-
1Academic Journal
المؤلفون: I. V. Kuznetsova, D. A. Kovalev, S. V. Pisarenko, O. V. Bobrysheva, N. A. Shapakov, A. M. Zhirov, N. S. Safonova, D. G. Ponomarenko, A. A. Khachaturova, E. B. Zhilchenko, N. S. Serdyuk, A. N. Kulichenko, И. В. Кузнецова, Д. А. Ковалев, С. В. Писаренко, О. В. Бобрышева, Н. А. Шапаков, А. М. Жиров, Н. С. Сафонова, Д. Г. Пономаренко, А. А. Хачатурова, Е. Б. Жилченко, Н. С. Сердюк, А. Н. Куличенко
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 1 (2024); 154-161 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 1 (2024); 154-161 ; 2658-719X ; 0370-1069
مصطلحات موضوعية: филогения, whole genome sequencing, SNP analysis, phylogeny, полногеномное секвенирование, SNP-анализ
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1956/1461; Пономаренко Д.Г., Скударева О.Н., Хачатурова А.А., Лукашевич Д.Е., Жаринова И.В., Даурова А.В., Германова А.Н., Логвиненко О.В., Ракитина Е.Л., Костюченко М.В., Манин Е.А., Малецкая О.В., Куличенко А.Н. Бруцеллез: тенденции развития ситуации в мире и прогноз на 2022 г. в Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций. 2022; 2:36–45. DOI:10.21055/0370-1069-2022-2-36-45.; Ющук Н.Д., Венгеров Ю.Я., редакторы. Инфекционные болезни: национальное руководство. 3-е изд., перераб. и доп. М.: ГЭОТАР-Медиа; 2021. 1104 с. DOI:10.33029/9704-6122-8-INB2021-1-1104.; Al Dahouk S., Tomaso H., Prenger-Berninghoff E., Splettstoesser W.D., Scholz H.C., Neubauer H. Identification of Bruicella species and biotypes using polymerase chain reactionrestriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Crit. Rev. Microbiol. 2005; 31(4):191–6. DOI:10.1080/10408410500304041.; Kumari G., Doimari S., Suman Kumar M., Singh M., Singh D.K. MLVA typing of Brucella melitensis and B. abortus isolates of animal and human origin from India. Anim. Biotechnol. 2023; 34(2):375–83. DOI:10.1080/10495398.2021.1971685.; Sayour A.E., Elbauomy E., Abdel-Hamid N.H., Mahrous A., Carychao D., Cooley M.B., Elhadidy M. MLVA fingerprinting of Brucella melitensis circulating among livestock and cases of sporadic human illness in Egypt. Transbound. Emerg. Dis. 2020; 67(6):2435– 45. DOI:10.1111/tbed.13581.; Zhao Z.J., Li J.Q., Ma L., Xue H.M., Yang X.X., Zhao Y.B., Qin Y.M., Yang X.W., Piao D.R., Zhao H.Y., Tian G.Z., Li Q., Wang J.L., Tian G., Jiang H., Xu L.Q. Molecular characteristics of Brucella melitensis isolates from humans in Qinghai Province, China. Infect. Dis. Poverty. 2021; 10(1):42. DOI:10.1186/s40249-021-00829-0.; Piao D.R., Liu X., Di D.D., Xiao P., Zhao Z.Z., Xu L.Q., Tian G.Z., Zhao H.Y., Fan W.X., Cui B.Y., Jiang H. Genetic polymorphisms identify in species/biovars of Brucella isolated in China between 1953 and 2013 by MLST. BMC Microbiol. 2018; 18(1):7. DOI:10.1186/s12866-018-1149-0.; Shome R., Krithiga N., Shankaranarayana P.B., Jegadesan S., Udayakumar S.V., Shome B.R., Saikia G.K., Sharma N.K., Chauhan H., Chandel B.S., Jeyaprakash R., Rahman H. Genotyping of Indian antigenic, vaccine, and field Brucella spp. using multilocus sequence typing. J. Infect. Dev. Ctries. 2016; 10(3):237–44. DOI:10.3855/jidc.6617.; Whatmore A.M., Koylass M.S., Muchowski J., EdwardsSmallbone J., Gopaul K.K., Perret L.L. Extended multilocus sequence analysis to describe the global population structure of the genus Brucella: phylogeography and relationship to biovars. Front. Microbiol. 2016; 7:2049. DOI:10.3389/fmicb.2016.02049.; Ковалев Д.А., Кузнецова И.В., Жиров А.М., Сердюк Н.С., Жилченко Е.Б., Пономаренко Д.Г., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Куличенко А.Н. Генетическое типирование штаммов Brucella melitensis на основе анализа вариабельности INDEL-локусов. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2022; 12(1):81–6. DOI:10.18565/epidem.2022.12.1.81-6.; Moran-Gilad J. Whole genome sequencing (WGS) for food-borne pathogen surveillance and control-taking the pulse. Euro Surveill. 2017; 22(23):30547. DOI:10.2807/1560-7917.ES.2017.22.23.30547.; Besser J., Carleton H.A., Gerner-Smidt P., Lindsey R.L., Trees E. Next-generation sequencing technologies and their application to the study and control of bacterial infections. Clin. Microbiol. Infect. 2018; 24(4):335–41. DOI:10.1016/j.cmi.2017.10.013.; Collineau L., Boerlin P., Carson C.A., Chapman B., Fazil A., Hetman B., McEwen S.A., Parmley E.J., Reid-Smith R.J., Taboada E.N., Smith B.A. Integrating whole-genome sequencing data into quantitative risk assessment of foodborne antimicrobial resistance: a review of opportunities and challenges. Front. Microbiol. 2019; 10:1107. DOI:10.3389/fmicb.2019.01107.; Carriço J.A., Sabat A.J., Friedrich A.W., Ramirez M. Bioinformatics in bacterial molecular epidemiology and public health: databases, tools and the next-generation sequencing revolution. Euro Surveill. 2013; 18(4):20382. DOI:10.2807/ese.18.04.20382-en.; Janowicz A., De Massis F., Ancora M., Cammà C., Patavino C., Battisti A., Prior K., Harmsen D., Scholz H., Zilli K., Sacchini L., Di Giannatale E., Garofolo G. Core genome multilocus sequence typing and single nucleotide polymorphism analysis in the epidemiology of Brucella melitensis infections. J. Clin. Microbiol. 2018; 56(9):e00517-18. DOI:10.1128/JCM.00517-18.; Abdel-Glil M.Y., Thomas P., Brandt C., Melzer F., Subbaiyan A., Chaudhuri P., Harmsen D., Jolley K.A., Janowicz A., Garofolo G., Neubauer H., Pletz M.W. Core genome multilocus sequence typing scheme for improved characterization and epidemiological surveillance of pathogenic Brucella. J. Clin. Microbiol. 2022; 60(8):e0031122. DOI:10.1128/jcm.00311-22.; Tan K.K., Tan Y.C., Chang L.Y., Lee K.W., Nore S.S., Yee W.Y., Mat Isa M.N., Jafar F.L., Hoh C.C., AbuBakar S. Full genome SNP-based phylogenetic analysis reveals the origin and global spread of Brucella melitensis. BMC Genomics. 2015; 16(1):93. DOI:10.1186/s12864-015-1294-x.; Pisarenko S.V., Kovalev D.A., Volynkina A.S., Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Zharinova N.V., Khachaturova A.A., Tokareva L.E., Khvoynova I.G., Kulichenko A.N. Global evolution and phylogeography of Brucella melitensis strains. BMC Genomics. 2018; 19(1):353. DOI:10.1186/s12864-018-4762-2.; FastQC: A quality control tool for high throughput sequence data. 2010. [Электронный ресурс]. URL: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ (дата обращения 20.07.2023).; Bolger A.M., Lohse M., Usadel B. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. BioInformatics. 2014; 30(15):2114–20. DOI:10.1093/bioinformatics/btu170.; Gurevich A., Saveliev V., Vyahhi N., Tesler G. QUAST: quality assessment tool for genome assemblies. Bioinformatics. 2013; 29(8):1072–5. DOI:10.1093/bioinformatics/btt086.; Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evol. 2018; 35(6):1547–9. DOI:10.1093/molbev/msy096.; Letunic I., Bork P. Interactive Tree Of Life (iTOL): an online tool for phylogenetic tree display and annotation. Bioinformatics. 2007; 23(1):127–8. DOI:10.1093/bioinformatics/btl529.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1956
-
2Academic Journal
المؤلفون: D. V. Ul’shina, D. A. Kovalev, E. I. Eremenko, O. V. Semenova, A. G. Ryazanova, O. V. Bobrysheva, A. M. Zhirov, A. N. Kulichenko, Д. В. Ульшина, Д. А. Ковалев, Е. И. Еременко, О. В. Семенова, А. Г. Рязанова, О. В. Бобрышева, А. М. Жиров, А. Н. Куличенко
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 3 (2023); 147-155 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 3 (2023); 147-155 ; 2658-719X ; 0370-1069
مصطلحات موضوعية: белковое профилирование, MALDI-TOF MS, protein profiling
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1867/1418; Shadomy S., El Idrissi A., Raizman E., Bruni M., Palamara E., Pittiglio C., Lubroth J. Anthrax outbreaks: a warning for improved prevention, control and heightened awareness. Empres Watch. 2016; Vol. 37. [Электронный ресурс]. URL: http://www.fao.org/3/ai6124e.pdf (дата обращения 09.11.2020).; Попова А.Ю., Демина Ю.В., Ежлова Е.Б., Куличенко А.Н., Рязанова А.Г., Малеев В.В., Плоскирева А.А., Дятлов И.А., Тимофеев В.С., Нечепуренко Л.А., Харьков В.В. Вспышка сибирской язвы в Ямало-Ненецком автономном округе в 2016 году, эпидемиологические особенности. Проблемы особо опасных инфекций. 2016; 4:42–6. DOI:10.21055/0370-1069-2016-4-42-46.; Еременко Е.И., Рязанова А.Г., Писаренко С.В., Аксенова Л.Ю., Семенова О.В., Котенева Е.А., Цыганкова О.И., Ковалев Д.А., Головинская Т.М., Чмеренко Д.К., Куличенко А .Н. Сравнительный анализ методов генетического типирования Bacillus anthracis. Генетика. 2019; 55(1):40–51. DOI:10.1134/S0016675819010065.; Thierry S., Tourterel C., Le Flèche P., Derzelle S., Dekhil N., Mendy C., Colaneri C., Vergnaud G., Madani N. Genotyping of French Bacillus anthracis strains based on 31-loci multi locus VNTR analysis: epidemiology, marker evaluation, and update of the internet genotype database. PLoS One. 2014; 9(6):e95131. DOI:10.1371/journal.pone.0095131.; Lasch P., Jacob D., Grunow R., Schwecke T., Doellinger J. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDITOF) mass spectrometry (MS) for the identification of highly pathogenic bacteria. TrAC – Trends Anal. Chem. 2016; 85(Pt. 1):103–11. DOI:10.1016/j.trac.2016.04.013.; Teramoto K., Okubo T., Yamada Y., Sekiya S., Iwamoto S., Tanaka K. Classification of Cutibacterium acnes at phylotype level by MALDI-MS proteotyping. Proc. Jpn Acad., Ser. B. Phys. Biol. Sci. 2019; 95(10):612–23. DOI:10.2183/pjab.95.042.; Афанасьев М.В., Кравец Е.В., Такайшвили В.Е., Дугаржапова З.Ф., Балахонов С.В. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Bacillus anthracis, циркулирующих на территории Сибири и Дальнего Востока. В кн.: Актуальные проблемы эпидемиологии и профилактической медицины: Материалы VI Всерос. науч.-практ. конф. молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора (22–24 октября 2014 г., Ставрополь). Ставрополь: Экспо-Медиа; 2014. С. 53–4.; Wei J., Zhang H., Zhang H., Zhang E., Zhang B., Zhao F., Xiao D. Novel strategy for rapidly and safely distinguishing Bacillus anthracis and Bacillus cereus by use of peptide mass fingerprints based on matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J. Clin. Microbiol. 2020; 59(1):e02358-20. DOI:10.1128/JCM.02358-20.; Takahashi N., Nagai S., Fujita A., Ido Y., Kato K., Saito A., Moriya Y., Tomimatsu Y., Kaneta N., Tsujimoto Y., Tamura H. Discrimination of psychrotolerant Bacillus cereus group based on MALDI-TOF MS analysis of ribosomal subunit proteins. Food Microbiol. 2020; 91:103542. DOI:10.1016/j.fm.2020.103542.; Gibb S., Strimmer K. Mass spectrometry analysis using MALDIquant. In: Datta S., Mertens B., editors. Statistical Analysis of Proteomics, Metabolomics, and Lipidomics Data Using Mass Spectrometry. Springer International Publishing; 2017. P. 101–24. DOI:10.1007/978-3-319-45809-0_6.; Ульшина Д.В., Еременко Е.И., Ковалев Д.А., Рязанова А.Г., Кузнецова И.В., Аксенова Л.Ю., Семенова О.В., Бобрышева О.В., Сирица Ю.В., Куличенко А.Н. Выявление особенностей масс-спектров белковых экстрактов споровой и вегетативной форм возбудителя сибирской язвы методом времяпролетной масс-спектрометрии. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2018; 6:66–72. DOI:10.36233/0372-9311-2018-6-66-72.; Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y., Okinaka R.T., Hugh-Jones M.E., Ravel J., Zanecki S.R., Pearson T., Simonson T.S., U’Ren J.M., Kachur S.M., Leadem-Dougherty R.R., Rhoton S.D., Zinser G., Farlow J., Coker P.R., Smith K.L., Wang B., Kenefic L.J., Fraser-Liggett C.M., Wagner D.M., Keim P. Global genetic population structure of Bacillus anthracis. PLoS One. 2007; 2(5):e461. DOI:10.1371/journal.pone.0000461.; Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity. J. Clin. Microbiol. 1988; 26(11):2465–6. DOI:10.1128/jcm.26.11.2465-2466.1988.; Dybwad M., van der Laaken A.L., Blatny J.M., Paauw A. Rapid identification of Bacillus anthracis spores in suspicious powder samples by using matrix-assisted laser desorption ionizationtime of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). Appl. Environ. Microbiol. 2013; 79(17):5372–83. DOI:10.1128/AEM.01724-13.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1867
-
3Academic Journal
المؤلفون: N. V. Abzaeva, I. V. Kuznetsova, S. E. Gostischeva, A. M. Zhirov, D. A. Kovalev, A. V. Kostrominov, A. A. Fisun, G. F. Ivanova, Н. В. Абзаева, И. В. Кузнецова, С. Е. Гостищева, А. М. Жиров, Д. А. Ковалев, А. В. Костроминов, А. А. Фисун, Г. Ф. Иванова
المصدر: Biological Products. Prevention, Diagnosis, Treatment; Том 23, № 4 (2023); 560-569 ; БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение; Том 23, № 4 (2023); 560-569 ; 2619-1156 ; 2221-996X
مصطلحات موضوعية: бактериологический метод, live plague vaccine, quality control, number of live bacteria, percentage of live microbial cells, bacteriological method, вакцина чумная живая, контроль качества, количество живых микробных клеток
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://www.biopreparations.ru/jour/article/view/469/803; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/469/555; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/469/556; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/469/793; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/469/794; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/469/795; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/469/796; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/469/807; Касина ИВ, Ращепкин ЛИ, Горяев АА, Алексеева СА, Немировская ТИ, Мовсесянц АА. Оценка качества вакцины туляремийной живой по результатам испытаний в рамках обязательной сертификации. БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. 2016;16(4):253–9. EDN: UWBNNH; Fukui M, Takii S. Reduction of tetrazolium salts by sulfate-reducing bacteria. FEMS Microbiol Ecol. 1989;62(1):13–20. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.1989.tb03653.x; Bhupathiraju VK, Hernandez M, Landfear D, Alvarez-Cohen L. Application of a tetrazolium dye as an indicator of viability in anaerobic bacteria. J Microbiol Methods. 1999;37(3):231–43. https://doi.org/10.1016/s0167-7012(99)00069-x; Johnson MB, Criss AK. Fluorescence microscopy methods for determining the viability of bacteria in association with mammalian cells. J Vis Exp. 2013;(79):e50729. https://doi.org/10.3791/50729; Фихман БА. Иммерсионная микрорефрактометрия бактериальных клеток. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1963;(5).; Ломакина ГЮ, Модестова ЮА, Угарова НН. Биолюминесцентная детекция жизнеспособности клеток (обзор). Биохимия. 2015;80(6):829–44. EDN: UAAWWF; Угарова НН, Ломакина ГЮ, Перевышина ТА, Отрашевская ЕВ, Черников СВ. Контроль жизнеспособности клеток БЦЖ-вакцины в процессе ее производства методом биолюминесцентной АТФ-метрии. Вестник Московского университета. Серия 2: Химия. 2019;60(4):254–62. EDN: TVEZMT; Ou F, McGoverin C, Swift S, Vanholsbeeck F. Rapid and cost-effective evaluation of bacterial viability using fluorescence spectroscopy. Anal Bioanal Chem. 2019;411(16):3653–63. https://doi.org/10.1007/s00216-019-01848-5; Shimomura Y, Ohno R, Kawai F, Kimbara K. Method for assessment of viability and morphological changes of bacteria in the early stage of colony formation on a simulated natural environment. Appl Environ Microbiol. 2006;72(7):5037–42. https://doi.org/10.1128/AEM.00106-06; Pianetti A, Falcioni T, Bruscolini F, Sabatini L, Sisti E, Papa S. Determination of the viability of Aeromonas hydrophila in different types of water by flow cytometry, and comparison with classical methods. Appl Environ Microbiol. 2005;71(12):7948–54. https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.7948-7954.2005; Gweon E, Choi C, Kim J, Kim B, Kang H, Park T, et al. Development of a new approach to determine the potency of bacille Calmette–Guérin vaccines using flow cytometry. Osong Public Health Res Perspect. 2017;8(6):389–96. https://doi.org/10.24171/j.phrp.2017.8.6.06; Лопатина НВ, Мишанькин БН. Экспериментальная адаптация вакцинного штамма чумного микроба к процессу лиофилизации. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2018;17(3):51–6. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2018-17-3-51-56; Massicotte R, Mafu AA, Ahmad D, Deshaies F, Pichette G, Belhumeur P. Comparison between flow cytometry and traditional culture methods for efficacy assessment of six disinfectant agents against nosocomial bacterial species. Front Microbiol. 2017;8:112. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.00112; Фисун АА, Абзаева НВ, Ковалев ДА, Кузнецова ИВ, Жиров АМ, Гостищева СЕ и др. Определение количества живых микробных клеток в препарате вакцины чумной живой методом проточной цитометрии. В кн.: Материалы региональной научно-практической конференции с международным участием «Проблемы особо опасных инфекций на Северном Кавказе». Ставрополь; 2022. С. 217–8. EDN: YMVOQI; Shi L, Gunther S, Hubschmann T, Wick LY, Harms H, Muller S. Limits of propidium iodide as a cell viability indicator for environmental bacteria. Cytometry A. 2007;71(8):592–8. https://doi.org/10.1002/cyto.a.20402; Vanhauteghem D, Demeyere K, Callaert N, Boelaert A, Haesaert G, Audenaert K, et al. Flow cytometry is a powerful tool for assessment of the viability of fungal conidia in metalworking fluids. Appl Environ Microbiol. 2017;83(16):e00938-17. https://doi.org/10.1128/AEM.00938-17; Zahavy E, Rotem S, Gur D, Aloni-Grinstein R, Aftalion M, Ber R. Rapid antibiotic susceptibility determination for Yersinia pestis using flow cytometry Spectral Intensity Ratio (SIR) fluorescence analysis. J Fluoresc. 2018;28(5):1151–61. https://doi.org/10.1007/s10895-018-2279-3; Cossarizza A, Chang H-D, Radbruch A, Acs A, Adam D, Adam-Klages S, et al. Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (second edition). Eur J Immunol. 2019;49(10):1457–973. https://doi.org/10.1002/eji.201970107; https://www.biopreparations.ru/jour/article/view/469
-
4Academic Journal
المؤلفون: S. A. Kurcheva, M. M. Kurnoskina, I. V. Zharnikova, A. G. Koshkid’ko, D. V. Rusanova, A. G. Ryazanova, L. Yu. Aksenova, D. A. Kovalev, A. M. Zhirov, A. N. Kulichenko, С. А. Курчева, М. М. Курноскина, И. В. Жарникова, А. Г. Кошкидько, Д. В. Русанова, А. Г. Рязанова, Л. Ю. Аксенова, Д. А. Ковалев, А. М. Жиров, А. Н. Куличенко
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 2 (2022); 94-100 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 2 (2022); 94-100 ; 2658-719X ; 0370-1069
مصطلحات موضوعية: пероксидазный конъюгат, anthrax, antibodies, ELISA, peroxidase conjugate, сибирская язва, антитела, иФа
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1697/1303; Pilo P., Frey J. Pathogenicity, population genetics and dissemination of Bacillus anthracis. Infect. Genet. Evol. 2018; 64:115– 25. DOI:10.1016/j.meegid.2018.06.024.; Koehler T.M. Bacillus anthracis physiology and genetics. Mol. Aspects Med. 2009; 30(6):386–96. DOI:10.1016/j.mam.2009.07.004.; Chateau A., Van der Verren S.E., Remaut H., Fioravanti A. The Bacillus anthracis cell envelope: composition, physiological role, and clinical relevance. Microorganisms. 2020; 8(12):1864. DOI:10.3390/microorganisms8121864.; Pilo P., Frey J. Bacillus anthracis: molecular taxonomy, population genetics, phylogeny and patho-evolution. Infect. Genet. Evol. 2011; 11(6):1218–24. DOI:10.1016/j.meegid.2011.05.013.; Doganay M., Demiraslan H. Human anthrax as a re-emerging disease. Recent Pat. Anti-Infect. Drug Discov. 2015; 10(1):10–29. DOI:10.2174/1574891x10666150408162354.; Попова А.Ю., Куличенко А.Н., редакторы. Опыт ликвидации вспышки сибирской язвы на Ямале в 2016 году. Ижевск: Принт-2; 2017. 313 с.; Аксенова Л.Ю., Рязанова А.Г., Жданова Е.В., Цыганкова О.И., Буравцева Н.П., Еременко Е.И., Тюменцева И.С., Коготкова О.И., Зуенко А.А., Куличенко А.Н. Разработка и апробация тест-системы для обнаружения антител к возбудителю сибирской язвы непрямым методом флуоресцирующих антител. Проблемы особо опасных инфекций. 2013; 4:76–8. DOI:10.21055/0370-1069-2013-4-76-78.; Grundmann O. The current state of bioterrorist attack surveillance and preparedness in the US. Risk Manag. Healthc. Policy. 2014; 7:177–87. DOI:10.2147/RMHP.S56047.; Сысуев Е.Б., Поздняков А.М., Стрыгин А.В., Ираклионова Н .С. Основные принципы диагностики бактериальных поражений. Сибирская язва. Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2013; 7:95–6.; Marcus H., Danieli R., Epstein E., Velan B., Shafferman A., Reuveny S. Contribution of immunological memory to protective immunity conferred by a Bacillus anthracis protective antigenbased vaccine. Infect. Immun. 2004; 72(6):3471–7. DOI:10.1128/IAI.72.6.3471-3477.2004.; Reuveny S., White M.D., Adar Y.Y., Kafri Y., Altboum Z., Gozes Y., Kobiler D., Shafferman A., Velan B. Search for correlates of protective immunity conferred by anthrax vaccine. Infect. Immun. 2001; 69(5):2888–93. DOI:10.1128/IAI.69.5.2888-2893.2001.; Quinn C.P., Semenova V.A., Elie C.M., Romero-Steiner S., Greene C., Li H., Stamey K., Steward-Clark E., Schmidt D.S., Mothershed E., Pruckler J., Schwartz S., Benson R.F., Helsel L.O., Holder P.F., Johnson S.E., Kellum M., Messmer T., Thacker W.L., Besser L., Plikaytis B.D., Taylor T.H. Jr, Freeman A.E., Wallace K.J., Dull P., Sejvar J., Bruce E., Moreno R., Schuchat A., Lingappa J.R., Martin S.K., Walls J., Bronsdon M., Carlone G.M., Bajani-Ari M., Ashford D.A., Stephens D.S., Perkins B.A. Specific, sensitive, and quantitative enzyme-linked immunosorbent assay for human immunoglobulin G antibodies to anthrax toxin protective antigen. Emerg. Infect. Dis. 2002; 8(10):1103–10. DOI:10.3201/eid0810.020380.; Kingston J.J., Majumder S., Uppalapati S.R., Makam S.S., Urs R.M., Murali H.S., Batra H.V. Anthrax outbreak among cattle and its detection by extractable antigen 1 (EA1) based sandwich ELISA and immuno PCR. Indian J. Microbiol. 2015; 55:29–34. DOI:10.1007/s12088-014-0494-4.; Hassan J., Rahman M.B., Chowdhury S.M.Z.H., Rabidas S.K., Parvej M.S., Nazir K.N.H.N.H. ELISA based anthrax antibody titer in cattle induced by locally prepared anthrax vaccine originated from Sterne F-24 strain in Bangladesh. Microbes Health. 2015; 4(1):36–8. DOI:10.3329/mh.v4i1.23104.; Ghosh N., Goel A.K. Anti-protective antigen IgG enzymelinked immunosorbent assay for diagnosis of cutaneous anthrax in India. Clin. Vaccine Immunol. 2012; 19(8):1238–42. DOI:10.1128/CVI.00154-12.; Wilson M.B., Nakane P.K. Recent developments in the periodate method of conjugating horseradish peroxidase (HRPO) to antibodies. In: Knapp W., Holubar K., Wick G., editors. Immunofluorescence and Related Staining Techniques. Amsterdam: Elsevier/North-Holland Biomedical Press; 1978. P. 215–24.; Микшис Н.И., Попова П.Ю., Семакова А.П., Кудрявцева О.М., Бугоркова С.А., Кравцов А.Л. Изучение влияния антигенов, полученных из рекомбинантного штамма Bacillus anthracis 55ΔTПА-1Spo-, на органы и ткани иммунизированных животных. Биотехнология. 2017; 33(5):45–60. DOI:10.21519/0234-2758-2017-33-5-45-60.; Горобец Е.А., Афанасьев Е.Н., Тюменцева И.С., Василенко Н.Ф. Совершенствование способа получения иммунных кроличьих сибиреязвенных капсульно-соматических сывороток. Медицинский вестник Северного Кавказа. 2008; 1:42–4.; R Core Team (2020). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. [Электронный ресурс]. URL: https://www.R-project.org.; Wickham H., Averick M., Bryan J., Chang W., D’Agostino McGowan L., Francois R., Grolemund G., Hayes A., Henry L., Hester J., Kuhn M., Pedersen T.L., Miller E., Bache S.M., Muller K., Ooms J., Robinson D., Seidel D.P., Spinu V., Takahashi K., Vaughan D., Wilke C., Woo K., Yutani H. Welcome to the tidyverse. J. Open Source Softw. 2019; 4(43):1686. DOI:10.21105/joss.01686.; Sing T., Sander O., Beerenwinkel N., Lengauer T. ROCR: visualizing classifier performance in R. Bioinformatics. 2005; 21(20):3940–1. DOI:10.1093/bioinformatics/bti623.; Alboukadel Kassambara (2020). ggpubr: ‘ggplot2’ Based Publication Ready Plots. [R package version 0.4.0]. [Электронный ресурс]. URL: https://CRAN.R-project.org/package=ggpubr.; Пономаренко Д.Г., Ракитина Е.Л., Костюченко М.В., Логвиненко О.В., Рязанова А.Г., Аксенова Л.Ю., Буравцева Н.П., Тюменцева И.С., Курчева С.А., Куличенко А.Н. Применение CAST-теста для оценки у людей специфической реактивности к возбудителю сибирской язвы. Медицинская иммунология. 2020; 22(5):1017–24. DOI:10.15789/1563-0625-UCT-2058.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1697
-
5Academic Journal
المؤلفون: S. A. Kurcheva, D. A. Kovalev, D. G. Ponomarenko, Yu. V. Siritsa, M. V. Kostyuchenko, A. G. Koshkid’ko, I. V. Zharnikova, E. L. Rakitina, O. V. Logvinenko, A. M. Zhirov, C. А. Курчева, Д. А. Ковалев, Д. Г. Пономаренко, Ю. В. Сирица, М. В. Костюченко, А. Г. Кошкидько, И. В. Жарникова, Е. Л. Ракитина, О. В. Логвиненко, А. М. Жиров
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 3 (2020); 83-88 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 3 (2020); 83-88 ; 2658-719X ; 0370-1069
مصطلحات موضوعية: антигенный комплекс, Brucella spp, antigen-specific cellular tests in vitro, antigen complex, антигенспецифические клеточные тесты in vitro
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1367/1146; Byndloss M.X., Tsolis R.M. Brucella spp. virulence factors and immunity. Annual Review of Animal Biosciences. 2016; 4:111– 27. DOI:10.1146/annurev-animal-021815-111326.; Głowacka P., Żakowska D., Naylor K., Niemcewicz M., Bielawska-Drózd A. Brucella – virulence factors, pathogenesis and treatment. Polish Journal of Microbiology. 2018; 67(2):151–61. DOI:10.21307/pjm-2018-029.; Amjadi O., Rafiei A., Mardani M., Zafari P, Zarifian A. A review of the immunopathogenesis of Brucellosis. Infect. Dis. (Lond). 2019; 51(5):321–33. DOI:10.1080/23744235.2019.1568545.; Smith J.A. Brucella Lipopolysaccharide and pathogenicity: The core of the matter. Virulence. 2018; 9(1):379–82. DOI:10.1080/21505594.2017.1395544.; Avila-Calderón E.D., Flores-Romo L., Sharon W., Donis-Maturano L., Becerril-García M.A., Arreola M.G.A., Reynoso B.A., Güemes F.S., Contreras-Rodríguez A. Dendritic cells and Brucella spp. interaction: the sentinel host and the stealthy pathogen. Folia Microbiol (Praha). 2020; 65(1):1–16. DOI:10.1007/s12223-019-00691-6.; Брико Н.И., Онищенко Г.Г., Покровский В.И. Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. М.: ООО «Издательство «Медицинское информационное агентство»; 2019. Т. 1. 880 с.; Костюченко М.В., Пономаренко Д.Г., Ракитина Е.Л., Логвиненко О.В., Санникова И.В., Дейнека Д.А., Голубь О.Г. Перспектива оценки антигенреактивности лимфоцитов in vitro для диагностики острого бруцеллеза. Инфекция и иммунитет. 2017; 7(1):91–6. DOI:10.15789/2220-7619-2017-1-91-96.; Костюченко М.В., Ракитина Е.Л., Пономаренко Д.Г., Логвиненко О.В., Курчева С.А., Бердникова Т.В., Русанова Д.В., Куличенко А.Н. Изучение формирования клеточного поствакцинального иммунитета против бруцеллеза в лимфоцитарных тестах in vitro c использованием экспериментального антигенного комплекса. Медицинская иммунология. 2019; 21(3):547–54. DOI:10.15789/1563-0625-2019-3-547-554.; Пономаренко Д.Г. Новый подход к комплексной оценке иммунобиологической реактивности контингента, подлежащего вакцинации (ревакцинации) против бруцеллеза. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2015; 3:28–31.; Budak F., Bal S.H., Tezcan G., Akalın E.H., Yılmaz A., Hız P., Oral H.B. The microRNA expression signature of CD4+ T cells in the transition of brucellosis into chronicity. PLoS One. 2018; 13(6):e0198659. DOI:10.1371/journal.pone.0198659.; Starska K., Głowacka E., Kulig A., Lewy-Trenda I., Bryś M., Lewkowicz P. Prognostic value of the immunological phenomena and relationship with clinicopathological characteristics of the tumor – the expression of the early CD69+, CD71+ and the late CD25+, CD26+, HLA/DR+ activation markers on T CD4+ and CD8+ lymphocytes in squamous cell laryngeal carcinoma. Part II. J. Folia Histochem. Сytobiol. 2011; 49(4):593–603. DOI:10.5603/FHC.2011.0082.; Shipkova M., Wieland E. Surface markers of lymphocyte activation and markers of cell proliferation. Clinica Chimica Acta. 2012; 413(17–18):1338–49. DOI:10.1016/j.cca.2011.11.006.; Shevach E.M., McHugh R.S., Piccirillo C.A., Thornton A.M. Control of T-cell activation by CD4+ CD25+ suppressor T cells. Immunol. Rev. 2001; 182:58–67. DOI:10.1034/j.1600-065-x.2001.1820104.x.; Moreno-Lafont M.C., López-Santiago R., Zumarán-Cuéllar E., Paredes-Cervantes V., López-Merino A., Estrada-Aguilera A., Santos-Argumedo L. Antigen-specific activation and proliferation of CD4+ and CD8+ T lymphocytes from brucellosis patients. Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene. 2002; 96(3):340–7. DOI:10.1016/s0035-9203(02)90119-7.; Coria L.M., Ibañez A.E., Pasquevich K.A., González Cobiello P.L., Frank F.M., Giambartolomei G.H., Cassataro J. Brucella abortus Omp19 recombinant protein subcutaneously co-delivered with an antigen enhances antigen-specific T helper 1 memory responses and induces protection against parasite challenge. Vaccine. 2016; 34(4):430–7. DOI:10.1016/j.vaccine.2015.12.012.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1367
-
6Academic Journal
المؤلفون: E. I. Eremenko, A. G. Ryazanova, S. V. Pisarenko, N. P. Buravtseva, G. A. Pechkovsky, L. Yu. Aksenova, O. V. Semenova, N. G. Varfolomeeva, T. M. Golovinskaya, D. K. Chmerenko, D. A. Kovalev, A. M. Zhirov, N. A. Shapakov, A. N. Kulichenko, Е. И. Еременко, А. Г. Рязанова, С. В. Писаренко, Н. П. Буравцева, Г. А. Печковский, Л. Ю. Аксенова, О. В. Семенова, Н. Г. Варфоломеева, Т. М. Головинская, Д. К. Чмеренко, Д. А. Ковалев, А. М. Жиров, Н. А. Шапаков, А. Н. Куличенко
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 3 (2019); 43-50 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 3 (2019); 43-50 ; 2658-719X ; 0370-1069 ; 10.21055/0370-1069-2019-3
مصطلحات موضوعية: главные генетические линии, molecular typing, SNP, VNTR, indels, main genetic lineages, молекулярное типирование, инделы
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1175/1052; Keim P., Price L.B., Klevytska A.M., Smith K.L., Schupp J.M., Okinaka R., Jackson P.J., Hugh-Jones M.E. Multiple-Locus Variable-Number Tandem Repeat Analysis Reveals Genetic Relationships within Bacillus anthracis. J. Bacteriol. 2000; 182(10):2928-36. DOI:10.1128/jb.182.10.2928-2936.2000.; Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y., Okinaka R.T., Hugh-Jones M.E., Ravel J., Zanecki S.R., Pearson T., Simonson T.S, U’Ren J.M., Kachur S.M., Leadem-Dougherty R.R., Rhoton S.D., Zinser G., Farlow J., Coker P.R., Smith K.L., Wang B., Kenefic L.J., Fraser-Liggett C.M., Wagner D.M., Keim P. Global Genetic Population Structure of Bacillus anthracis. PLoS One. 2007; 2(5):e461. DOI:10.1371/journal.pone.0000461.; Gierczynski R., Jakubczak A., Jagielski M. Extended Multiple-Locus Variable Tandem-Repeat Analysis of Bacillus an¬thracis Strains Isolated in Poland. Pol. J. Microbiol. 2009; 58(1):3—7. PMID: 19469279.; Okutani A., Sekizuka T., Boldbaatar B., Yamada A., Kuroda M., Inoue S. Phylogenetic Typing of Bacillus anthracis Isolated in Japan by Multiple LocusVariable-Number Tandem Repeats and the Comprehensive Single Nucleotide Polymorphism. J. Vet. Med. Sci. 2010; 72(1):93-7. DOI:10.1292/jvms.09-0213.; Antwerpen M., Ilin D., Georgieva E., Meyer H., Savov E., Frangoulidis D. MLVA and SNP analysis identified a unique genetic cluster in Bulgarian Bacillus anthracis strains. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2011; 30(7):923-30. DOI:10.1007/s10096-011-1177-2.; Jung K.H., Kim S.H., Kim S.K., Cho S.Y., Chai J.C., Lee Y.S., Kim J.C., Kim S.J., Oh H.B., Chai Y.G. Genetic populations of Bacillus anthracis isolates from Korea. J. Vet. Sci. 2012; 13(4):385— 93. DOI:10.4142/jvs.2012.13.4.385.; Eremenko E.I., Ryazanova A.G., Tsygankova O.I., Tsygankova E.A., Buravtseva N.P., Kulitchenko A.N. Genotype Diversity of Bacillus anthracis Strains Isolated from the Caucasus Region. Mol. Genet. Microbiol. Virol. 2012; 27(2):74—8. DOI:10.3103/S0891416812020024.; Beyer W., Bellan S., Eberle G., Ganz H.H., Getz W.M., Haumacher R., Hilss K.A., Kilian W., Lazak J., Turner W. C., Turnbul P.C.B. Distribution and Molecular Evolution of Bacillus anthracis Genotypes in Namibia. PLoS Negl. Trop. Dis. 2012; 6(3):e1534. DOI:10.1371/journal.pntd.0001534.; Vergnaud G., Girault G., Thierry S., Pourcel C., Madam N., Blouin Y. Comparison of French and Worldwide Bacillus anthracis Strains Favors a Recent, Post-Columbian Origin of the Predominant North-American Clade. PLoS One. 2016; 11(2):e0146216. DOI:10.1371/journal.pone.0146216.; Derzelle S., Thierry S. Genetic Diversity of Bacillus anthracis in Europe: Genotyping Methods in Forensic and Epidemiologic Investigations. Biosecurity and Bioterrorism: Biodefense Strategy, Practice, and Science. 2013; 11(1):166-76. DOI:10.1089/bsp.2013.0003.; Aikembayev A. M., Lukhnova L., Temiraliyeva G., Meka-Mechenko T., Pazylov Y, Zakaryan S., Denissov G., Easterday W. R., Van Ert M. N.,Keim P, Francesconi S. C., Blackburn J. K., Hugh-Jones M., Hadfield T. Historical Distribution and Molecular Diversity of Bacillus anthracis, Kazakhstan. Emerg. Infect. Dis. 2010; 16(5):789-96. DOI:10.3201/eid1605.091427.; Durmaz R., Doganay M., Sahin M., Percin D., Karahocagil M.K., Kayabas U., Otlu B., Karagoz A., Buyuk F., Celebi O., Ozturk Z., Ertek M. Anthrax Study Group. Molecular epidemiology of the Bacillus anthracis isolates collected throughout Turkey from 1983 to 2011. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2012; 31(10):2783—90. DOI:10.1007/s10096-012-1628-4.; Okutani A., Tungalag H., Boldbaatar B., Yamada A., Tserennorov D., Otgonchimeg I., Erdenebat A., Otgonbaatar D., Inoue S. Molecular Epidemiological Study of Bacillus anthracis Isolated in Mongolia by Multiple-Locus Variable-Number Tandem-Repeat Analysis for 8 Loci (MLVA-8). Jpn J. Infect. Dis. 2011; 64:345—8. PMID: 21788715.; Еременко Е.И., Писаренко С.В., Аксенова Л.Ю., Рязанова А.Г., Жиров А.М., Семенова О.В., Бобрышева О.В., Ковалев Д.А., Куличенко А.Н. Филогенетика, эволюция и филогеография Bacillus anthracis. Бактериология. 2018; 3(2):57-63.; Куличенко А.Н., Еременко Е.И., Рязанова А.Г., Аксенова Л.Ю., Ковалев Д.А., Иисаренко С.В., Варфоломеева Н.Е, Жиров А.М., Волынкина А.С., Буравцева Н.И., Головинская Т.М., Котенева Е.А., Цыганкова О.И., Дятлов И.А., Тимофеев В.С., Богун А.Г., Бахтеева И.В., Кисличкина А.А., Миронова Р.И., Титарева ГМ., Скрябин Ю.И., Селянинов Ю.О., Егорова И.Ю., Колбасов Д.В. Биологические свойства и молекулярно-генетическая характеристика штаммов Bacillus anthracis, выделенных во время вспышки сибирской язвы в Ямало-Ненецком автономном округе в 2016 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2017; 1:94-9. DOI:10.21055/0370-1069-2017-1-94-99.; Pilo P., Frey J. Pathogenicity, population genetics and dissemination of Bacillus anthracis. Infect. Genet. Evol. 2018; 64:115¬25. DOI:10.1016/j.meegid.2018.06.024.; Sahl J.W., Pearson T., Okinaka R., Schupp J.M., Gillece J.D., Heaton H., Birdsell D., Hepp C., Fofanov V, Noseda R., Fasanella A., Hoffmaster A., Wagner DM., Keim P. A Bacillus anthracis genome sequence from the Sverdlovsk 1979 autopsy specimens. mBio. 2016; 7(5):e01501-16. DOI:10.1128/mBio.01501-16.; Van Ert M.N., Easterday W. R., Simonson T.S., U’Ren J.M., Pearson T., Kenefic L.J., Busch J.D., Huynh L.Y, Dukerich M., Trim C.B., Beaudry J., Welty-Bernard A., Read T., Fraser C.M., Ravel J., Keim P. Strain-Specific Single-Nucleotide Polymorphism Assays for the Bacillus anthracis Ames Strain. J. Clin. Microbiol. 2007; 45(1):47-53. DOI:10.1128/JCM.01233-06.; Beyer W., Bellan S., Eberle G., Ganz H.H., Getz W.M., Haumacher R., Hilss K.A., Kilian W., Lazak J., Turner W. C., Turnbull P.C. Distribution and Molecular Evolution of Bacillus anthracis Genotypes in Namibia. PLoS Negl. Trop. Dis. 2012; 6(3):e1534. DOI:10.1371/journal.pntd.0001534.; Thierry S., Tourterel C., Le Fleche P., Derzelle S., Dekhil N., Mendy C., Colaneri C., Vergnaud G., Madani N. Genotyping of French Bacillus anthracis strains based on 31-loci multi locus VNTR analysis: epidemiology, marker evaluation, and update of the internet genotype database. PLoS One. 2014; 9(6):e95131. DOI:10.1371/journal.pone.0095131.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1175
-
7Academic Journal
المؤلفون: I. V. Kuznetsova, D. A. Kovalev, Yu. M. Evchenko, L. I. Shakirova, N. M. Shvetsova, D. G. Ponomarenko, S. V. Pisarenko, A. M. Zhirov, A. A. Lukina, A. N. Kulichenko, И. В. Кузнецова, Д. А. Ковалев, Ю. М. Евченко, Л. И. Шакирова, Н. М. Швецова, Д. Г. Пономаренко, С. В. Писаренко, А. М. Жиров, А. А. Лукина, А. Н. Куличенко
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 3 (2017); 58-62 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 3 (2017); 58-62 ; 2658-719X ; 0370-1069 ; 10.21055/0370-1069-2017-3
مصطلحات موضوعية: филогенетический анализ, multilocus VNTR-analysis, phylogenetic analysis, мультилокусный анализ числа вариабельных тандемных повторов
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/413/411; Анализ эпидемиологической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2015 году и прогноз на 2016 год. http://www.snipchi.ru/updoc/obzor-epid.-situatsii-po-brutsellezu-v-rf-v-2015.pdf (дата обращения 01.06.16 г.).; Лямкин Г.И., Таран И.Ф., Щедрин В.И. Современные представления о бруцеллезе как природно-очаговом заболевании. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 1995; 2:115–8.; Савилов Е.Д., Мамонтова Л.М., Астафьев В.А., Жданова С.Н. Применение статистических методов в эпидемиологиче- ском анализе. М.: МЕДпресс-информ; 2004. 112 с.; Таран И.Ф. Бруцеллезная инфекция с позиции природно-очагового заболевания. Эпидемиология и профилактика особо опасных инфекций в МНР и СССР. Улан-Батор; 1978. С. 193–4.; Le Flèche P., Jacques I., Grayon M., Al Dahouk S., Bouchon P., Denoeud F., Nöckler K., Neubauer H., Guilloteau L., Vergnaud G. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6(9):1–14. DOI:10.1186/1471-2180-6-9.; Jiang H., Wang H., Xu L., Hu G., Ma J., Xiao P., Fan W., Di D., Tian G., Fan M., Mi J., Yu R., Song L., Zhao H., Piao D., Cui B. MLVA Genotyping of Brucella melitensis and Brucella abortus Isolates from Different Animal Species and Humans and Identification of Brucella suis Vaccine Strain S2 from Cattle in China. PLOS ONE. 2013; 8(10):76332. DOI:10.1371/journal.pone.0076332.; Ma J., Wang H., Zhang Х., Xu L., Hu G., Jiang H., Zhao F., Zhao H., Piao D., QinY., Cui B., Lin G. MLVA and MLST typing of Brucella from Qinghai, China. Infect. Dis. Poverty. 2016; 5(26):1–9. DOI:10.1186/s40249-016-0123-z.; Massis F., Ancora M., Atzeni M., Rolesu S., Bandino E., Danzetta M., Zilli K., Giannatale E., Scacchia M. MLVA as an Epidemiological Tool To Trace Back Brucella melitensis Biovar 1 Re-Emergence in Italy. Transbound. Emerg. Dis. 2015; 62(5):463–9. DOI:10.1111/tbed.12397.; MLVA bank for Microbes Genotyping. (Cited 01 Jun 2016). Available from: http://mlva.u-psud.fr.; START version 2. (Cited 01 Jun 2016). Available from: http://pubmlst.org/software/analysis/start2/.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/413
-
8Academic Journal
المؤلفون: A. N. Kulichenko, E. I. Eremenko, A. G. Ryazanova, L. Yu. Aksenova, D. A. Kovalev, S. V. Pisarenko, N. G. Varfolomeeva, A. M. Zhirov, А. S. Volynkina, N. P. Buravtseva, T. M. Golovinskaya, E. A. Koteneva, O. I. Tsygankova, I. A. Dyatlov, V. S. Timofeev, A. G. Bogun, I. V. Bakhteeva, A. A. Kislichkina, R. I. Mironova, G. M. Titareva, Yu. P. Skryabin, Yu. O. Selyaninov, I. Yu. Egorova, D. V. Kolbasov, А. Н. Куличенко, Е. И. Еременко, А. Г. Рязанова, Л. Ю. Аксенова, Д. А. Ковалев, С. В. Писаренко, Н. Г. Варфоломеева, А. М. Жиров, А. С. Волынкина, Н. П. Буравцева, Т. М. Головинская, Е. А. Котенева, О. И. Цыганкова, И. А. Дятлов, В. С. Тимофеев, А. Г. Богун, И. В. Бахтеева, А. А. Кисличкина, Р. И. Миронова, Г. М. Титарева, Ю. П. Скрябин, Ю. О, Селянинов, И. Ю. Егорова, Д. В. Колбасов
المصدر: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 1 (2017); 94-99 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 1 (2017); 94-99 ; 2658-719X ; 0370-1069 ; 10.21055/0370-1069-2017-1
مصطلحات موضوعية: генетическое типирование, Bacillus anthracis strains, phenotypic properties, genotyping, штаммы Bacillus anthracis, фенотипические свойства
وصف الملف: application/pdf
Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/377/374; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/377/899; Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y., Okinaka R.T., Hugh-Jones M.E., Ravel J., Zanecki1 S. R., Pearson T., Simonson S.T, U'Ren J.M., Kachur S.M., Leadem-Dougherty R.R., Rhoton S.D., Zinser G., Farlow J., Coker P.R., Smith K.L., Wang B., Kenefic L.J., Fraser-Liggett C.M., Wagner D.M., Keim P. Global Genetic Population Structure of Bacillus anthracis. PLoSONE. 2007; 2(5):e461. DOI:10.1371/journal.pone.0000461.; Lista F., Faggioni G., Valjevac S., Ciammaruconi A.,Vaissaire J., Doujet C., Olivier G., De Santis R., Carattoli A., Ciervo A., Fasanella A., Orsini F., D’Amelio R., Pourcel C., Cassone A., Vergnaud G. Genotyping of Bacillus anthracis strains based on Automated capillary 25-loci Multiple Locus Variable-Number Tandem Repeats Analysis. BMC Microbiol. 2006; 6:33. DOI:10.1186/1471-2180-6-33.; Kenefic L.J., Beaudry J., Trim C., Huynh L., Zanecki S., Matthews M., Schupp J., Van Ert M., Keim P. A high resolution four-locus multiplex single nucleotide repeat (SNR) genotyping system in Bacillus anthracis. J. Microbiol. Methods. 2008; 73(3):269-72. DOI:10.1016/j.mimet.2007.11.014.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/377