon L.L., Tschapka M., Drosten C., Drexler J.F. Evidence for an ancestral association of human coronavirus 229E with bats. J. Virol. 2015; 89(23):11858–70. DOI:10.1128/JVI.01755-15.; Lin X.D., Wang W., Hao Z.Y., Wang Z.X., Guo W.P., Guan X.Q., Wang M.R., Wang H.W., Zhou R.H., Li M.H., Tang G.P., Wu J., Holmes E.C., Zhang Y.Z. Extensive diversity of coronaviruses in bats from China. Virology. 2017; 507:1–10. DOI:10.1016/j.virol.2017.03.019.; Wang W., Lin X.D., Guo W.P., Zhou R.H., Wang M.R., Wang C.Q., Ge S., Mei S.H., Li M.H., Shi M., Holmes E.C., Zhang Y.Z. Discovery, diversity and evolution of novel coronaviruses sampled from rodents in China. Virology. 2015; 474:19–27. DOI:10.1016/j. virol.2014.10.017.; Monchatre-Leroy E., Boué F., Boucher J.M., Renault C., Moutou F., Ar Gouilh M., Umhang G. Identification of alpha and beta coronavirus in wildlife species in France: bats, rodents, rabbits, and hedgehogs. Viruses. 2017; 9(12):364. DOI:10.3390/v9120364.; Tsoleridis T., Chappell J.G., Onianwa O., Marston D.A., Fooks A.R., Monchatre-Leroy E., Umhang G., Müller M.A., Drexler J.F., Drosten C., Tarlinton R.E., McClure C.P., Holmes E.C., Ball J.K. Shared common ancestry of rodent alphacoronaviruses sampled globally. Viruses. 2019; 11(2):125. DOI:10.3390/v11020125.; Wang W., Lin X.D., Liao Y., Guan X.Q., Guo W.P., Xing J.G., Holmes E.C., Zhang Y.Z. Discovery of a highly divergent coronavirus in the Asian house shrew from China illuminates the origin of the alphacoronaviruses. J. Virol. 2017; 91(17):e00764–17. DOI:10.1128/JVI.00764-17.; Wu Z., Lu L., Du J., Yang L., Ren X., Liu B., Jiang J., Yang J., Dong J., Sun L., Zhu Y., Li Y., Zheng D., Zhang C., Su H., Zheng Y., Zhou H., Zhu G., Li H., Chmura A., Yang F., Daszak P., Wang J., Liu Q., Jin Q. Comparative analysis of rodent and small mammal viromes to better understand the wildlife origin of emerging infectious diseases. Microbiome. 2018; 6(1):178. DOI:10.1186/s40168-018-0554-9.; Alkhovsky S., Lenshin S., Romashin A., Vishnevskaya T., Vyshemirsky O., Bulycheva Y., Lvov D., Gitelman A. SARS-like coronaviruses in horseshoe bats (Rhinolophus spp.) in Russia, 2020. Viruses. 2022; 14(1):113. DOI:10.3390/v14010113.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1836
-
4Academic Journal
المؤلفون: L. N. Yashina, T. V. Tregubchak, B. S. Malyshev, N. A. Smetannikova, I. V. Grishchenko, A. A. Dol’sky, A. N. Shvalov, A. V. Zaykovskaya, A. V. Kazantsev, V. N. Chekashov, T. Yu. Krasovskaya, Л. Н. Яшина, Т. В. Трегубчак, Б. С. Малышев, Н. А. Сметанникова, И. В. Грищенко, А. А. Дольский, А. Н. Швалов, А. В. Зайковская, А. В. Казанцев, В. Н. Чекашов, Т. Ю. Красовская
المساهمون: Исследование проводилось в рамках выполнения государственного задания ГЗ-7/16.
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 4 (2021); 150-156 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 4 (2021); 150-156 ; 2658-719X ; 0370-1069
مصطلحات موضوعية: Россия, hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS outbreak, Russia, геморрагическая лихорадка с почечным синдромом, вспышка ГЛПС
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1605/1267; Jonsson C.B., Figueiredo L.T., Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin. Microbiol. Rev. 2010; 23(2):412–41. DOI:10.1128/CMR.00062-09.; Clement J., LeDuc J.W., Lloyd G., Reynes J.M., McElhinney L., Van Rans M., Lee H.W. Wild rats, laboratory rats, pet rats: global Seoul hantavirus disease revisited. Viruses. 2019; 11(7):652. DOI:10.3390/v11070652.; Tkachenko E.A., Ishmukhametov A.A., Dzagurova T.K., Bernshtein A.D., Morozov V.G., Siniugina A.A., Kurashova S.S., Balkina A.S., Tkachenko P.E., Kruger D.H., Klempa B. Hemorrhagic fever with renal syndrome, Russia. Emerg. Infect. Dis. 2019; 25(12):2325–7. DOI:10.3201/eid2512.181649.; Савицкая Т.А., Иванова А.В., Исаева Г.Ш., Решетникова И.Д., Трифонов В.А., Зиатдинов В.Б., Серова И.В., Сафронов В.А. Оценка эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в мире и России, прогноз на 2020 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 2:62–70. DOI:10.21055/0370-1069-2020-2-62-70.; Reynes J.M., Carli D., Boukezia N., Debruyne M., Herti S. Tula hantavirus infection in a hospitalised patient, France, June 2015. Euro Surveill. 2015; 20(50). DOI:10.2807/1560-7917. ES.2015.20.50.30095.; Plyusnin A., Vapalahti O., Lankinen H., Lehvaslaiho H., Apekina N., Myasnikov Y., Kallio-Kokko H., Henttonen H., Lundkvist A., Brummer-Korvenkontio M., Gavrilovskaya I., Vaheri A. Tula virus: a newly detected hantavirus carried by European common voles. J. Virol. 1994; 68(12):7833–9. DOI:10.1128/JVI.68.12.7833-7839.1994.; Якименко В.В., Деконенко А.Е., Малькова М.Г., Кузьмин И.В., Танцев А.К., Дзагурова Т.К., Ткаченко Е.А. О распространении хантавирусов в Западной Сибири. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2000; 3:21–8.; Яшина Л.Н., Зайковская А.В., Протопопова Е.В., Бабкин И.В., Малышев Б.С., Товпинец Н.Н., Евстафьев И.Л. Хантавирус Тула на территории Крыма. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2015; 4:38–41.; Castel G., Chevenet F., Razzauti M., Murri S., Marianneau P., Cosson J.F., Tordo N., Plyusnin A. Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe. Viruses. 2019; 11(8):679. DOI:10.3390/v11080679.; Plyusnin A., Morzunov S.P. Virus evolution and genetic diversity of hantaviruses and their rodent hosts. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2001; 256:47–75. DOI:10.1007/978-3-642-56753-7_4.; Kariwa H., Yashimatsu K., Sawabe J., Yokota E., Arikawa J., Takashima I., Fukushima H., Lundkvist A., Shubin F.N., Isachkova L.M., Slonova R.A., Leonova G.N., Hashimoto N. Genetic diversities of hantaviruses among rodents in Hokkaido, Japan and Far East Russia. Virus Res. 1999; 59(2):219–28. DOI:10.1016/s0168-1702(98)00141-5.; Yashina L.N., Abramov S.A., Dupal T.A., Danchinova G.A., Malyshev B.S., Hay J., Gu S.H., Yanagihara R. Hokkaido genotype of Puumala virus in the grey red-backed vole (Myodes rufocanus) and northern red-backed vole (Myodes rutilus) in Siberia. Infect. Genet. Evol. 2015; 33:304–13. DOI:10.1016/j.meegid.2015.05.021.; Song K.J., Baek L.J., Moon S., Ha S.J., Kim S.H., Park K.S., Klein T.A., Sames W., Kim H.C., Lee J.S., Yanagihara R., Song J.W. Muju virus, a novel hantavirus harboured by the arvicolid rodent Myodes regulus in Korea. J. Gen. Virol. 2007; 88:3121–9. DOI:10.1099/vir.0.83139-0.; Ge X.Y., Yang W.H., Pan H., Zhou J.H., Han X., Zhu G.J., Desmond J.S., Daszak P., Shi Z.L., Zhang Y.Z. Fugong virus, a novel hantavirus harbored by the small oriental vole (Eothenomys eleusis) in China. Virol. J. 2016; 13:27–33. DOI:10.1186/s12985-016-0483-9.; Garanina S.B., Platonov A.E., Zhuravlev V.I., Murashkina A.N., Yakimenko V.V., Korneev A.G., Shipulin G.A. Genetic diversity and geographic distribution of hantaviruses in Russia. Zoon. Pub. Health. 2009; 56(6-7):297–309. DOI:10.1111/j.1863-2378.2008.01210.х.; Яшина Л.Н., Кузина И.И., Малышева Т.В., Иванов Л.И., Хасанова С.С. Применение амплификационной тест-системы для диагностики геморрагической лихорадки с почечным синдромом и изучения генотипов вирусов-возбудителей. Вестник Российской академии медицинских наук. 2004; 8:40–3.; Dekonenko A., Yakimenko V., Ivanov A., Morozov V., Nikitin P., Khasanova S., Dzagurova T., Tkachenko E., Schmaljohn C. Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin. Infect. Genet. Evol. 2003; 3:245–57.; Иванова А.В., Сафронов В.А., Попов Н.В., Кожанова О.И., Матвеева Н.И., Кресова У.А., Чумачкова Е.А., Поспелов М.В., Архипова Г.Н., Вяткин И.Н., Щербакова С.А., Кутырев В.В. Эпидемиологические особенности вспышки ГЛПС в Саратовской области 2019 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 2:78–85. DOI:10.21055/0370-1069-2020-2-78-85.; Klempa B., Fichet-Calvet E., Lecompte E., Auste B., Aniskin V., Meisel H., Denys C., Koivogui L., ter Meulen J., Krüger D.H. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12(5):838–40. DOI: 10/3201/eid1205.051487.; Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28(10):2731–9. DOI:10.1093/molbev/msr121.; Jaaskelainen K.M., Kaukinen P., Minskaya E.S., Plyusnina A., Vapalahti O., Elliott R.M., Weber F., Vaheri A., Plyusnin A. Tula and Puumala hantavirus NSs ORFs are functional and the products inhibit activation of the interferon-beta promoter. J. Med. Virol. 2007; 79(10):1527–36. DOI:10.1002/jmv.20948.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1605
-
5Academic Journal
المؤلفون: L. N. Yashina, N. A. Smetannikova, G. G. Kompanets, N. I. Zdanovskaya, L. I. Ivanov, Л. Н. Яшина, Н. А. Сметанникова, Г. Г. Компанец, Н. И. Здановская, Л. И. Иванов
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 4 (2019); 102-108 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 4 (2019); 102-108 ; 2658-719X ; 0370-1069 ; 10.21055/0370-1069-2019-4
مصطلحات موضوعية: Дальний Восток, HFRS, Far East, ГЛПС
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1221/1079; Jonsson C.B., Figueiredo L.T.M., Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin. Microbiol. Rev. 2010; 23(2):412-41. DOI:10.1128/CMR.00062-09.; Ткаченко Е.А., Бернштейн А.Д, Дзагурова Т.К., Башкирцев В.Н., Седова Н.С., Малкин А.Е., Горбачкова Е.А., Балакирев А.Е., Дроздов С.Г., Сикора И.В., Щукина И.А., Савельев С.И., Богатова И.С., Транквилевский Д.В., Чубирко М.И., Торубарова Е.С., Нургалеева Р.Г., Минин Г.Д., Загидуллин И.М., Иванова А.А., Жуков В.И., Морозов С.Г., Хайбулина С.Ф., Морзунов С.П. Сравнительный анализ эпидемических вспышек геморрагической лихорадки с почечным синдромом, вызванных вирусами Пуумала и Добрава/Белград. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2005; 4:28-34.; Klempa B., Tkachenko E.A., Dzagurova T.K., Yunicheva Y.V., Morozov V.G., Okulova N.M., Slyusarenko G.P., Smirnov A., Kruger D.H. Hemorrhagic fever with renal syndrome caused by 2 lineages of Dobrava hantavirus, Russia. Emerg. Inf Dis. 2008; 14(4):617-25. DOI:10.3201/eid1404.071310.; Слонова Р.А., Кушнарева Т.В., Компанец Г.Г., Максема И.Г., Симонова Т.Л., Симонов С.Б. Хантавирусная инфекция в Приморском крае - эпидемиологическая ситуация в очагах циркуляции разных серотипов вируса. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2006; S3:74-7.; Yashina L.N., Patrushev N.A., Ivanov L.I., Slonova R.A., Mishin V, Kompanez G.G., Zdanovskaya N.I., Kuzina I.I., Safronov P.F., Chizhikov V.E., Schmaljohn С., Netesov S.V. Genetic diversity of hantaviruses associated with hemorrhagic fever with renal syndrome in the Far East of Russia. Virus Res. 2000; 70(1-2):31-44. DOI:10.1016/s0168-1702(00)00203-3.; Yashina L., Mishin V, Zdanovskaya N., Schmaljohn C., Ivanov L. A newly discovered variant of a hantavirus in Apodemus peninsulae, Far Eastern Russia. Emerg. Infect. Dis. 2001; 7:912-913.; Kariwa H., Yoshimatsu K., Arikawa J. Hantavirus infection in East Asia. Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. 2007; 30(5-6): 341-56. DOI:10.1016/j.cimid.2007.05.011.; Zhang Y.Z., Zou Y, Yao L.S., Hu G.W., Du Z.S., Jin L.Z., Liu YY, Wang H.X., Chen X., Chen H.X., Fu Z.F. Isolation and characterization of hantaviruses carried by Apodemus peninsulae in Jilin, China. J. Gen. Virol. 2007; 88(Pt4):1295-331. DOI:10.1099/vir.0.82534-0.; Kariwa H., Yoshikawa K., Tanikawa Y, Seto T., Sanada T., Saasa N., Ivanov L.I., Slonova R., Zakharycheva T.A., Nakamura I., Yoshimatsu K., Arikawa J., Yoshii K., Takashima I. Isolation and characterization of hantaviruses in Far East Russia and etiology of hemorrhagic fever with renal syndrome in the region. Am. J. Prop. Med. Hyg. 2012; 86(3):545-53. DOI:10.4269/ajtmh.2012.11-0297; Maes P., Adkins S., Alkhovsky S.V, Avsic-Zupanc T., Ballinger M.J., Bente D.A., Beer M., Bergeron E., Blair C.D., Briese T., Buchmeier M.J., Burt F.J., Calisher C.H., Charrel R.N., Choi I.R., Clegg J.C.S., Juan Carlos de la Torre, Xavier de Lamballerie, DeRisi J.L., Digiaro M., Drebot M., Ebihara H., Elbeaino T., Ergunay K., Fulhorst C.F., Garrison A.R., Gao G.F., Gonzalez J.-P.J., Groschup M.H., Gunther S., Haenni A.-L., Hall R.A., Hewson R., Hughes H.R., Jain R.K., Jonson M.G., Junglen S., Klempa B., Klingslrom J., Kormelink R., Lambert A.J., S.A. Langevin, Lukashevich I.S., Marklewitz M., Giovanni P. Martelli, Mielke-Ehret N., Mirazimi A., Muhlbach H.-P, Naidu R., Nunes M.R.T., Palacios G., Papa A., Paw^ska J.T., Peters C.J., Plyusnin A.,. Radoshitzky S.R, Resende R.O., Romanowski V, Sall A.A., Salvato M.S., Sasaya T., Schmaljohn C., Shi X., Shirako Y, Simmonds P, Sironi M., Song J.-W., Spengler J.R., Stenglein M.D., Tesh R.B., Turina M., Wei T., Whitfield A.E., Yeh S.-D., Zerbini F.M., Zhang Y-Z., Zhou X., Kuhn J.H. Taxonomy of the order Bunyavirales: Second update 2018. Arch. Virol. 2019; 164(3):927-41. DOI:10.1007/s00705-018-04127-3.; Zou Y., Hu J., Wang Z.X., Wang D.M., Li M.H., Ren G.D., Duan Z.X., Fu Z.F., Plyusnin A., Zhang YZ. Molecular diversity and phylogeny of Hantaan virus in Guizhou, China: evidence for Guizhou as a radiation center of the present Hantaan virus. J. Gen. Virol. 2008; 89(Pt8):1987-97. DOI:10.1099/vir.0.2008/000497-0.; Слонова Р.А., Яшина Л.Н., Компанец Г.Г., Мишин В.А. Антигенная и генетическая характеристика штаммов вируса Сеул - возбудителя геморрагической лихорадки с почечным синдромом. Вопросы вирусологии. 2003; 48(3):10—4.; Honing J., Chizhikov V, Lundkvist A., Jonsson M., Ivanov A., Dekonenko A., Niklasson B., Dzagurova T., Peters C.J., Tkachenko E., Nichol S. Khabarovsk virus: a phylogenetically and serologically distinct hantavirus isolated from Microtus fortis trapped in far-east Russia. J. Gen. Virol. 1996; 77(Pt):687-94. DOI:10.1099/0022-1317-77-4-687.; Яшина Л.Н., Иванов Л.И., Слонова РА., Компанец Г.Г, Гуторов В.В., Кушнарева Т.В., Высочина Н.П., Абрамов С.А., Дупал Т.А., Пуховская Н.М., Здановская Н.И. Хантавирусы, циркулирующие в полевках Microtus fortis и Microtus maximowiczii. Тихоокеанский медицинский журнал. 2008; 2:47-9.; Zou Y, Wang J.B., Gaowa H.S., Yao L.S., Hu G.W., Li M.H., Chen H.X., Plyusnin A., Shao R., Zhang YZ. Isolation and genetic characterization of hantaviruses carried by Microtus voles in China. J. Med. Virol. 2008; 80(4):680-8. DOI:10.1002/jmv.21119.; Иванов Л.И., Здановская Н.И., Ткаченко Е.А., Резапкин Г.В., Рыльцева Е.В., Гапонова Л.К., Воробьева Р.Н., Волков В.И. Ареал и природные резервуары вируса геморрагической лихорадки с почечным синдромом на Дальнем Востоке России. Вопросы вирусологии. 1989; 34(5):595-8.; Kariwa H., Yashimatsu K., Sawabe J., Yokota E., Arikawa J., Takashima I., Fukushima H., Lundkvist A., Shubin F.N., Isachkova L.M., Slonova R.A., Leonova G.N., Hashimoto N. Genetic diversities of hantaviruses among rodents in Hokkaido, Japan and Far East Russia. Virus Res. 1999; 59(2):219-28. DOI:10.1016/s0168-1702-(98)00141-5.; Яшина Л.Н., Слонова РА., Олейник О.В., Кузина И.И., Кушнарева Т.В., Компанец Г.Г., Симонов С.Б., Симонова Т.Л., Морзунов С.П., Нетесов С.В. Новый генетический вариант вируса Пуумала в Приморье и его природный носитель, красносерая полевка Clethrionomys rufocanus. Вопросы вирусологии.; 49(6):34-8.; Zhang YZ. Discovery of hantaviruses in bats and insectivores and the evolution of the genus Hantavirus. Virus Res. 2014; 187:15-21.; Yashina L.N., Kartashov M.Yu., Wang W., Li K., Zdanovskaya N.I., Ivanov L.I., Zhang YZ. Co-circulation of distinct shrew-borne hantaviruses in the far east of Russia. Virus Res. 2019; 272:197717. DOI:10.1016/j.virusres.2019.197717.; Klempa B., Fichet-Calvet E., Lecompte E., Auste B., Aniskin V, Meisel H., Denys C., Koivogui L., Jan ter Meulen, Kruger D.H. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12:838-40. DOI: 10/3201/eid1205.051487.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1221